基因页：ITPKB
概括？
| 基因 | 3707 |
| 象征 | ITPKB |
| 同义词 | IP3-3KB | IP3K | IP3K-B | IP3KB | PIG37 |
| 描述 | 肌醇三磷酸3-激酶b |
| 参考 | MIM：147522|HGNC：HGNC：6179|ENSEMBL：ENSG00000143772|HPRD：00942|Vega：Otthumg0000000037582 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1Q42.13 |
| Sherlock P值 | 0.576 |
| 胎儿β | -1.905 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.0217 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG02814998 | 1 | 226926791 | ITPKB | 5.539E-4 | -0.374 | 0.049 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4501739 | Chrx | 35960848 | ITPKB | 3707 | 0.01 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CHST6 | 0.78 | 0.79 |
| angptl2 | 0.78 | 0.82 |
| olig2 | 0.77 | 0.81 |
| DOCK1 | 0.76 | 0.78 |
| ITPKB | 0.76 | 0.81 |
| SLC12A4 | 0.76 | 0.77 |
| Litaf | 0.75 | 0.77 |
| Mid1ip1 | 0.75 | 0.78 |
| Sox13 | 0.75 | 0.81 |
| ST5 | 0.75 | 0.81 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GPR22 | -0.47 | -0.51 |
| klhl1 | -0.41 | -0.39 |
| Neurod6 | -0.41 | -0.45 |
| mpped1 | -0.41 | -0.43 |
| Dact1 | -0.41 | -0.35 |
| Nell2 | -0.40 | -0.38 |
| 提亚姆2 | -0.40 | -0.38 |
| SSBP2 | -0.40 | -0.39 |
| PPAPR5 | -0.40 | -0.40 |
| NR2C2AP | -0.40 | -0.46 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0005516 | 钙调蛋白结合 | IEA | - | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| GO：0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
| 去：0008440 | 肌醇三磷酸3-激酶活性 | 塔斯 | 1654894 | |
| 去：0016301 | 激酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 1654894 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG肌醇磷酸代谢 | 54 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg钙信号通路 | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 | 76 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| St Wnt Ca2环状GMP途径 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| st g alpha i路径 | 35 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ST颗粒细胞存活途径 | 27 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 圣肾上腺素能 | 36 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| St GAQ途径 | 28 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| St T细胞信号转导 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ST PAC1受体途径 | 7 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ST B细胞抗原受体 | 40 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni Rhabdomyosarcoma PAX FOXO1融合 | 64 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HOOI ST7靶向DN | 123 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Streicher LSM1靶向 | 44 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kang lith pdgfra up | 50 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LE EGR2目标DN | 108 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 宁慢性阻塞性肺疾病 | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lenaour树突状细胞成熟 | 114 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤CD2 | 45 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 大脑衰老 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 | 88 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 等级结肠和直肠癌DN | 101 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chang Core血清反应DN | 209 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jison Sickle细胞疾病DN | 181 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wierenga Stat5a靶向DN | 213 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lim乳腺腔内成熟DN | 99 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-130/301 | 109 | 115 | 1a | HSA-MIR-130A脑 | cagugcaauguaaaaggggau |
| HSA-MIR-301 | cagugcaauaugucaaagc | ||||
| HSA-MIR-130b脑 | Cagugcaaugaagggauggau | ||||
| HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu | ||||
| mir-132/212 | 2912 | 2918 | 1a | HSA-MIR-212SZ | uaacagucuccagucacgccc |
| HSA-MIR-132脑 | uaacagucuacccaugggg | ||||
| mir-142-3p | 111 | 117 | 1a | HSA-MIR-142-3P | uguaguuuccuacuuuaugga |
| mir-19 | 2588 | 2594 | 1a | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
| HSA-MIR-19B | ugugcaaauccaugcaaaacuga | ||||
| mir-194 | 2913 | 2920 | 1A，M8 | HSA-MIR-194 | uguaacagcaacuccauga |
| mir-375 | 1943年 | 1949年 | 1a | HSA-MIR-375 | uuuguucguucggcucgcguga |
| mir-410 | 2560 | 2566 | M8 | HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu |