概括
基因 3688
Symbol ITGB1
Synonyms CD29|FNRB|GPIIA|MDF2|MSK12|VLA-BETA|VLAB
Description integrin subunit beta 1
Reference MIM:135630|HGNC:HGNC:6153|Ensembl:ENSG00000150093|HPRD:00628|Vega:OTTHUMG00000017928
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10p11.2
Pascal p-value 0.06
Sherlock P值 0.624
胎儿β 0.98
主持人 尾状基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 Method of gene set Description 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
CV:PGCnp 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 Hits with neuro-related keywords: 1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0109

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004872 receptor activity IEA -
GO:0005178 integrin binding IEA -
去:0005488 binding IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
GO:0042802 相同的蛋白质结合 IPI 14681217
GO:0046982 蛋白质异二聚化活性 nas 9552005
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000082 G1/s有丝分裂细胞周期的过渡 IEA -
去:0001701 在子宫胚胎开发中 IEA -
GO:0007160 cell-matrix adhesion IEA -
GO:0007155 细胞粘附 IEA -
GO:0007156 同粒细胞粘附 塔斯 10201960
去:0007229 integrin-mediated signaling pathway IEA -
去:0006968 蜂窝防御反应 塔斯 10201960
GO:0008284 细胞增殖的阳性调节 IEA -
去:0010002 cardioblast differentiation IEA -
GO:0007159 白细胞粘附 艾达 1715889
GO:0016477 cell migration 塔斯 11919189
GO:0042685 心脏母细胞命运规格 IEA -
GO:0030183 B细胞分化 我知道了 1715889
GO:0044419 生物之间的种间相互作用 IEA -
GO:0045596 细胞分化的负调控 IEA -
GO:0045214 sarcomere organization IEA -
GO:0051726 细胞周期调节 IEA -
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0031594 神经肌肉接头 艾达 neuron, axon, Synap, Neurotransmitter (GO term level: 3) 9415431
GO:0031594 神经肌肉接头 IEA neuron, axon, Synap, Neurotransmitter (GO term level: 3) -
GO:0019717 突触体 IEA Synap, Brain (GO term level: 7) -
去:0001726 ruffle 塔斯 11919189
去:0005783 内质网 艾达 11256614
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0009986 cell surface 艾达 1715889
去:0008305 整联蛋白复合物 IEA -
去:0008305 整联蛋白复合物 nas 9552005
GO:0042383 肌膜 艾达 9415431
GO:0042383 肌膜 IEA -
GO:0042470 黑色素体 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

国际米兰actors 别名b 官方全名b 实验 Source PubMed ID
ACTN1 FLJ40884 肌动蛋白,alpha 1 重构的复合物 Biogrid 2116421
ACTN4 肌动蛋白4 |DKFZP686K23158 |FSGS |FSGS1 肌动蛋白,α4 - HPRD 2116421
arhgap5 GFI2 | RhoGAP5 | p190-B Rho GTPase激活蛋白5 - HPRD 8537347
canx CNX | FLJ26570 | IP90 | P90 calnexin - HPRD,Biogrid 8163531
CD151 GP27 |MER2 |PETA-3 |raph |sfa1 |TSPAN24 CD151molecule (Raph blood group) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12175627
CD36 CHDS7 |脂肪|gp3b |GP4 |GPIV |帕西夫|Scarb3 CD36分子(血小板传播受体) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11238109
CD46 MCP | MGC26544 | MIC10 | TLX | TRA2.10 CD46分子,补体调节蛋白 - HPRD,Biogrid 10741407
CD47 IAP |mer6 |OA3 CD47分子 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 10397731
CD63 LAMP-3 | ME491 | MLA1 | OMA81H | TSPAN30 CD63分子 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12175627
CD81 S5.7 |TAPA1 |TSPAN28 CD81分子 - HPRD,Biogrid 10229664
CD82 4f9 |C33 |Gr15 |IA4 |kai1 |R2 |SAR2 |ST6 |TSPAN27 CD82分子 - HPRD 8757325
CD9 5H9 |BA2 |BTCC-1 |DARAP-27 |Gig2 |MIC3 |MRP-1 |p24 |TSPAN29 CD9分子 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 8630057|12175627
Col1a1 OI4 collagen, type I, alpha 1 共纯化 Biogrid 2156854
FBXO2 FBG1 | FBX2 | Fbs1 | NFB42 F-box protein 2 - HPRD,Biogrid 12140560
FHL2 AAG11 |Dral |Slim3 four and a half LIM domains 2 亲和力捕获 - 韦斯特恩
两个杂交
Biogrid 10906324
flna ABP-280 | ABPX | DKFZp434P031 | FLN | FLN1 | FMD | MNS | NHBP | OPD | OPD1 | OPD2 Filamin A,α(肌动蛋白结合蛋白280) - HPRD,Biogrid 9722563|11807098
flnb ABP-278 | AOI | DKFZp686A1668 | DKFZp686O033 | FH1 | FLN1L | LRS1 | SCT | TABP | TAP Filamin B,β(肌动蛋白结合蛋白278) - HPRD,Biogrid 11807098
FLT4 flt41 |lmph1a |pcl |VEGFR3 与FMS相关的酪氨酸激酶4 - HPRD,Biogrid 115536​​10
GNB2L1 GNB2-RS1 |H12.3 |HLC-7 |PIG21 |机架1 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 beta-1 integrin interacts with RACK1. 绑定 11884618
GNB2L1 GNB2-RS1 |H12.3 |HLC-7 |PIG21 |机架1 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 - HPRD,Biogrid 9442085
GNB2L1 GNB2-RS1 |H12.3 |HLC-7 |PIG21 |机架1 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 整合素-Beta-1的未指定同工型与RACK1相互作用。 绑定 15611085
HSPG2 PLC | PRCAN | SJA | SJS | SJS1 heparan sulfate proteoglycan 2 - HPRD 9431988
ICAM4 CD242 |LW 细胞间粘附分子4(Landsteiner-Wiener血型) - HPRD 11435317
IGF1R CD221 |igfir |JTK13 |MGC142170 |MGC142172 |MGC18216 胰岛素样生长因子1受体 β-1整合素与IGF-IR相互作用。 绑定 11884618
伊尔克 DKFZP686F1765 |P59 整联蛋白连接激酶 整联蛋白-BETA-1与ILK相互作用。 绑定 8538749
伊尔克 DKFZP686F1765 |P59 整联蛋白连接激酶 - HPRD,Biogrid 8538749|9736715
itga1 CD49a | VLA1 integrin, alpha 1 - HPRD 8428973
itga1 CD49a | VLA1 integrin, alpha 1 VLA1-Alpha1与VLA1-BETA相互作用。 绑定 1690718|1693624
|3546305
itga10 PRO827 整合素,alpha 10 - HPRD,Biogrid 9685391
itga11 HsT18964 整合素,alpha 11 整联蛋白-Alpha11与整合素-Beta1相互作用。 绑定 10464311
itga11 HsT18964 整合素,alpha 11 - HPRD 10486209
itga2 br |CD49B |GPIA |VLA-2 |vlaa2 整合素,α2(CD49B,alpha 2 vla-2受体的亚基) VLA2-Alpha2与VLA2-beta相互作用。 绑定 1690718|1693624
|3546305
itga3 CD49C | FLJ34631 | FLJ34704 | GAP-B3 | GAPB3 | MSK18 | VCA-2 | VL3A | VLA3a 整合素,α3(抗原CD49C,alpha 3的VLA-3受体亚基) vla3-alpha3与vla3-beta相互作用. 绑定 1690718|1693624
|3546305
itga3 CD49C | FLJ34631 | FLJ34704 | GAP-B3 | GAPB3 | MSK18 | VCA-2 | VL3A | VLA3a 整合素,α3(抗原CD49C,alpha 3的VLA-3受体亚基) vla3-alpha3与vla3-beta相互作用 绑定 3546305
itga3 CD49C | FLJ34631 | FLJ34704 | GAP-B3 | GAPB3 | MSK18 | VCA-2 | VL3A | VLA3a 整合素,α3(抗原CD49C,alpha 3的VLA-3受体亚基) - HPRD,Biogrid 15254262
itga4 CD49D |IA4 |MGC90518 integrin, alpha 4 (antigen CD49D, alpha 4 subunit of VLA-4 receptor) VLA4-Alpha4与VLA4-BETA相互作用。 绑定 1693624|3546305
itga5 CD49E |fnra |VLA5A 整合素,α5(纤连蛋白受体,α多肽) VLA5-Alpha5与VLA5-BETA相互作用。 绑定 1690718|1693624
|3546305
itga6 CD49f | DKFZp686J01244 | FLJ18737 | ITGA6B | VLA-6 integrin, alpha 6 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 9660880
itga6 CD49f | DKFZp686J01244 | FLJ18737 | ITGA6B | VLA-6 integrin, alpha 6 - HPRD 9425259
itga6 CD49f | DKFZp686J01244 | FLJ18737 | ITGA6B | VLA-6 integrin, alpha 6 VLA6-Alpha6与VLA-BETA1相互作用。 绑定 1690718|1693624
|2138612|2649503
|2967289
itga8 - integrin, alpha 8 - HPRD,Biogrid 7768999
itga8 - integrin, alpha 8 整联蛋白-Alpha8与整联蛋白-BETA1相互作用。 绑定 7559467
itga9 ALPHA-RLC | ITGA4L | RLC integrin, alpha 9 整联蛋白-Alpha9与整合素-Beta1相互作用。 绑定 8798654
itga9 ALPHA-RLC | ITGA4L | RLC integrin, alpha 9 - HPRD,Biogrid 8245132 | 11462216
itgav CD51 | DKFZp686A08142 | MSK8 | VNRA 整联蛋白,αV(玻璃原蛋白受体,α多肽,抗原CD51) 整联蛋白-Alphav与整合素-Beta1相互作用 绑定 1690718|2138612
ITGB1BP1 DKFZp686K08158 | ICAP-1A | ICAP-1B | ICAP-1alpha | ICAP1 | ICAP1A | ICAP1B 整合素β1结合蛋白1 - HPRD,Biogrid 9281591|11741908
ITGB1BP2 CHORDC3 | ITGB1BP | MELUSIN | MGC119214 | MSTP015 整联蛋白β1结合蛋白(MELUSIN)2 - HPRD 12514714
ITGB1BP3 MGC126624 |MIBP |NRK2 整合素β1结合蛋白3 - HPRD 10613898
ITGB5 FLJ26658 整合素,beta 5 - HPRD 11462216
喇嘛1 喇嘛 laminin, alpha 1 - HPRD,Biogrid 9688542
LGALS3BP 90k |BTBD17B |Mac-2-bp 凝集素,半乳糖苷结合,可溶性,3结合蛋白 - HPRD 9501082
LGALS8 GAL-8 |PCTA-1 |pcta1 |PO66-CBP 凝集素,半乳糖苷结合,可溶性,8 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 10852818
MAP4K4 FLH21957 |FLJ10410 |FLJ20373 |FLJ90111 |HGK |KIAA0687 |尼克 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶激酶4 - HPRD,Biogrid 11967148
myo10 FLJ10639 |FLJ21066 |FLJ22268 |FLJ43256 |KIAA0799 |MGC131988 肌球蛋白X 整合素-beta-1与MyO10相互作用。这种相互作用是建立在人类整联蛋白-beta-1和牛Myo10之间的相互作用的模型。 绑定 15156152
NME1 AWD |GAAD |NB |NBS |NDPK-A |ndpka |NM23 |NM23-H1 非转移细胞1,蛋白质(NM23A)在 - HPRD,Biogrid 11919189
prkca AAG6 |MGC129900 |MGC129901 |PKC-Alpha |PKCA |Prkaca protein kinase C, alpha - HPRD,Biogrid 12138200
PTK2 FADK | FAK | FAK1 | pp125FAK PTK2protein tyrosine kinase 2 - HPRD 8649427
PXN FLJ16691 paxillin - HPRD,Biogrid 7657702|10804218
RAB8B FLJ38125 Rab8b,Ras Oncogene家族成员 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12639940
SLC3A2 4F2 | 4F2HC | 4T2HC | CD98 | CD98HC | MDU1 | NACAE 溶质载体家族3(Dibasic和中性氨基酸转运的激活剂),成员2 - HPRD,Biogrid 12181350
tgoln2 MGC14722 |TGN38 |TGN46 |TGN48 |TGN51 |TTGN2 trans-golgi network protein 2 - HPRD,Biogrid 11208159
THBS1 thbs |TSP |TSP1 thrombospondin 1 - HPRD 11980922
TLN1 ilweq |KIAA1027 |TLN talin 1 - HPRD,Biogrid 11279249
TSPAN4 nag-2 |nag2 |四翼|TM4SF7 |TSPAN-4 四翼烷蛋白4 - HPRD,Biogrid 9360996|10734060
VCAM1 CD106 |DKFZP779G2333 |Incam-100 |MGC99561 vascular cell adhesion molecule 1 - HPRD 12097820
VCAN CSPG2 |DKFZP686K06110 |Ervr |PG-M |WGN |WGN1 versican - HPRD,Biogrid 11805102
ywhab GW128 |HS1 |KCIP-1 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,β多肽 - HPRD,Biogrid 11313964


V.途径注释

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
KEGG轴突指导 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg焦点粘附 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ECM RECEPTOR INTERACTION 84 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG细胞粘附分子凸轮 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg白细胞跨内皮迁移 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG REGULATION OF ACTIN CYTOSKELETON 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PATHOGENIC ESCHERICHIA COLI INFECTION 59 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Leishmania感染 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小细胞肺癌 84 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG HYPERTROPHIC CARDIOMYOPATHY HCM 85 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG心律失常右心肌病ARVC 76 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG扩张心肌病 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Lym途径 11 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA AGR PATHWAY 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta SPPA途径 22 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta bcellsurvival途径 16 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Lair Pathway 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA EPHA4 PATHWAY 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta ECM途径 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta ERK途径 28 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA INTEGRIN PATHWAY 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta McAlpain途径 25 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta单核细胞途径 11 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA PTEN PATHWAY 18 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta nkcells途径 20 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA MET PATHWAY 37 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta TFF途径 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Ucalpain途径 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PRL信号事件途径 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid rhoa途径 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Integin1途径 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID整合素CS途径 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ARF6贩运途径 49 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID REELIN PATHWAY 29 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TCPTP途径 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID血管生成素受体途径 50 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID整合素A9B1途径 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR4 PATHWAY 102 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Syndecan 4途径 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid upa upar途径 42 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID A6B1 A6B4整合素途径 46 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Syndecan 2途径 33 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid myc抑制道路 63 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID LYMPH ANGIOGENESIS PATHWAY 25 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID INTEGRIN A4B1 PATHWAY 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FAK PATHWAY 59 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CELL COMMUNICATION 120 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IMMUNOREGULATORY INTERACTIONS BETWEEN A LYMPHOID AND A NON LYMPHOID CELL 70 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞表面相互作用在血管壁 91 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLATELET ADHESION TO EXPOSED COLLAGEN 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Basigin相互作用 30 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome整合素细胞表面相互作用 79 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome其他闪光素相互作用 15 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Smaphorin相互作用 68 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞外基质相互作用 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞连接组织 78 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome L1CAM相互作用 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNAL TRANSDUCTION BY L1 34 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IMMUNE SYSTEM 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
渡边直肠癌放射疗法反应性DN 92 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CD40 UP的Hollmann凋亡 201 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS BASAL DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AKL HTLV1感染DN 68 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向 238 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC2靶向 114 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC3 TARGETS UP 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED UP 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马皮肤癌进展 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TP73和TP63的Sasaki目标 11 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘乳腺癌 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GUENTHER GROWTH SPHERICAL VS ADHERENT DN 26 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gotzmann上皮到间充质过渡 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HE PTEN TARGETS UP 16 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath MYC带Ebox的目标 230 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 151 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER PBL KIDNEY TRANSPLANT REJECTED VS OK DN 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATSUDA NATURAL KILLER DIFFERENTIATION 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IGLESIAS E2F TARGETS UP 151 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周TNF信号4小时 54 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAMALHO STEMNESS UP 206 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向 175 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG PROLIFERATING VS QUIESCENT 51 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gerhold脂肪形成DN 64 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑衰老 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hendricks Smarca4靶向DN 53 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C7的反应 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群T4 94 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KYNG DNA DAMAGE BY 4NQO OR UV 63 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽玛辐射2G后的生存率不佳 171 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LABBE TGFB1 TARGETS UP 102 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 111 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
QI PLASMACYTOMA UP 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAUCH HEDGEHOG SIGNALING PARACRINE DN 264 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOLDRATH ANTIGEN RESPONSE 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mellman Tut1靶向DN 47 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI PSEUDOPODIA HAPTOTAXIS DN 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU VAV3 PROSTATE CARCINOGENESIS DN 17 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAPOSI LIVER CANCER MET UP 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dang myc针对DN 31 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GREGORY SYNTHETIC LETHAL WITH IMATINIB 145 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANG AR目标DN 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的611CTF同工型的PEDERSEN目标 76 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Abdelmohsen Elavl4目标 16 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
山乳房干细胞DN 146 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 275 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124/506 1095 1101 M8 hsa-miR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124brain UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
hsa-miR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124brain UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-134 52 58 1A HSA-MIR-134brain ugugacuggugaccagaggg
mir-183 623 629 M8 HSA-MIR-183 UAUGGCACUGGUAGAAUUCACUG
mir-223 183 189 1A HSA-MIR-223 ugucuuugucaauacccc
mir-29 830 836 M8 HSA-MIR-29ASZ UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU
HSA-MIR-29BSZ UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
HSA-MIR-29CSZ UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
mir-320 608 614 1A hsa-miR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
miR-493-5p 115 122 1A,M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu