基因页面:KCNA3
总结吗?
| GeneID | 3738年 |
| 象征 | KCNA3 |
| 同义词 | HGK5 | HLK3 | HPCN3 | HUKIII | KV1.3 | MK3 | PCN3 |
| 描述 | 电压门控钾通道亚科3一员 |
| 参考 | MIM: 176263|HGNC: HGNC: 6221|运用:ENSG00000177272|HPRD: 15937|织女:OTTHUMG00000034493 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1 p13.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.344 |
| 胎儿β | -0.535 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0235 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CLCN4 | 0.78 | 0.84 |
| ERC2 | 0.78 | 0.86 |
| CLSTN2 | 0.78 | 0.87 |
| PRICKLE2 | 0.77 | 0.81 |
| ADRBK2 | 0.77 | 0.86 |
| HECW2 | 0.77 | 0.80 |
| NRCAM | 0.76 | 0.81 |
| ITGA9 | 0.76 | 0.81 |
| ZYG11B | 0.75 | 0.82 |
| ASTN1 | 0.74 | 0.80 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD1 | -0.53 | -0.62 |
| RAB34 | -0.53 | -0.63 |
| TLCD1 | -0.51 | -0.59 |
| HIGD1B | -0.51 | -0.63 |
| AF347015.31 | -0.50 | -0.61 |
| ACSF2 | -0.50 | -0.61 |
| MT-CO2 | -0.50 | -0.63 |
| AF347015.33 | -0.50 | -0.59 |
| AF347015.21 | -0.50 | -0.62 |
| SLC25A18 | -0.50 | -0.58 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005244 | 电压门控离子通道的活动 | 助教 | 1373731 | |
| 去:0005251 | 延迟整流钾通道的活动 | 助教 | 1986382 | |
| 去:0030955 | 钾离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006811 | 离子传输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006813 | 钾离子运输 | 助教 | 1373731 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008076 | 电压门控钾通道复杂 | 助教 | 1373731 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME神经系统 | 279年 | 221年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME电压门控钾离子通道 | 43 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME钾离子通道 | 98年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘VMYB VS CMYB DN的目标 | 43 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH PRC2目标 | 652年 | 441年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森受FOXP3刺激 | 1022年 | 619年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K4ME2和H3K27ME3 | 349年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 210年 | 148年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应通过TP53 D组 | 280年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 203.1 | 78年 | 84年 | m8 | hsa - mir - 203 | UGAAAUGUUUAGGACCACUAG |
| miR-204/211 | 600年 | 607年 | 1、m8 | hsa - mir - 204大脑 | UUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCU |
| hsa - mir - 211 | UUCCCUUUGUCAUCCUUCGCCU | ||||
| miR-21 | 800年 | 806年 | m8 | hsa-miR-21大脑 | UAGCUUAUCAGACUGAUGUUGA |
| hsa - mir - 590 | GAGCUUAUUCAUAAAAGUGCAG | ||||
| mir - 217 | 879年 | 885年 | m8 | hsa - mir - 217 | UACUGCAUCAGGAACUGAUUGGAU |
| mir - 218 | 122年 | 128年 | m8 | hsa - mir - 218大脑 | UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU |
| miR-30-3p | 158年 | 164年 | m8 | hsa-miR-30a-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC |
| hsa-miR-30e-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC | ||||