基因页:EIF6
概括?
基因 | 3692 |
象征 | EIF6 |
同义词 | CAB | EIF3A | ITGB4BP | B(2)GCN | EIF-6 | P27(BBP)| P27BBP |
描述 | 真核翻译引发因子6 |
参考 | MIM:602912|HGNC:HGNC:6159|ENSEMBL:ENSG00000242372|HPRD:04221|Vega:Otthumg0000000032328 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2012年第20季度 |
Pascal P值 | 0.177 |
Sherlock P值 | 0.497 |
胎儿β | 0.337 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Phewas | 全球整个关联研究(PHEWAS) | 157个与精神分裂症相关的SNP | 1 |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.1714 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:Phewas
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS619865 | 20 | 33867697 | 无效的 | 1.752 | EIF6 | 无效的 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EIF6_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C3orf63 | 0.90 | 0.91 |
WDR44 | 0.90 | 0.91 |
IBTK | 0.88 | 0.90 |
赫尔克4 | 0.88 | 0.90 |
ZMYND11 | 0.87 | 0.89 |
EDEM3 | 0.87 | 0.89 |
mgea5 | 0.87 | 0.88 |
MORC3 | 0.87 | 0.89 |
DNAJC10 | 0.87 | 0.89 |
Rabep1 | 0.87 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.68 | -0.70 |
MT-CO2 | -0.68 | -0.72 |
AF347015.31 | -0.67 | -0.71 |
higd1b | -0.65 | -0.71 |
增强 | -0.65 | -0.76 |
AF347015.21 | -0.65 | -0.67 |
AF347015.33 | -0.64 | -0.66 |
ifi27 | -0.64 | -0.68 |
AF347015.8 | -0.63 | -0.69 |
mt-cyb | -0.63 | -0.67 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003743 | 翻译引发因子活动 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15231747|17353931 | |
去:0043022 | 核糖体结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006412 | 翻译 | IEA | - | |
GO:0042256 | 成熟的核糖体组件 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 塔斯 | 9374518 | |
去:0005638 | 层丝丝 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ABCF1 | ABC27 |ABC50 | ATP结合盒,子家庭F(GCN20),成员1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
ACAP3 | Centb5 |KIAA1716 | 带有盘绕螺旋的ARFGAP,Ankyrin重复和pH结构域3 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
ACTG1 | 行为|ACTG |DFNA20 |DFNA26 | 肌动蛋白,伽马1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
AKT1S1 | 叶|MGC2865 |PRAS40 | AKT1底物1(富含脯氨酸) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
aldh2 | aldh-e2 |Aldhi |aldm |MGC1806 | 醛脱氢酶2家族(线粒体) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
ARF6 | DKFZP564M0264 | ADP-核糖基化因子6 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
BCCIP | Tok-1 |tok1 | BRCA2和CDKN1A相互作用蛋白 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
C1orf103 | FLJ11269 |RIF1 |RP11-96K19.1 | 染色体1开放阅读框103 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
C4ORF27 | FLJ20534 |FLJ33423 |FLJ42042 | 染色体4开放阅读框27 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
Creld1 | AVSD2 |Cirrin |DKFZP566D213 | 具有EGF样域1的半胱氨酸富含半胱氨酸 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
EIF3B | EIF3-ETA |EIF3-P110 |EIF3-P116 |EIF3S9 |MGC104664 |MGC131875 |PRT1 | 真核翻译起始因子3,亚基B | 共纯化 | Biogrid | 15946946 |
EIF3C | EIF3S8 |FLJ78287 |MGC189744 |EIF3-P110 | 真核翻译起始因子3,亚基C | 共纯化 | Biogrid | 15946946 |
EIF3J | EIF3S1 |eif3-alpha |EIF3-P35 | 真核翻译起始因子3,亚基J | 共纯化 | Biogrid | 15946946 |
ENOX1 | CNOX |FLJ10094 |Pig38 |BA64J21.1 |CCNOX | Ecto-Nod二硫键 - 硫醇交换器1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
FHL2 | AAG11 |Dral |Slim3 | 四个半域2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 10906324 |
fibp | fgfibp |FIBP-1 | 成纤维细胞生长因子(酸性)细胞内结合蛋白 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
Fundc2 | DC44 |FLJ33773 |HCBP6 |HCC3 |MGC131676 |MGC2495 |PD03104 | fun14包含2个域 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
FUS | 切碎|FUS-CHOP |fus1 |TLS |TLS/CHOP |HNRNP-P2 | 融合(涉及恶性脂肪肉瘤中的t(12; 16)) | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
git1 | - | G蛋白偶联受体激酶相互作用ARFGAP 1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
GNB2L1 | GNB2-RS1 |H12.3 |HLC-7 |PIG21 |机架1 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 | - | HPRD,Biogrid | 14654845 |
GNB2L1 | GNB2-RS1 |H12.3 |HLC-7 |PIG21 |机架1 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 | EIF6与RACK 1互动 | 绑定 | 14654845 |
GTPBP4 | CRFG |FLJ10686 |FLJ10690 |FLJ39774 |NGB |NOG1 | GTP结合蛋白4 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
has1 | 已 | 透明质酸合酶1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
HIP1 | ilweq |MGC126506 | 亨廷顿相互作用蛋白1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
ITGB4 | CD104 | 整合素,beta 4 | - | HPRD,Biogrid | 9374518 |
KIAA1377 | - | KIAA1377 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
LOC387753 | - | 类似于60S核糖体蛋白L21 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
MRPS31 | imogn38 |MRP-S31 |S31MT | 线粒体核糖体蛋白S31 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
npepps | MP100 |PSA | 氨基肽酶嘌呤霉素敏感 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
燕麦 | DKFZP781A11155 |霍加 | 鸟氨酸氨基转移酶(回肠萎缩) | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
OFD1 | 71-7A |cxorf5 |MGC117039 |MGC117040 |SGBS2 | 口腔数字数字综合征1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
PAICS | ADE2 |ADE2H1 |AIRC |DKFZP781N1372 |MGC1343 |MGC5024 |佩斯 | 磷酸氨基氨基咪唑羧化酶,磷酸氨基氨基咪唑辅助辅助酰胺合成酶合成酶 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
PDHA1 | pdha |pdhce1a |phe1a | 丙酮酸脱氢酶(lipoamide)α1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
pola2 | FLJ21662 |FLJ37250 | 聚合酶(定向DNA),α2(70KD亚基) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
Prkcb | MGC41878 |pkc-beta |PKCB |prkcb1 |PRKCB2 | 蛋白激酶C,β | - | HPRD | 14654845 |
PSME1 | ifi5111 |MGC8628 |PA28A |PA28ALPHA |富豪 | 蛋白酶体(Prosome,大型)激活剂亚基1(PA28 alpha) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
RGS10 | - | G蛋白信号传导的调节剂10 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPL3 | MGC104284 |TARBP-B | 核糖体蛋白L3 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPL34 | MGC111005 | 核糖体蛋白L34 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPL6 | Shujun-2 |TAXREB107 |TXREB1 | 核糖体蛋白L6 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
RRP15 | CGI-115 |KIAA0507 |MGC22291 | 核糖体RNA加工15个同源物(S. cerevisiae) | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
9月3日 | MGC133218 |sep3 |BK250D10.3 | 9月3日 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
Sorbs1 | 上限|DKFZP451C066 |DKFZP586P1422 |flaf2 |FLJ12406 |KIAA1296 |R85FL |SH3D5 |SH3P12 |Sorb1 | 索尔宾和SH3域,包含1个 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
UPF3B | hupf3b |MRXS14 |rent3b |UPF3X | UPF3胡说转录本同源B(酵母)的调节剂 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
USP33 | KIAA1097 |MGC16868 |VDU1 | 泛素特异性肽酶33 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
WFS1 | DFNA14 |DFNA38 |DFNA6 |didmoad |WFRS |WFS |Wolframin | Wolfram综合征1(Wolframin) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
YARS | cmtdic |Tyrrs |yrs |yts | 酪酶tRNA合成酶 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Biocarta EIF途径 | 16 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名1 DN | 126 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名2 DN | 77 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 DN | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌20q11扩增子 | 31 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard粉碎和燃烧突变体 | 197 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莫雷拉对TSA的反应 | 28 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血中间祖先 | 149 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 | 161 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠和直肠癌 | 285 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病持续时间corr dn | 146 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |