基因页:ITIH4
概括?
基因 | 3700 |
象征 | ITIH4 |
同义词 | gp120 | h4p | ihrp | iti-hc4 | itihl1 | pk-1220 | pk120 |
描述 | α-丁字裤抑制蛋白抑制剂重链家庭成员4 |
参考 | MIM:600564|HGNC:HGNC:6169|Ensembl:ENSG00000055955|HPRD:02781|Vega:Otthumg00000159023 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P21.1 |
Pascal P值 | 1.521E-10 |
Sherlock P值 | 0.118 |
胎儿β | -0.564 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
LK:是的 | 全基因组协会研究 | 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV:RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:PGC128
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2535627 | CHR3 | 52845105 | TC | 3.956e-11 | 基因间 | ITIH3,ITIH4 | dist = 2080; dist = 1901 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1961958 | CHR3 | 52585989 | ITIH4 | 3700 | 0.18 | 顺式 | ||
RS6778844 | CHR3 | 52596397 | ITIH4 | 3700 | 0.02 | 顺式 | ||
RS2336545 | CHR3 | 52787602 | ITIH4 | 3700 | 0.18 | 顺式 | ||
RS2240920 | CHR3 | 52831008 | ITIH4 | 3700 | 0.1 | 顺式 | ||
RS2276817 | CHR3 | 52860935 | ITIH4 | 3700 | 0 | 顺式 | ||
RS3733047 | CHR3 | 52871928 | ITIH4 | 3700 | 0.03 | 顺式 | ||
RS6803519 | CHR3 | 52889770 | ITIH4 | 3700 | 0 | 顺式 | ||
RS2581815 | CHR3 | 52982158 | ITIH4 | 3700 | 0.01 | 顺式 | ||
RS2336669 | CHR3 | 52994137 | ITIH4 | 3700 | 0.01 | 顺式 | ||
RS4519686 | CHR3 | 52997870 | ITIH4 | 3700 | 0.04 | 顺式 | ||
RS17304995 | CHR3 | 53070754 | ITIH4 | 3700 | 0.01 | 顺式 | ||
RS2276817 | CHR3 | 52860935 | ITIH4 | 3700 | 0.11 | 反式 | ||
RS6803519 | CHR3 | 52889770 | ITIH4 | 3700 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ITIH4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ddit4 | 0.69 | 0.45 |
KDM3A | 0.66 | 0.58 |
TMPO | 0.66 | 0.55 |
Hist2H2BE | 0.65 | 0.56 |
ZFP36L1 | 0.65 | 0.57 |
HES1 | 0.64 | 0.43 |
MCL1 | 0.64 | 0.61 |
VEGFA | 0.64 | 0.53 |
ZNF143 | 0.63 | 0.52 |
sord | 0.63 | 0.56 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
cldnd2 | -0.40 | -0.47 |
C5orf53 | -0.40 | -0.46 |
AF347015.21 | -0.39 | -0.49 |
ifi27 | -0.39 | -0.44 |
MT-CO2 | -0.37 | -0.45 |
AF347015.27 | -0.36 | -0.44 |
AF347015.31 | -0.36 | -0.42 |
C1orf54 | -0.36 | -0.44 |
PSMB9 | -0.35 | -0.37 |
higd1b | -0.35 | -0.41 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Corre多发性骨髓瘤 | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoebeke淋巴干细胞向上 | 95 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iglesias e2f目标dn | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌 | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stearman肿瘤场效应 | 36 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stearman肺癌早期与晚期 | 125 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G123 DN | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏发展DN | 222 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM监管机构 | 238 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |