概括
基因 3709
象征 ITPR2
同义词 anhd | cfap48 | insp3r2 | ip3r2
描述 肌醇1,4,5-三磷酸受体2型
参考 MIM:600144|HGNC:HGNC:6181|ENSEMBL:ENSG00000123104|HPRD:02536|Vega:Otthumg00000169181
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12p11
Pascal P值 0.152
Sherlock P值 0.708
胎儿β -0.27
DMG 2(#研究)
主持人 小脑半球
小脑
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 3
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 3
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.69

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG23341970 12 26782390 ITPR2 2.56E-5 0.295 0.017 DMG:Wockner_2014
CG01354782 12 26522758 ITPR2 1.414E-4 -0.692 0.031 DMG:Wockner_2014
CG25960567 12 26985181 ITPR2 -0.023 0.25 DMG:Nishioka_2013


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005509 钙离子结合 IEA -
去:0005262 钙通道活性 IEA -
去:0005216 离子通道活动 IEA -
去:0005220 肌醇1,4,5-三磷酸敏感性钙释频通道活性 IEA -
去:0008095 肌醇1,4,5-三磷酸受体活性 塔斯 8081734
GO:0015085 钙离子跨膜转运蛋白活性 塔斯 8081734
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007165 信号转导 塔斯 8081734
去:0006816 钙离子传输 IEA -
去:0006811 离子运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005789 内质网膜 IEA -
去:0005783 内质网 塔斯 10828023
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 塔斯 10828023

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg钙信号通路 178 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 76 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg卵母细胞减数分裂 114 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg血管平滑肌收缩 115 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg间隙交界处 90 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg长期增强 70 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG长期抑郁症 70 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg gnRH信号通路 101 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg阿尔茨海默氏病 169 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St Wnt Ca2环状GMP途径 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
st g alpha i路径 35 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG趋化性 45 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
圣肾上腺素能 36 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St GAQ途径 28 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B淋巴细胞中的SIG PIP3信号传导 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG BCR信号通路 46 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St Myocyte广告路径 27 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DAG和IP3信令 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的Reactome信号传导 101 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EGFR在癌症中的反应组信号传导 109 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原激活B细胞受体,导致第二使者产生 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的反应组信号传导 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 137 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR在疾病中的反应组信号传导 127 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK 205 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
能量代谢的反应组整合 120 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome阿片类药物信号传导 78 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PLC Beta介导的事件 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胞质Ca2水平的反应组升高 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PDGF的Reactome信号传导 122 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome下游信号转导 95 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰像肽等胰高血糖素分泌的反应组调节胰岛素分泌1 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha Q信号事件 184 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素分泌的反应组调节 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome的下游信号传导激活的FGFR 100 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome磷脂酶C介导的级联 54 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PIP2水解的反应组作用 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板稳态 78 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板钙稳态 18 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板激活信号传导和聚集 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR的Reactome信号传导 112 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血祖先DN 66 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Horiuchi WTAP靶向 306 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤65 22 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤324向上 150 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOH在CHR9Q中与LOH的Lindgren膀胱癌 116 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海登布拉德在胰腺癌中扩增 31 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cervera SDHB目标2 114 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CERVERA SDHB目标1 DN 38 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML与PML RARA FUSION 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索B淋巴细胞网络 143 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺 38 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马纳洛缺氧 207 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delaserna Myod目标DN 57 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
布朗HCMV感染48小时 180 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung可卡因奖励4WK 75 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MariaDason对丁酸酯Sulindac 6的反应 52 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D DN 270 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ambrosini Flavopiridol处理TP53 109 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向 102 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌的生存 185 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼克对Proc处理DN的反应 27 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G6 UP 65 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 UP 176 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇1的时间反应1 68 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手DN 116 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
APC和MBD2的Phesse目标 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lim乳腺腔祖先 58 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-203.1 1045 1052 1A,M8 HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-505 94 100 1a HSA-MIR-505 gucaacuugcugguuccuc
mir-96 118 124 M8 HSA-MIR-96 uuuggcacuagcacauuuuugc