概括
基因 3716
象征 JAK1
同义词 jak1a | jak1b | jtk3
描述 Janus激酶1
参考 MIM:147795|HGNC:HGNC:6190|ENSEMBL:ENSG00000162434|HPRD:00992|Vega:Otthumg00000009310
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p32.3-p31.3
Pascal P值 0.003
胎儿β -0.986
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球
小脑
皮质
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.02692
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0058

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG16618003 1 65432492 JAK1 1.57e-11 -0.012 2.86E-7 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TSPAN9 0.88 0.50
FOXO1 0.84 0.54
IL28RA 0.82 0.45
AP000911.1 0.82 0.37
C10orf41 0.82 0.42
0.82 0.44
Sertad4 0.82 0.43
rxrg 0.81 0.48
ZNF521 0.81 0.54
PBX3 0.81 0.50
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SLC26A4 -0.29 -0.28
EMX1 -0.26 -0.23
ID2 -0.24 -0.29
Cidea -0.24 -0.20
AF347015.31 -0.24 -0.15
GPR22 -0.23 -0.18
AF347015.21 -0.23 -0.15
AF347015.2 -0.22 -0.14
MT-CO2 -0.22 -0.15
AF347015.8 -0.22 -0.14

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004718 Janus激酶活性 IEA -
去:0004715 非膜跨度蛋白酪氨酸激酶活性 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007243 蛋白激酶级联反应 IEA -
去:0007167 酶连接的受体蛋白信号通路 IEA -
GO:0018108 肽基 - 酪氨酸磷酸化 IEA -
GO:0019221 细胞因子介导的信号通路 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0012505 内膜系统 IEA -
去:0005856 细胞骨架 IEA -
去:0016020 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
ABL1 ABL |JTK7 |BCR/ABL |c-abl |P150 |V-ABL C-ABL癌基因1,受体酪氨酸激酶 重构的复合物 Biogrid 9774693
ABL1 ABL |JTK7 |BCR/ABL |c-abl |P150 |V-ABL C-ABL癌基因1,受体酪氨酸激酶 - HPRD 12130510
ABL2 abll |arg |FLJ22224 |FLJ31718 |FLJ41441 V-Abl Abelson鼠白血病病毒癌基因同源2(ARG,与阿伯森相关的基因) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 9774693
ARRB1 ARB1 |arr1 逮捕,beta 1 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
atic aicar |aicarft |FLJ93545 |损失|purh 5-氨基咪唑-4-羧酰胺核糖核苷酸甲基转移酶/IMP环丙基水解酶 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
BRCA1 Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 乳腺癌1,早发 - HPRD,Biogrid 11163768
btk AGMX1 |在|ATK |bpk |IMD1 |MGC126261 |MGC126262 |PSCTK1 |XLA 布鲁顿阿氨基葡萄糖酸酪氨酸激酶 - HPRD,Biogrid 9178903
CSF3R CD114 |GCSFR 菌落刺激因子3受体(粒细胞) - HPRD,Biogrid 7512720
ELF3 EPR-1 |ERT |ESE-1 |ESX E74样因子3(ETS域转录因子,上皮特异性) 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
ELP2 FLJ10879 |Shinc-2 |Statip1 |Stip 伸长蛋白2同源物(S. cerevisiae) - HPRD,Biogrid 10954736
GHR GHBP 生长激素受体 - HPRD,Biogrid 10502458
GNB2L1 GNB2-RS1 |H12.3 |HLC-7 |PIG21 |机架1 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 RACK-1与JAK1相互作用。 绑定 12960323
GNB2L1 GNB2-RS1 |H12.3 |HLC-7 |PIG21 |机架1 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 - HPRD,Biogrid 12960323
GRB2 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 生长因子受体结合蛋白2 - HPRD,Biogrid 8536716|11527382
IFNAR2 IFN-R |IFN-Alpha-Rec |ifnabr |ifnarb 干扰素(Alpha,beta和Omega)受体2 重构的复合物 Biogrid 12133952
IFNAR2 IFN-R |IFN-Alpha-Rec |ifnabr |ifnarb 干扰素(Alpha,beta和Omega)受体2 IFNR-BETA-L与JAK1相互作用。 绑定 12960323
IFNGR1 CD119 |FLJ45734 |ifngr 干扰素伽马受体1 重构的复合物 Biogrid 12133952
IGF1R CD221 |igfir |JTK13 |MGC142170 |MGC142172 |MGC18216 胰岛素样生长因子1受体 磷酸化的IGF-1R-β与JAK-1相互作用。 绑定 9492017
IGF1R CD221 |igfir |JTK13 |MGC142170 |MGC142172 |MGC18216 胰岛素样生长因子1受体 - HPRD,Biogrid 9492017
IL10RA CDW210A |HIL-10R |IL-10R1 |IL10R 白介素10受体,α - HPRD,Biogrid 12133952|12374810
IL10RA CDW210A |HIL-10R |IL-10R1 |IL10R 白介素10受体,α IL-10R-Alpha与JAK1相互作用。 绑定 12133952
IL21R MGC10967 |尼尔 白介素21受体 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11016959
IL27RA CRL1 |IL27R |TCCR |WSX1 |ZCYTOR1 白介素27受体,α 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12734330
IL2RB CD122 |P70-75 白介素2受体,β - HPRD,Biogrid 7973659|12133952
IL2RB CD122 |P70-75 白介素2受体,β IL-2R-β与JAK1相互作用。 绑定 12133952
IL4R CD124 |IL4RA 白介素4受体 - HPRD,Biogrid 12133952
IL4R CD124 |IL4RA 白介素4受体 JAK1与IL4R-Alpha相互作用。 绑定 12133952
IL5RA CD125 |CDW125 |HSIL5R3 |IL5R |MGC26560 白介素5受体,α - HPRD,Biogrid 9516124
IL6st CD130 |CDW130 |GP130 |GP130-RAPS |IL6R-beta 白介素6信号传感器(GP130,oncostatin M受体) - HPRD,Biogrid 11468294|11742534
IL9R CD129 白介素9受体 - HPRD,Biogrid 8756628
insr CD220 |HHF5 胰岛素受体 磷酸化的IR-BETA与JAK-1相互作用。 绑定 9492017
IRS1 hirs-1 胰岛素受体底物1 亲和力捕获 - 韦斯特恩
生化活动
Biogrid 7499365|9492017
IRS2 - 胰岛素受体底物2 - HPRD,Biogrid 7499365
JAK3 jak-3 |jak3_human |jakl |l-jak |ljak Janus激酶3(蛋白质酪氨酸激酶,白细胞) - HPRD,Biogrid 9553136
jakmip1 FLJ31564 |gababrbp |jamip1 |马林鱼1 Janus激酶和微管相互作用蛋白1 JAMIP1与JAK1相互作用。 绑定 15277531
MDK FLJ27379 |Mk |negf2 Midkine(神经突生长因子2) - HPRD 9452495
OSMR MGC150626 |MGC150627 |MGC75127 |OSMRB Onocostatin M受体 - HPRD 10586060
PIK3R1 grb1 |P85 |p85-alpha 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) - HPRD,Biogrid 9774657
plaur CD87 |UPAR |urkr 纤溶酶原激活剂,尿激酶受体 - HPRD,Biogrid 9417082
PRMT5 HRMT1L5 |IBP72 |JBP1 |Skb1 |SKB1HS 蛋白精氨酸甲基转移酶5 - HPRD,Biogrid 10531356
ptk2b Cadtk |cakb |fadk2 |fak2 |frnk |PKB |PTK |pyk2 |筏 PTK2B蛋白酪氨酸激酶2β - HPRD,Biogrid 10702271
PTPN11 bptp3 |CFC |MGC14433 |NS1 |PTP-1D |PTP2C |SH-PTP2 |sh-ptp3 |SHP2 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体11型 - HPRD,Biogrid 8995399|11036942
|12403768
PTPN6 HCP |HCPH |HPTP1C |PTP-1C |SH-PTP1 |SHP-1 |SHP-1L |SHP1 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体6型 生化活动 Biogrid 7629131
ptprc B220 |CD45 |CD45R |GP180 |LCA |ly5 |T200 蛋白酪氨酸磷酸酶,受体类型,C - HPRD 11201744
RAF1 克拉夫|NS5 |RAF-1 |C-Raf V-RAF-1鼠白血病病毒癌基因同源1 - HPRD,Biogrid 9446616
SHB RP11-3J10.8 |BA3J10.2 SRC同源性2含有衔接蛋白B的结构域 - HPRD,Biogrid 12200137
SOCS1 顺式1 |cish1 |jab |SOCS-1 |SSI-1 |SSI1 |提示3 抑制细胞因子信号传导1 - HPRD 11133764
Stam2 DKFZP564C047 |HBP |stam2a |Stam2b 信号转导适配器分子(SH3域和ITAM基序)2 - HPRD,Biogrid 10899310|10993906
Stat1 DKFZP686B04100 |ISGF-3 |Stat91 转录1,91KDA的信号换能器和激活剂 - HPRD 11722592
Stat3 APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) - HPRD,Biogrid 11722592
Stat5a MGF |Stat5 信号换能器和转录5a激活剂 - HPRD 11722592
Stat5a MGF |Stat5 信号换能器和转录5a激活剂 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 9047382
Stat5b Stat5 转录5b的信号换能器和激活因子 亲和力捕获 - 韦斯特恩
两个杂交
Biogrid 9047382
Syk dkfzp313n1010 |FLJ25043 |FLJ37489 脾酪氨酸激酶 - HPRD 10825200
tec MGC126760 |MGC126762 |PSCTK4 TEC蛋白酪氨酸激酶 - HPRD,Biogrid 9178903
tnfrsf1a CD120A |FPF |MGC19588 |TBP1 |TNF-R |tnf-r-i |TNF-R55 |tnfar |TNFR1 |TNFR55 | TNFR60 | p55 | p55-R | p60 肿瘤坏死因子受体超家族,成员1a - HPRD,Biogrid 11801527
TSHR chng1 |lgr3 |MGC75129 |htshr-i 甲状腺刺激激素受体 - HPRD,Biogrid 10809230
tyk2 JTK1 酪氨酸激酶2 - HPRD,Biogrid 7589562


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg jak stat信号通路 155 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Leishmania感染 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg胰腺癌 70 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta EGF途径 31 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL2途径 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL4途径 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL6途径 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL10途径 17 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL2RB途径 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL22BP途径 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL7途径 17 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta PDGF途径 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St Interferon Gamma途径 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B型膜片中的SIG IL4受体 27 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
圣雅克统计途径 9 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST Stat3途径 11 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST型I干扰素路径 9 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St Interleukin 4途径 26 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P73Pathway 79 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL4 2 Pathway 65 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL27途径 26 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TCPTP途径 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SHP2途径 58 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL2 1 Pathway 55 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL2 PI3K途径 34 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IFNG途径 40 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL6 7途径 47 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PDGFRA途径 22 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL2 STAT5途径 30 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IL 7信号传导 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IFN刺激基因的反应组抗病毒机制 66 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ILS的Reactome信号传导 107 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IL 3 5和GM CSF信号传导 43 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IL受体SHC信号传导 27 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IFNG信号的Reactome调节 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素伽马信号传导 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素αβ信号传导 64 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IFNA信号的反应组调节 24 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素信号传导 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IL 2信号传导 41 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IL 6信号传导 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
grabarczyk bcl11b目标 81 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Simbulan UV响应永生的DN 31 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana乳腺癌点燃int网络 101 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜蜜的克拉斯靶向 84 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素的反应 203 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLI1融合的Zhang目标 88 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
staege ewing家庭肿瘤 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
郑对砷DN的反应 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老的肌肉 244 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JI对FSH DN的响应 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
welcsh brca1靶向 198 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1自分泌目标DN 142 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍林引用1个目标1 35 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍林引用1个目标1 dn 37 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群T7 98 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3 t淋巴细胞DN中的靶标 37 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ouyang前列腺癌的进展 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindstedt树突状细胞成熟C 69 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4 DN的响应 245 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病DN 181 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai慢性肝炎与肝癌 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAE BRCA1靶向DN 32 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 259 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ivanovska mir106b目标 90 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
山乳房干细胞DN 146 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-142-5p 1303 1309 1a HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 1289 1295 M8 HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-448 1285 1291 M8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau