基因页:ITPR2
概括?
基因 | 3709 |
象征 | ITPR2 |
同义词 | anhd | cfap48 | insp3r2 | ip3r2 |
描述 | 肌醇1,4,5-三磷酸受体2型 |
参考 | MIM:600144|HGNC:HGNC:6181|ENSEMBL:ENSG00000123104|HPRD:02536|Vega:Otthumg00000169181 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12p11 |
Pascal P值 | 0.152 |
Sherlock P值 | 0.708 |
胎儿β | -0.27 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 小脑半球 小脑 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 3 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 3 |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值:1.69 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG23341970 | 12 | 26782390 | ITPR2 | 2.56E-5 | 0.295 | 0.017 | DMG:Wockner_2014 |
CG01354782 | 12 | 26522758 | ITPR2 | 1.414E-4 | -0.692 | 0.031 | DMG:Wockner_2014 |
CG25960567 | 12 | 26985181 | ITPR2 | -0.023 | 0.25 | DMG:Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ITPR2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
去:0005262 | 钙通道活性 | IEA | - | |
去:0005216 | 离子通道活动 | IEA | - | |
去:0005220 | 肌醇1,4,5-三磷酸敏感性钙释频通道活性 | IEA | - | |
去:0008095 | 肌醇1,4,5-三磷酸受体活性 | 塔斯 | 8081734 | |
GO:0015085 | 钙离子跨膜转运蛋白活性 | 塔斯 | 8081734 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 8081734 | |
去:0006816 | 钙离子传输 | IEA | - | |
去:0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
去:0005783 | 内质网 | 塔斯 | 10828023 | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | 塔斯 | 10828023 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg钙信号通路 | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 | 76 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg卵母细胞减数分裂 | 114 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg血管平滑肌收缩 | 115 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg间隙交界处 | 90 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg长期增强 | 70 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG长期抑郁症 | 70 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg gnRH信号通路 | 101 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg阿尔茨海默氏病 | 169 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
St Wnt Ca2环状GMP途径 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
st g alpha i路径 | 35 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SIG趋化性 | 45 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
圣肾上腺素能 | 36 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
St GAQ途径 | 28 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B淋巴细胞中的SIG PIP3信号传导 | 36 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SIG BCR信号通路 | 46 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
St Myocyte广告路径 | 27 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DAG和IP3信令 | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2的Reactome信号传导 | 101 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EGFR在癌症中的反应组信号传导 | 109 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome抗原激活B细胞受体,导致第二使者产生 | 29 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞受体BCR的反应组信号传导 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 | 137 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR在疾病中的反应组信号传导 | 127 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK | 205 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
能量代谢的反应组整合 | 120 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome阿片类药物信号传导 | 78 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PLC Beta介导的事件 | 43 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胞质Ca2水平的反应组升高 | 10 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PDGF的Reactome信号传导 | 122 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome下游信号转导 | 95 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胰像肽等胰高血糖素分泌的反应组调节胰岛素分泌1 | 43 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha Q信号事件 | 184 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胰岛素分泌的反应组调节 | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome的下游信号传导激活的FGFR | 100 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome磷脂酶C介导的级联 | 54 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PIP2水解的反应组作用 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome血小板稳态 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome血小板钙稳态 | 18 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome血小板激活信号传导和聚集 | 208 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR的Reactome信号传导 | 112 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA钻石黑芬贫血祖先DN | 66 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Horiuchi WTAP靶向 | 306 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis Erbb2乳腺肿瘤65 | 22 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis Erbb2乳腺肿瘤324向上 | 150 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LOH在CHR9Q中与LOH的Lindgren膀胱癌 | 116 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海登布拉德在胰腺癌中扩增 | 31 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cervera SDHB目标2 | 114 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CERVERA SDHB目标1 DN | 38 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ross AML与PML RARA FUSION | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巴索B淋巴细胞网络 | 143 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺 | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delaserna Myod目标DN | 57 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
布朗HCMV感染48小时 | 180 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung可卡因奖励4WK | 75 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MariaDason对丁酸酯Sulindac 6的反应 | 52 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ambrosini Flavopiridol处理TP53 | 109 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Labbe TGFB1靶向 | 102 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼克对Proc处理DN的反应 | 27 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G6 UP | 65 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇1的时间反应1 | 68 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
li诱导了自然杀手DN | 116 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
APC和MBD2的Phesse目标 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lim乳腺腔祖先 | 58 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-203.1 | 1045 | 1052 | 1A,M8 | HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
mir-505 | 94 | 100 | 1a | HSA-MIR-505 | gucaacuugcugguuccuc |
mir-96 | 118 | 124 | M8 | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |