基因页：jarid2
概括？
| 基因 | 3720 |
| 象征 | jarid2 |
| 同义词 | JMJ |
| 描述 | Jumonji和富含2 |
| 参考 | MIM：601594|HGNC：HGNC：6196|ENSEMBL：ENSG00000008083|HPRD：03355|Vega：Otthumg0000000014293 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6P24-P23 |
| Pascal P值 | 0.519 |
| Sherlock P值 | 0.273 |
| TADA P值 | 0.023 |
| 胎儿β | 1.085 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | COMPOSITESET Ascano FMRP目标 染色质重塑基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 | 2 | 链接到Szgene |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0159 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| jarid2 | CHR6 | 15501497 | G | 一种 | NM_001267040 NM_004973 |
p.597g> s p.769g> s |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | jarid2 | 3720 | 9.49e-6 | 反式 | ||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | jarid2 | 3720 | 0.07 | 反式 | ||
| RS3118341 | Chr9 | 25185518 | jarid2 | 3720 | 0.1 | 反式 | ||
| RS2393316 | Chr10 | 59333070 | jarid2 | 3720 | 0.02 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | jarid2 | 3720 | 5.528e-8 | 反式 | ||
| RS1041786 | CHR21 | 22617710 | jarid2 | 3720 | 0.01 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SCN8A | 0.97 | 0.95 |
| grin2a | 0.96 | 0.80 |
| KCNMA1 | 0.95 | 0.90 |
| ARHGAP26 | 0.95 | 0.88 |
| ATP2B2 | 0.94 | 0.94 |
| DLGAP2 | 0.94 | 0.88 |
| PLCB1 | 0.94 | 0.90 |
| GABRB2 | 0.94 | 0.89 |
| KCNH1 | 0.93 | 0.77 |
| BSN | 0.93 | 0.91 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Bcl7c | -0.46 | -0.56 |
| AC006276.2 | -0.44 | -0.47 |
| C9orf46 | -0.42 | -0.46 |
| RPL35 | -0.41 | -0.54 |
| RPLP1 | -0.41 | -0.49 |
| RPL23A | -0.41 | -0.47 |
| Rab13 | -0.40 | -0.53 |
| GTF3C6 | -0.40 | -0.39 |
| EFEMP2 | -0.40 | -0.39 |
| RPL36 | -0.40 | -0.49 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003677 | DNA结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| GO：0016564 | 转录阻遏活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007417 | 中枢神经系统发展 | 塔斯 | 大脑（GO期限：6） | 8894700 |
| GO：0000122 | RNA聚合酶II启动子的转录负调控 | IEA | - | |
| 去：0001889 | 肝脏发育 | IEA | - | |
| 去：0006350 | 转录 | IEA | - | |
| 去：0008285 | 细胞增殖的阴性调节 | IEA | - | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
| GO：0048536 | 脾脏发展 | IEA | - | |
| GO：0048538 | 胸腺发育 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 | 234 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向F | 185 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Oct4目标 | 290 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath NOS目标 | 179 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mori前BI淋巴细胞DN | 77 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mori未成熟B淋巴细胞向上 | 53 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tenedini Megakaryocyte标记 | 66 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FAELT B CLL具有VH重排DN | 48 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dazard对UV SCC DN的响应 | 123 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yamazaki TCEB3靶向DN | 215 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王顺铂响应和XPC向上 | 202 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dazard UV响应集群G6 | 153 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| safford t淋巴细胞厌食 | 87 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性4 | 307 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng Foxp3目标胸腺 | 196 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen去分化状态 | 8 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |