概括
基因 3692
象征 EIF6
同义词 CAB | EIF3A | ITGB4BP | B(2)GCN | EIF-6 | P27(BBP)| P27BBP
描述 真核翻译引发因子6
参考 MIM:602912|HGNC:HGNC:6159|ENSEMBL:ENSG00000242372|HPRD:04221|Vega:Otthumg0000000032328
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2012年第20季度
Pascal P值 0.177
Sherlock P值 0.497
胎儿β 0.337

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Phewas 全球整个关联研究(PHEWAS) 157个与精神分裂症相关的SNP 1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.1714

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:Phewas

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS619865 20 33867697 无效的 1.752 EIF6 无效的


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C3orf63 0.90 0.91
WDR44 0.90 0.91
IBTK 0.88 0.90
赫尔克4 0.88 0.90
ZMYND11 0.87 0.89
EDEM3 0.87 0.89
mgea5 0.87 0.88
MORC3 0.87 0.89
DNAJC10 0.87 0.89
Rabep1 0.87 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FXYD1 -0.68 -0.70
MT-CO2 -0.68 -0.72
AF347015.31 -0.67 -0.71
higd1b -0.65 -0.71
增强 -0.65 -0.76
AF347015.21 -0.65 -0.67
AF347015.33 -0.64 -0.66
ifi27 -0.64 -0.68
AF347015.8 -0.63 -0.69
mt-cyb -0.63 -0.67

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003743 翻译引发因子活动 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 15231747|17353931
去:0043022 核糖体结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006412 翻译 IEA -
GO:0042256 成熟的核糖体组件 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 塔斯 9374518
去:0005638 层丝丝 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
ABCF1 ABC27 |ABC50 ATP结合盒,子家庭F(GCN20),成员1 两个杂交 Biogrid 16169070
ACAP3 Centb5 |KIAA1716 带有盘绕螺旋的ARFGAP,Ankyrin重复和pH结构域3 两个杂交 Biogrid 16169070
ACTG1 行为|ACTG |DFNA20 |DFNA26 肌动蛋白,伽马1 两个杂交 Biogrid 16169070
AKT1S1 叶|MGC2865 |PRAS40 AKT1底物1(富含脯氨酸) 两个杂交 Biogrid 16169070
aldh2 aldh-e2 |Aldhi |aldm |MGC1806 醛脱氢酶2家族(线粒体) 两个杂交 Biogrid 16169070
ARF6 DKFZP564M0264 ADP-核糖基化因子6 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
BCCIP Tok-1 |tok1 BRCA2和CDKN1A相互作用蛋白 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
C1orf103 FLJ11269 |RIF1 |RP11-96K19.1 染色体1开放阅读框103 两个杂交 Biogrid 16169070
C4ORF27 FLJ20534 |FLJ33423 |FLJ42042 染色体4开放阅读框27 两个杂交 Biogrid 16169070
Creld1 AVSD2 |Cirrin |DKFZP566D213 具有EGF样域1的半胱氨酸富含半胱氨酸 两个杂交 Biogrid 16169070
EIF3B EIF3-ETA |EIF3-P110 |EIF3-P116 |EIF3S9 |MGC104664 |MGC131875 |PRT1 真核翻译起始因子3,亚基B 共纯化 Biogrid 15946946
EIF3C EIF3S8 |FLJ78287 |MGC189744 |EIF3-P110 真核翻译起始因子3,亚基C 共纯化 Biogrid 15946946
EIF3J EIF3S1 |eif3-alpha |EIF3-P35 真核翻译起始因子3,亚基J 共纯化 Biogrid 15946946
ENOX1 CNOX |FLJ10094 |Pig38 |BA64J21.1 |CCNOX Ecto-Nod二硫键 - 硫醇交换器1 两个杂交 Biogrid 16169070
FHL2 AAG11 |Dral |Slim3 四个半域2 亲和力捕获 - 韦斯特恩
两个杂交
Biogrid 10906324
fibp fgfibp |FIBP-1 成纤维细胞生长因子(酸性)细胞内结合蛋白 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
Fundc2 DC44 |FLJ33773 |HCBP6 |HCC3 |MGC131676 |MGC2495 |PD03104 fun14包含2个域 两个杂交 Biogrid 16169070
FUS 切碎|FUS-CHOP |fus1 |TLS |TLS/CHOP |HNRNP-P2 融合(涉及恶性脂肪肉瘤中的t(12; 16)) 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
git1 - G蛋白偶联受体激酶相互作用ARFGAP 1 两个杂交 Biogrid 16169070
GNB2L1 GNB2-RS1 |H12.3 |HLC-7 |PIG21 |机架1 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 - HPRD,Biogrid 14654845
GNB2L1 GNB2-RS1 |H12.3 |HLC-7 |PIG21 |机架1 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 EIF6与RACK 1互动 绑定 14654845
GTPBP4 CRFG |FLJ10686 |FLJ10690 |FLJ39774 |NGB |NOG1 GTP结合蛋白4 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
has1 透明质酸合酶1 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
HIP1 ilweq |MGC126506 亨廷顿相互作用蛋白1 两个杂交 Biogrid 16169070
ITGB4 CD104 整合素,beta 4 - HPRD,Biogrid 9374518
KIAA1377 - KIAA1377 两个杂交 Biogrid 16169070
LOC387753 - 类似于60S核糖体蛋白L21 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
MRPS31 imogn38 |MRP-S31 |S31MT 线粒体核糖体蛋白S31 两个杂交 Biogrid 16169070
npepps MP100 |PSA 氨基肽酶嘌呤霉素敏感 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
燕麦 DKFZP781A11155 |霍加 鸟氨酸氨基转移酶(回肠萎缩) 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
OFD1 71-7A |cxorf5 |MGC117039 |MGC117040 |SGBS2 口腔数字数字综合征1 两个杂交 Biogrid 16169070
PAICS ADE2 |ADE2H1 |AIRC |DKFZP781N1372 |MGC1343 |MGC5024 |佩斯 磷酸氨基氨基咪唑羧化酶,磷酸氨基氨基咪唑辅助辅助酰胺合成酶合成酶 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
PDHA1 pdha |pdhce1a |phe1a 丙酮酸脱氢酶(lipoamide)α1 两个杂交 Biogrid 16169070
pola2 FLJ21662 |FLJ37250 聚合酶(定向DNA),α2(70KD亚基) 两个杂交 Biogrid 16169070
Prkcb MGC41878 |pkc-beta |PKCB |prkcb1 |PRKCB2 蛋白激酶C,β - HPRD 14654845
PSME1 ifi5111 |MGC8628 |PA28A |PA28ALPHA |富豪 蛋白酶体(Prosome,大型)激活剂亚基1(PA28 alpha) 两个杂交 Biogrid 16169070
RGS10 - G蛋白信号传导的调节剂10 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPL3 MGC104284 |TARBP-B 核糖体蛋白L3 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPL34 MGC111005 核糖体蛋白L34 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPL6 Shujun-2 |TAXREB107 |TXREB1 核糖体蛋白L6 两个杂交 Biogrid 16169070
RRP15 CGI-115 |KIAA0507 |MGC22291 核糖体RNA加工15个同源物(S. cerevisiae) 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
9月3日 MGC133218 |sep3 |BK250D10.3 9月3日 两个杂交 Biogrid 16169070
Sorbs1 上限|DKFZP451C066 |DKFZP586P1422 |flaf2 |FLJ12406 |KIAA1296 |R85FL |SH3D5 |SH3P12 |Sorb1 索尔宾和SH3域,包含1个 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
UPF3B hupf3b |MRXS14 |rent3b |UPF3X UPF3胡说转录本同源B(酵母)的调节剂 两个杂交 Biogrid 16169070
USP33 KIAA1097 |MGC16868 |VDU1 泛素特异性肽酶33 两个杂交 Biogrid 16169070
WFS1 DFNA14 |DFNA38 |DFNA6 |didmoad |WFRS |WFS |Wolframin Wolfram综合征1(Wolframin) 两个杂交 Biogrid 16169070
YARS cmtdic |Tyrrs |yrs |yts 酪酶tRNA合成酶 亲和力捕获ms Biogrid 17353931


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Biocarta EIF途径 16 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1 DN 126 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名2 DN 77 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 DN 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌20q11扩增子 31 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体 197 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莫雷拉对TSA的反应 28 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血中间祖先 149 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 161 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病持续时间corr dn 146 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因