基因页:CD82
概括?
基因 | 3732 |
象征 | CD82 |
同义词 | 4F9 | C33 | GR15 | IA4 | KAI1 | R2 | SAR2 | ST6 | TSPAN27 |
描述 | CD82分子 |
参考 | MIM:600623|HGNC:HGNC:6210|ENSEMBL:ENSG00000085117|HPRD:09004|Vega:Otthumg00000166472 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P11.2 |
Pascal P值 | 0.006 |
主持人 | 海马 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0275 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2198151 | Chr11 | 45475603 | CD82 | 3732 | 0.2 | 顺式 | ||
RS11038480 | Chr11 | 45481556 | CD82 | 3732 | 0.14 | 顺式 | ||
RS896338 | Chr11 | 45487120 | CD82 | 3732 | 0.14 | 顺式 | ||
RS10769153 | Chr11 | 45499023 | CD82 | 3732 | 0.18 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CD82_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GDPD5 | 0.86 | 0.86 |
FAM20C | 0.78 | 0.83 |
CHRNB2 | 0.77 | 0.83 |
AP1B1 | 0.77 | 0.85 |
SLC38A7 | 0.77 | 0.85 |
PVR | 0.76 | 0.83 |
RRP12 | 0.76 | 0.86 |
grwd1 | 0.76 | 0.81 |
ZDHHC5 | 0.75 | 0.83 |
DTX2 | 0.75 | 0.72 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.57 | -0.67 |
AF347015.21 | -0.55 | -0.72 |
MT-CO2 | -0.54 | -0.65 |
AF347015.8 | -0.54 | -0.65 |
COPZ2 | -0.53 | -0.64 |
AL139819.3 | -0.53 | -0.66 |
AF347015.2 | -0.53 | -0.61 |
higd1b | -0.52 | -0.64 |
AF347015.27 | -0.52 | -0.65 |
AF347015.33 | -0.52 | -0.62 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15205336 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | 塔斯 | 7754374 | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 1842498 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
Bcl3 | bcl4 |D19S37 | B细胞CLL/淋巴瘤3 | Bcl3与CD82(KAI1)启动子相互作用。 | 绑定 | 15829968 |
canx | CNX |FLJ26570 |IP90 |P90 | 钙粘蛋白 | - | HPRD | 11350933 |
CD151 | GP27 |MER2 |PETA-3 |raph |sfa1 |TSPAN24 | CD151分子(Raph Blood群) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15492270 |
CD19 | B4 |MGC12802 | CD19分子 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 7636191|9804823 |
CD4 | CD4MUT | CD4分子 | - | HPRD,Biogrid | 7636191 |
CD46 | MCP |MGC26544 |MIC10 |TLX |Tra2.10 | CD46分子,补体调节蛋白 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10741407 |
CD63 | LAMP-3 |ME491 |MLA1 |OMA81H |TSPAN30 | CD63分子 | - | HPRD,Biogrid | 9759843 |
CD9 | 5H9 |BA2 |BTCC-1 |DARAP-27 |Gig2 |MIC3 |MRP-1 |p24 |TSPAN29 | CD9分子 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15492270 |
CTNNB1 | ctnnb |DKFZP686D02253 |FLJ25606 |FLJ37923 | Catenin(cadherin相关蛋白),β1,88KDA | CTNNB1(β-catenin)与CD82(KAI1)启动子相互作用。 | 绑定 | 15829968 |
egfr | ERBB |ERBB1 |her1 |PIG61 |梅纳 | 表皮生长因子受体(红细胞性白血病病毒(V-ERB-B)癌基因同源物,鸟类) | - | HPRD,Biogrid | 10985391 |
ERBB2 | CD340 |her-2 |her-2/neu |her2 |neu |ngl |TKR1 | V-ERB-B2红细胞白血病病毒性癌基因同源2,神经/胶质母细胞瘤衍生的癌基因同源物(Avian) | - | HPRD,Biogrid | 14576349 |
ERBB3 | ERBB-3 |Her3 |LCCS2 |MDA-BF-1 |MGC88033 |C-ERBB-3 |C-ERBB3 |ERBB3-S |P180-ERBB3 |p45-serbb3 | p85-sErbB3 | V-ERB-B2红细胞白血病病毒癌基因同源物3(Avian) | - | HPRD,Biogrid | 14576349 |
HBEGF | DTR |DTS |DTSF |HEGFL | 肝素结合EGF样生长因子 | - | HPRD,Biogrid | 10749879 |
HLA-DMA | D6S222E |DMA |hladm |ring6 | 主要的组织相容性复合物,II类,DM alpha | - | HPRD | 9759843 |
HLA-DMB | D6S221E |ring7 | 主要的组织相容性复合物,II类,DM Beta | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9759843 |
HLA-DOB | 多布 | 主要的组织相容性复合物,II类DO Beta | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9759843 |
HLA-DRA | HLA-DRA1 | 主要的组织相容性复合物,II类,Alpha博士 | - | HPRD,Biogrid | 9759843 |
IGSF8 | CD316 |CD81P3 |ewi2 |pgrl | 免疫球蛋白超家族,成员8 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12750295 |
itga3 | CD49C |FLJ34631 |FLJ34704 |GAP-B3 |GAPB3 |MSK18 |VCA-2 |VL3A |vla3a | 整合素,α3(抗原CD49C,alpha 3的VLA-3受体亚基) | - | HPRD | 8757325 |
itga4 | CD49D |IA4 |MGC90518 | 整合素,α4(抗原CD49D,alpha 4的VLA-4受体亚基) | - | HPRD | 8757325 |
itga6 | CD49F |DKFZP686J01244 |FLJ18737 |itga6b |VLA-6 | 整合素,alpha 6 | - | HPRD | 8757325 |
itgal | CD11A |LFA-1 |LFA1A | 整合素,αL(抗原CD11a(P180),淋巴细胞功能相关抗原1;α多肽) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10602019 |
ITGB1 | CD29 |fnrb |GPIIA |MDF2 |MSK12 |vla-beta |vlab | 整合素,β1(纤连蛋白受体,β多肽,抗原CD29包括MDF2,MSK12) | - | HPRD | 8757325 |
ITGB2 | CD18 |小伙子|lcamb |LFA-1 |Mac-1 |MF17 |MFI7 | 整合素,β2(补体组件3受体3和4亚基) | - | HPRD | 10602019 |
Kat5 | esa1 |htatip |htatip1 |plip |提示|TIP60 |CPLA2 | K(赖氨酸)乙酰转移酶5 | HTATIP(TIP60)与CD82(KAI1)启动子相互作用。 | 绑定 | 15829968 |
LRP1 | A2MR |apoer |APR |CD91 |FLJ16451 |IGFBP3R |LRP |MGC88725 |TGFBR5 | 低密度脂蛋白相关蛋白1(Alpha-2-巨球蛋白受体) | - | HPRD | 9804823 |
MAP3K1 | mapkkk1 |mekk |mekk1 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶1 | MAP3K1(MEKK1)与CD82(KAI1)启动子相互作用。 | 绑定 | 15829968 |
MAP3K7IP2 | FLJ21885 |KIAA0733 |TAB2 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶7相互作用蛋白2 | MAP3K7IP2(TAB2)的未指定同工型与CD82(KAI1)启动子相互作用。 | 绑定 | 15829968 |
NCOR1 | KIAA1047 |MGC104216 |n-cor |trac1 |HCIT529I10 |hn-cor | 核受体共抑制剂1 | NCOR1(N-COR)与CD82(KAI1)启动子相互作用。 | 绑定 | 15829968 |
NFKB1 | DKFZP686C01211 |EBP-1 |kbf1 |MGC54151 |nf-kappa-b |NFKB-P105 |NFKB-P50 |P105 | B细胞中Kappa光多肽基因增强子的核因子1 | NFKB1(p50)与CD82(KAI1)启动子相互作用。 | 绑定 | 15829968 |
polr2a | MGC75453 |polr2 |波拉|RPB1 |RPBH1 |RPO2 |rpol2 |rpiils |HRPB220 |HSRPB1 | 聚合酶(RNA)II(定向DNA)多肽A,220KDA | POLR2A(POL II)与CD82(KAI1)启动子相互作用。 | 绑定 | 15829968 |
ptgfrn | CD315 |CD9P-1 |ewi-f |FLJ11001 |FPRP |KIAA1436 |SMAP-6 | 前列腺素F2受体阴性调节剂 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11278880 |
ruvbl1 | ECP54 |ino80h |NMP238 |Pontin |Pontin52 |RVB1 |tih1 |TIP49 |TIP49A | ruvb样1(大肠杆菌) | RUVBL1(Pontin)与CD82(KAI1)启动子相互作用。 | 绑定 | 15829968 |
ruvbl2 | CGI-46 |ECP51 |ino80j |reptin |RVB2 |tih2 |TIP48 |TIP49B | ruvb样2(大肠杆菌) | RUVBL2(Reptin)与CD82(KAI1)启动子相互作用。 | 绑定 | 15829968 |
vangl1 | lpp2 |MGC5338 |stb2 |STBM2 | vang like 1(van Gogh,果蝇) | - | HPRD | 15205336 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG P53信号通路 | 69 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P53下游途径 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID时代基因组途径 | 65 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 | 187 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee神经Crest干细胞DN | 118 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
兰迪斯乳腺癌进展 | 44 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
landis erbb2乳腺癌 | 20 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis Erbb2乳腺肿瘤324向上 | 150 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gotzmann上皮到间充质过渡dn | 206 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过CTNNB1发出的CDH1信号传导 | 83 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delaserna Myod的目标 | 89 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verrecchia对TGFB1 C2的反应 | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verrecchia对TGFB1的早期反应 | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莫雷拉对TSA的反应 | 28 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
约瑟夫对丁酸钠的反应 | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi Plasmacytoma Up | 259 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应DN | 209 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向DN | 242 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vanloo SP3靶向DN | 89 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过p38完成的phong TNF响应 | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |