基因页：ITGB3

概括?
GeneID 3690
Symbol ITGB3
同义词 BDPLT16|BDPLT2|CD61|GP3A|GPIIIa|GT
描述 integrin subunit beta 3
参考 MIM：173470|HGNC:HGNC:6156|Ensembl:ENSG00000259207|HPRD：01428|Vega:OTTHUMG00000171956
Gene type protein-coding
地图位置 17q21.32
Pascal P值 0.608

数据源中的基因
Gene set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 系统搜索PubMed的基因co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.1411

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0004872 受体活性 IEA -
去：0005178 integrin binding IEA -
GO:0042802 相同的蛋白质结合 新闻学会 11606749
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0007160 细胞 - 矩阵粘附 IEA -
去：0007155 细胞粘附 塔斯 2452834|10429193
去：0007229 integrin-mediated signaling pathway IEA -
去：0007596 blood coagulation 塔斯 1438206
去：0007044 cell-substrate junction assembly IEA -
GO:0030334 regulation of cell migration IEA -
GO：0044419 生物之间的种间相互作用 IEA -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0009897 质膜的外侧 IEA -
GO:0005886 质膜 EXP 3607284|10605720
GO:0008305 integrin complex 塔斯 1438206
GO：0031092 platelet alpha granule membrane EXP 3607284

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ANGPTL3 ANGPT5 血管生成素状3 - HPRD 11877390
CD36 CHDS7 |脂肪|gp3b |GP4 |GPIV |帕西夫|Scarb3 CD36molecule (thrombospondin receptor) Affinity Capture-Western BioGRID 11238109
CIB1 CIB | KIP | KIP1 | SIP2-28 calcium and integrin binding 1 (calmyrin) - HPRD，Biogrid 9030514
FGA Fib2 | MGC119422 | MGC119423 | MGC119425 fibrinogen alpha chain - HPRD 11460491
FLNA ABP-280 |ABPX |DKFZP434P031 |fln |fln1 |FMD |MNS |NHBP |OPD |OPD1 | OPD2 filamin A, alpha (actin binding protein 280) 两个杂交 BioGRID 11807098
FLNB ABP-278 | AOI | DKFZp686A1668 | DKFZp686O033 | FH1 | FLN1L | LRS1 | SCT | TABP | TAP filamin B, beta (actin binding protein 278) 两个杂交 BioGRID 11807098
伊尔克 DKFZp686F1765 | P59 integrin-linked kinase - HPRD，Biogrid 12372433
伊尔克 DKFZp686F1765 | P59 integrin-linked kinase Integrin-beta-3 interacts with ILK. BIND 12372433
ITGA2B CD41 |CD41B |gp2b |gpiib |GTA |HPA3 integrin, alpha 2b (platelet glycoprotein IIb of IIb/IIIa complex, antigen CD41) 整联蛋白-Alphaiib与整联蛋白-BETA3相互作用。 BIND 8132607
ITGA2B CD41 |CD41B |gp2b |gpiib |GTA |HPA3 integrin, alpha 2b (platelet glycoprotein IIb of IIb/IIIa complex, antigen CD41) - HPRD 1429573
ITGAV CD51 |DKFZP686A08142 |MSK8 |vnra integrin, alpha V (vitronectin receptor, alpha polypeptide, antigen CD51) Integrin-alphaV interacts with Integrin-beta3. BIND 1693624|2138612
ITGAV CD51 |DKFZP686A08142 |MSK8 |vnra integrin, alpha V (vitronectin receptor, alpha polypeptide, antigen CD51) - HPRD，Biogrid 11884718
itgb3bp CENP-R | CENPR | HSU37139 | NRIF3 | TAP20 整联蛋白β3结合蛋白（beta3-endonexin） - HPRD，Biogrid 7593198|11864709
MYO10 FLJ10639 |FLJ21066 |FLJ22268 |FLJ43256 |KIAA0799 |MGC131988 肌球蛋白X Integrin-beta-3 interacts with Myo10. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between monkey integrin-beta-3 and bovine Myo10. BIND 15156152
NID1 NID nidogen 1 - HPRD 8831898
P2RY2 HP2U |MGC20088 |MGC40010 |P2RU1 |P2U |P2U1 |p2ur |P2Y2 |P2Y2R purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 2 - HPRD，Biogrid 11331301
PDGFRA CD140A | MGC74795 | PDGFR2 | Rhe-PDGFRA 血小板衍生的生长因子受体，α多肽 Affinity Capture-Western BioGRID 11953315
PDGFRB CD140B |JTK12 |PDGF-R-BETA |PDGFR |PDGFR1 血小板衍生的生长因子受体，β多肽 Affinity Capture-Western BioGRID 10964931
PECAM1 CD31 |PECAM-1 platelet/endothelial cell adhesion molecule Co-localization BioGRID 10982404
PTK2 Fadk |fak |fak1 |pp125fak PTK2蛋白酪氨酸激酶2 FAK与整合蛋白β3相互作用。 BIND 11927607
PTK2 Fadk |fak |fak1 |pp125fak PTK2蛋白酪氨酸激酶2 Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex		 BioGRID 9169439|11927607
PTK2 Fadk |fak |fak1 |pp125fak PTK2蛋白酪氨酸激酶2 - HPRD 8649427
ptk2b CADTK | CAKB | FADK2 | FAK2 | FRNK | PKB | PTK | PYK2 | RAFTK PTK2B蛋白酪氨酸激酶2β - HPRD，Biogrid 11683411
PXN FLJ16691 paxillin Reconstituted Complex BioGRID 11683411
SHC1 FLJ26504 |SHC |SHCA SHC (Src homology 2 domain containing) transforming protein 1 Integrin-beta-3 interacts with Shc. BIND 10964917
TENC1 c1-ten |C1TEN |DKFZP686D13244 |FLJ16320 |KIAA1075 |TNS2 像含有磷酸酶的C1结构蛋白（Tensin 2） - HPRD 12606711
THBS1 thbs |TSP |TSP1 血小板传播1 Reconstituted Complex BioGRID 2478219
TLN1 ILWEQ | KIAA1027 | TLN 塔林1 - HPRD，Biogrid 10497223|11932255


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG FOCAL ADHESION 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ECM RECEPTOR INTERACTION 84 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG HEMATOPOIETIC CELL LINEAGE 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG REGULATION OF ACTIN CYTOSKELETON 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肥厚性心肌病HCM 85 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ARRHYTHMOGENIC RIGHT VENTRICULAR CARDIOMYOPATHY ARVC 76 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG DILATED CARDIOMYOPATHY 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA EDG1 PATHWAY 27 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA UCALPAIN PATHWAY 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL4 2 Pathway 65 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID INTEGRIN CS PATHWAY 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PTP1B PATHWAY 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID INTEGRIN3 PATHWAY 43 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P3 PATHWAY 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3 OPN途径 31 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID NECTIN PATHWAY 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ARF6 PATHWAY 35 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P1途径 21 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3整合素途径 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid upa upar途径 42 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PDGFRB PATHWAY 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID VEGFR1 2 PATHWAY 69 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID EPHRINB REV PATHWAY 30 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL SURFACE INTERACTIONS AT THE VASCULAR WALL 91 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PECAM1相互作用 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对血小板胞质CA2升高的反应组反应 89 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INTEGRIN CELL SURFACE INTERACTIONS 79 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME P130CAS LINKAGE TO MAPK SIGNALING FOR INTEGRINS 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GRB2 SOS提供了与Intergrins的MAPK信号的联系 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INTEGRIN ALPHAIIB BETA3 SIGNALING 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME AXON GUIDANCE 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome L1CAM相互作用 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
L1反应组信号转导 34 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLATELET AGGREGATION PLUG FORMATION 36 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gal白血病干细胞向上 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUELLET OVARIAN CANCER INVASIVE VS LMP DN 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH CYCLING GENES 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SAKAI TUMOR INFILTRATING MONOCYTES UP 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TENEDINI MEGAKARYOCYTE MARKERS 66 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1的Verhaak AML突变 183 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dorsey GAB2目标 31 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML FAB MARKERS 191 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老的肌肉 244 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张增殖与静止 51 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1 C5的反应 21 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia延迟对TGFB1的响应 39 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1 EXOGENOUS TARGETS DN 120 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 6HR DN 160 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
coates巨噬细胞M1与M2 DN 78 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma Up 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS UP 165 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS DN 138 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Cycling基因 148 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JISON SICKLE CELL DISEASE UP 181 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER NPC HCP WITH H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta EBNA1反相关 173 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAGHAVACHARI PLATELET SPECIFIC GENES 70 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KASLER HDAC7 TARGETS 1 UP 194 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TORCHIA TARGETS OF EWSR1 FLI1 FUSION DN 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PLASARI TGFB1 TARGETS 10HR UP 199 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
let-7/98 1063 1069 m8 HSA-LET-7A脑 UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU
HSA-LET-7B脑 UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU
HSA-LET-7C脑 ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D脑 agagguaguagguugcauagu
HSA-LET-7E脑 UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU
HSA-LET-7F脑 ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98脑 UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I脑 UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU
miR-1/206 407 413 1A HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-125/351 699 705 m8 HSA-MIR-125B脑 UCCCUGAGACCCUAACUUGUGA
HSA-MIR-125A脑 UCCCUGAGACCCUUUAACCUGUG
miR-30-5p 65 72 1A,m8 hsa-miR-30a-5p uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-495 1945年 1951年 1A hsa-miR-495脑 AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU