基因页:ITGB1
概括?
基因 | 3688 |
Symbol | ITGB1 |
Synonyms | CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB |
Description | integrin subunit beta 1 |
Reference | MIM:135630|HGNC:HGNC:6153|Ensembl:ENSG00000150093|HPRD:00628|Vega:OTTHUMG00000017928 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10p11.2 |
Pascal p-value | 0.06 |
Sherlock P值 | 0.624 |
胎儿β | 0.98 |
主持人 | 尾状基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | Method of gene set | Description | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
CV:PGCnp | 全基因组协会研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 1 | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0109 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ITGB1_DE_GTEx.png)
Gene expression during devlopment (BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004872 | receptor activity | IEA | - | |
GO:0005178 | integrin binding | IEA | - | |
去:0005488 | binding | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
GO:0042802 | 相同的蛋白质结合 | IPI | 14681217 | |
GO:0046982 | 蛋白质异二聚化活性 | nas | 9552005 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000082 | G1/s有丝分裂细胞周期的过渡 | IEA | - | |
去:0001701 | 在子宫胚胎开发中 | IEA | - | |
GO:0007160 | cell-matrix adhesion | IEA | - | |
GO:0007155 | 细胞粘附 | IEA | - | |
GO:0007156 | 同粒细胞粘附 | 塔斯 | 10201960 | |
去:0007229 | integrin-mediated signaling pathway | IEA | - | |
去:0006968 | 蜂窝防御反应 | 塔斯 | 10201960 | |
GO:0008284 | 细胞增殖的阳性调节 | IEA | - | |
去:0010002 | cardioblast differentiation | IEA | - | |
GO:0007159 | 白细胞粘附 | 艾达 | 1715889 | |
GO:0016477 | cell migration | 塔斯 | 11919189 | |
GO:0042685 | 心脏母细胞命运规格 | IEA | - | |
GO:0030183 | B细胞分化 | 我知道了 | 1715889 | |
GO:0044419 | 生物之间的种间相互作用 | IEA | - | |
GO:0045596 | 细胞分化的负调控 | IEA | - | |
GO:0045214 | sarcomere organization | IEA | - | |
GO:0051726 | 细胞周期调节 | IEA | - | |
Cellular component | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0031594 | 神经肌肉接头 | 艾达 | neuron, axon, Synap, Neurotransmitter (GO term level: 3) | 9415431 |
GO:0031594 | 神经肌肉接头 | IEA | neuron, axon, Synap, Neurotransmitter (GO term level: 3) | - |
GO:0019717 | 突触体 | IEA | Synap, Brain (GO term level: 7) | - |
去:0001726 | ruffle | 塔斯 | 11919189 | |
去:0005783 | 内质网 | 艾达 | 11256614 | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0009986 | cell surface | 艾达 | 1715889 | |
去:0008305 | 整联蛋白复合物 | IEA | - | |
去:0008305 | 整联蛋白复合物 | nas | 9552005 | |
GO:0042383 | 肌膜 | 艾达 | 9415431 | |
GO:0042383 | 肌膜 | IEA | - | |
GO:0042470 | 黑色素体 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
国际米兰actors | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ACTN1 | FLJ40884 | 肌动蛋白,alpha 1 | 重构的复合物 | Biogrid | 2116421 |
ACTN4 | 肌动蛋白4 |DKFZP686K23158 |FSGS |FSGS1 | 肌动蛋白,α4 | - | HPRD | 2116421 |
arhgap5 | GFI2 | RhoGAP5 | p190-B | Rho GTPase激活蛋白5 | - | HPRD | 8537347 |
canx | CNX | FLJ26570 | IP90 | P90 | calnexin | - | HPRD,Biogrid | 8163531 |
CD151 | GP27 |MER2 |PETA-3 |raph |sfa1 |TSPAN24 | CD151molecule (Raph blood group) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12175627 |
CD36 | CHDS7 |脂肪|gp3b |GP4 |GPIV |帕西夫|Scarb3 | CD36分子(血小板传播受体) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11238109 |
CD46 | MCP | MGC26544 | MIC10 | TLX | TRA2.10 | CD46分子,补体调节蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 10741407 |
CD47 | IAP |mer6 |OA3 | CD47分子 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10397731 |
CD63 | LAMP-3 | ME491 | MLA1 | OMA81H | TSPAN30 | CD63分子 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12175627 |
CD81 | S5.7 |TAPA1 |TSPAN28 | CD81分子 | - | HPRD,Biogrid | 10229664 |
CD82 | 4f9 |C33 |Gr15 |IA4 |kai1 |R2 |SAR2 |ST6 |TSPAN27 | CD82分子 | - | HPRD | 8757325 |
CD9 | 5H9 |BA2 |BTCC-1 |DARAP-27 |Gig2 |MIC3 |MRP-1 |p24 |TSPAN29 | CD9分子 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 8630057|12175627 |
Col1a1 | OI4 | collagen, type I, alpha 1 | 共纯化 | Biogrid | 2156854 |
FBXO2 | FBG1 | FBX2 | Fbs1 | NFB42 | F-box protein 2 | - | HPRD,Biogrid | 12140560 |
FHL2 | AAG11 |Dral |Slim3 | four and a half LIM domains 2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 10906324 |
flna | ABP-280 | ABPX | DKFZp434P031 | FLN | FLN1 | FMD | MNS | NHBP | OPD | OPD1 | OPD2 | Filamin A,α(肌动蛋白结合蛋白280) | - | HPRD,Biogrid | 9722563|11807098 |
flnb | ABP-278 | AOI | DKFZp686A1668 | DKFZp686O033 | FH1 | FLN1L | LRS1 | SCT | TABP | TAP | Filamin B,β(肌动蛋白结合蛋白278) | - | HPRD,Biogrid | 11807098 |
FLT4 | flt41 |lmph1a |pcl |VEGFR3 | 与FMS相关的酪氨酸激酶4 | - | HPRD,Biogrid | 11553610 |
GNB2L1 | GNB2-RS1 |H12.3 |HLC-7 |PIG21 |机架1 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 | beta-1 integrin interacts with RACK1. | 绑定 | 11884618 |
GNB2L1 | GNB2-RS1 |H12.3 |HLC-7 |PIG21 |机架1 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 | - | HPRD,Biogrid | 9442085 |
GNB2L1 | GNB2-RS1 |H12.3 |HLC-7 |PIG21 |机架1 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 | 整合素-Beta-1的未指定同工型与RACK1相互作用。 | 绑定 | 15611085 |
HSPG2 | PLC | PRCAN | SJA | SJS | SJS1 | heparan sulfate proteoglycan 2 | - | HPRD | 9431988 |
ICAM4 | CD242 |LW | 细胞间粘附分子4(Landsteiner-Wiener血型) | - | HPRD | 11435317 |
IGF1R | CD221 |igfir |JTK13 |MGC142170 |MGC142172 |MGC18216 | 胰岛素样生长因子1受体 | β-1整合素与IGF-IR相互作用。 | 绑定 | 11884618 |
伊尔克 | DKFZP686F1765 |P59 | 整联蛋白连接激酶 | 整联蛋白-BETA-1与ILK相互作用。 | 绑定 | 8538749 |
伊尔克 | DKFZP686F1765 |P59 | 整联蛋白连接激酶 | - | HPRD,Biogrid | 8538749|9736715 |
itga1 | CD49a | VLA1 | integrin, alpha 1 | - | HPRD | 8428973 |
itga1 | CD49a | VLA1 | integrin, alpha 1 | VLA1-Alpha1与VLA1-BETA相互作用。 | 绑定 | 1690718|1693624 |3546305 |
itga10 | PRO827 | 整合素,alpha 10 | - | HPRD,Biogrid | 9685391 |
itga11 | HsT18964 | 整合素,alpha 11 | 整联蛋白-Alpha11与整合素-Beta1相互作用。 | 绑定 | 10464311 |
itga11 | HsT18964 | 整合素,alpha 11 | - | HPRD | 10486209 |
itga2 | br |CD49B |GPIA |VLA-2 |vlaa2 | 整合素,α2(CD49B,alpha 2 vla-2受体的亚基) | VLA2-Alpha2与VLA2-beta相互作用。 | 绑定 | 1690718|1693624 |3546305 |
itga3 | CD49C | FLJ34631 | FLJ34704 | GAP-B3 | GAPB3 | MSK18 | VCA-2 | VL3A | VLA3a | 整合素,α3(抗原CD49C,alpha 3的VLA-3受体亚基) | vla3-alpha3与vla3-beta相互作用. | 绑定 | 1690718|1693624 |3546305 |
itga3 | CD49C | FLJ34631 | FLJ34704 | GAP-B3 | GAPB3 | MSK18 | VCA-2 | VL3A | VLA3a | 整合素,α3(抗原CD49C,alpha 3的VLA-3受体亚基) | vla3-alpha3与vla3-beta相互作用 | 绑定 | 3546305 |
itga3 | CD49C | FLJ34631 | FLJ34704 | GAP-B3 | GAPB3 | MSK18 | VCA-2 | VL3A | VLA3a | 整合素,α3(抗原CD49C,alpha 3的VLA-3受体亚基) | - | HPRD,Biogrid | 15254262 |
itga4 | CD49D |IA4 |MGC90518 | integrin, alpha 4 (antigen CD49D, alpha 4 subunit of VLA-4 receptor) | VLA4-Alpha4与VLA4-BETA相互作用。 | 绑定 | 1693624|3546305 |
itga5 | CD49E |fnra |VLA5A | 整合素,α5(纤连蛋白受体,α多肽) | VLA5-Alpha5与VLA5-BETA相互作用。 | 绑定 | 1690718|1693624 |3546305 |
itga6 | CD49f | DKFZp686J01244 | FLJ18737 | ITGA6B | VLA-6 | integrin, alpha 6 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9660880 |
itga6 | CD49f | DKFZp686J01244 | FLJ18737 | ITGA6B | VLA-6 | integrin, alpha 6 | - | HPRD | 9425259 |
itga6 | CD49f | DKFZp686J01244 | FLJ18737 | ITGA6B | VLA-6 | integrin, alpha 6 | VLA6-Alpha6与VLA-BETA1相互作用。 | 绑定 | 1690718|1693624 |2138612|2649503 |2967289 |
itga8 | - | integrin, alpha 8 | - | HPRD,Biogrid | 7768999 |
itga8 | - | integrin, alpha 8 | 整联蛋白-Alpha8与整联蛋白-BETA1相互作用。 | 绑定 | 7559467 |
itga9 | ALPHA-RLC | ITGA4L | RLC | integrin, alpha 9 | 整联蛋白-Alpha9与整合素-Beta1相互作用。 | 绑定 | 8798654 |
itga9 | ALPHA-RLC | ITGA4L | RLC | integrin, alpha 9 | - | HPRD,Biogrid | 8245132 | 11462216 |
itgav | CD51 | DKFZp686A08142 | MSK8 | VNRA | 整联蛋白,αV(玻璃原蛋白受体,α多肽,抗原CD51) | 整联蛋白-Alphav与整合素-Beta1相互作用 | 绑定 | 1690718|2138612 |
ITGB1BP1 | DKFZp686K08158 | ICAP-1A | ICAP-1B | ICAP-1alpha | ICAP1 | ICAP1A | ICAP1B | 整合素β1结合蛋白1 | - | HPRD,Biogrid | 9281591|11741908 |
ITGB1BP2 | CHORDC3 | ITGB1BP | MELUSIN | MGC119214 | MSTP015 | 整联蛋白β1结合蛋白(MELUSIN)2 | - | HPRD | 12514714 |
ITGB1BP3 | MGC126624 |MIBP |NRK2 | 整合素β1结合蛋白3 | - | HPRD | 10613898 |
ITGB5 | FLJ26658 | 整合素,beta 5 | - | HPRD | 11462216 |
喇嘛1 | 喇嘛 | laminin, alpha 1 | - | HPRD,Biogrid | 9688542 |
LGALS3BP | 90k |BTBD17B |Mac-2-bp | 凝集素,半乳糖苷结合,可溶性,3结合蛋白 | - | HPRD | 9501082 |
LGALS8 | GAL-8 |PCTA-1 |pcta1 |PO66-CBP | 凝集素,半乳糖苷结合,可溶性,8 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 10852818 |
MAP4K4 | FLH21957 |FLJ10410 |FLJ20373 |FLJ90111 |HGK |KIAA0687 |尼克 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶激酶4 | - | HPRD,Biogrid | 11967148 |
myo10 | FLJ10639 |FLJ21066 |FLJ22268 |FLJ43256 |KIAA0799 |MGC131988 | 肌球蛋白X | 整合素-beta-1与MyO10相互作用。这种相互作用是建立在人类整联蛋白-beta-1和牛Myo10之间的相互作用的模型。 | 绑定 | 15156152 |
NME1 | AWD |GAAD |NB |NBS |NDPK-A |ndpka |NM23 |NM23-H1 | 非转移细胞1,蛋白质(NM23A)在 | - | HPRD,Biogrid | 11919189 |
prkca | AAG6 |MGC129900 |MGC129901 |PKC-Alpha |PKCA |Prkaca | protein kinase C, alpha | - | HPRD,Biogrid | 12138200 |
PTK2 | FADK | FAK | FAK1 | pp125FAK | PTK2protein tyrosine kinase 2 | - | HPRD | 8649427 |
PXN | FLJ16691 | paxillin | - | HPRD,Biogrid | 7657702|10804218 |
RAB8B | FLJ38125 | Rab8b,Ras Oncogene家族成员 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12639940 |
SLC3A2 | 4F2 | 4F2HC | 4T2HC | CD98 | CD98HC | MDU1 | NACAE | 溶质载体家族3(Dibasic和中性氨基酸转运的激活剂),成员2 | - | HPRD,Biogrid | 12181350 |
tgoln2 | MGC14722 |TGN38 |TGN46 |TGN48 |TGN51 |TTGN2 | trans-golgi network protein 2 | - | HPRD,Biogrid | 11208159 |
THBS1 | thbs |TSP |TSP1 | thrombospondin 1 | - | HPRD | 11980922 |
TLN1 | ilweq |KIAA1027 |TLN | talin 1 | - | HPRD,Biogrid | 11279249 |
TSPAN4 | nag-2 |nag2 |四翼|TM4SF7 |TSPAN-4 | 四翼烷蛋白4 | - | HPRD,Biogrid | 9360996|10734060 |
VCAM1 | CD106 |DKFZP779G2333 |Incam-100 |MGC99561 | vascular cell adhesion molecule 1 | - | HPRD | 12097820 |
VCAN | CSPG2 |DKFZP686K06110 |Ervr |PG-M |WGN |WGN1 | versican | - | HPRD,Biogrid | 11805102 |
ywhab | GW128 |HS1 |KCIP-1 | 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,β多肽 | - | HPRD,Biogrid | 11313964 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | # SZGR 2.0 genes in pathway | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG轴突指导 | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg焦点粘附 | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG ECM RECEPTOR INTERACTION | 84 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG细胞粘附分子凸轮 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg白细胞跨内皮迁移 | 118 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG REGULATION OF ACTIN CYTOSKELETON | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG PATHOGENIC ESCHERICHIA COLI INFECTION | 59 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Leishmania感染 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小细胞肺癌 | 84 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG HYPERTROPHIC CARDIOMYOPATHY HCM | 85 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG心律失常右心肌病ARVC | 76 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG扩张心肌病 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Lym途径 | 11 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA AGR PATHWAY | 36 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta SPPA途径 | 22 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta bcellsurvival途径 | 16 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Lair Pathway | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA EPHA4 PATHWAY | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta ECM途径 | 24 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta ERK途径 | 28 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA INTEGRIN PATHWAY | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta McAlpain途径 | 25 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta单核细胞途径 | 11 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA PTEN PATHWAY | 18 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta nkcells途径 | 20 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA MET PATHWAY | 37 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta TFF途径 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Ucalpain途径 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PRL信号事件途径 | 23 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid rhoa途径 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Integin1途径 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID整合素CS途径 | 26 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ARF6贩运途径 | 49 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID REELIN PATHWAY | 29 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TCPTP途径 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID血管生成素受体途径 | 50 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID整合素A9B1途径 | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CXCR4 PATHWAY | 102 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Syndecan 4途径 | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid upa upar途径 | 42 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID A6B1 A6B4整合素途径 | 46 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Syndecan 2途径 | 33 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid myc抑制道路 | 63 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID LYMPH ANGIOGENESIS PATHWAY | 25 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID INTEGRIN A4B1 PATHWAY | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID FAK PATHWAY | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME CELL CELL COMMUNICATION | 120 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME IMMUNOREGULATORY INTERACTIONS BETWEEN A LYMPHOID AND A NON LYMPHOID CELL | 70 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组细胞表面相互作用在血管壁 | 91 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME PLATELET ADHESION TO EXPOSED COLLAGEN | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Basigin相互作用 | 30 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome整合素细胞表面相互作用 | 79 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome其他闪光素相互作用 | 15 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Smaphorin相互作用 | 68 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组细胞外基质相互作用 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞连接组织 | 78 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome L1CAM相互作用 | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME SIGNAL TRANSDUCTION BY L1 | 34 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME IMMUNE SYSTEM | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
渡边直肠癌放射疗法反应性DN | 92 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过CD40 UP的Hollmann凋亡 | 201 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS BASAL DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AKL HTLV1感染DN | 68 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1靶向 | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1和HDAC2靶向 | 238 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC2靶向 | 114 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SENESE HDAC3 TARGETS UP | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED UP | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
悍马皮肤癌进展 | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TP73和TP63的Sasaki目标 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUYTTEN EZH2 TARGETS DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘乳腺癌 | 30 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GUENTHER GROWTH SPHERICAL VS ADHERENT DN | 26 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gotzmann上皮到间充质过渡 | 69 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HE PTEN TARGETS UP | 16 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 | 182 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 | 151 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FLECHNER PBL KIDNEY TRANSPLANT REJECTED VS OK DN | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MATSUDA NATURAL KILLER DIFFERENTIATION | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IGLESIAS E2F TARGETS UP | 151 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周TNF信号4小时 | 54 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RAMALHO STEMNESS UP | 206 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21 TARGETS 2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamazaki TCEB3靶向 | 175 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHANG PROLIFERATING VS QUIESCENT | 51 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gerhold脂肪形成DN | 64 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
大脑衰老 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hendricks Smarca4靶向DN | 53 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C7的反应 | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durchdewald皮肤致癌DN | 264 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群T4 | 94 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KYNG DNA DAMAGE BY 4NQO OR UV | 63 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽玛辐射2G后的生存率不佳 | 171 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LABBE TGFB1 TARGETS UP | 102 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 | 111 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
QI PLASMACYTOMA UP | 259 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAUCH HEDGEHOG SIGNALING PARACRINE DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GOLDRATH ANTIGEN RESPONSE | 346 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mellman Tut1靶向DN | 47 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI PSEUDOPODIA HAPTOTAXIS DN | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIU VAV3 PROSTATE CARCINOGENESIS DN | 17 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KAPOSI LIVER CANCER MET UP | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dang myc针对DN | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GREGORY SYNTHETIC LETHAL WITH IMATINIB | 145 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KANG AR目标DN | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasini suz12靶向DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KOINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2的611CTF同工型的PEDERSEN目标 | 76 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Abdelmohsen Elavl4目标 | 16 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
山乳房干细胞DN | 146 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 | 275 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Section VI. microRNA annotation
miRNA family | Target position | miRNA ID | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-124/506 | 1095 | 1101 | M8 | hsa-miR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124brain | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
hsa-miR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga | ||||
HSA-MIR-124brain | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-134 | 52 | 58 | 1A | HSA-MIR-134brain | ugugacuggugaccagaggg |
mir-183 | 623 | 629 | M8 | HSA-MIR-183 | UAUGGCACUGGUAGAAUUCACUG |
mir-223 | 183 | 189 | 1A | HSA-MIR-223 | ugucuuugucaauacccc |
mir-29 | 830 | 836 | M8 | HSA-MIR-29ASZ | UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU |
HSA-MIR-29BSZ | UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU | ||||
HSA-MIR-29CSZ | UAGCACCAUUUGAAAUCGGU | ||||
mir-320 | 608 | 614 | 1A | hsa-miR-320 | aaaagcugggugagaggggcgaa |
miR-493-5p | 115 | 122 | 1A,M8 | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |