概括
基因 3739
象征 KCNA4
同义词 hbk4 | hk1 | hpcn2 | hukii | kcna4l | kcna8 | kv1.4 | pcn2
描述 钾电源门控通道亚家族成员4
参考 MIM:176266|HGNC:HGNC:6222|ENSEMBL:ENSG00000182255|HPRD:01444|Vega:Otthumg00000166144
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P14
Pascal P值 0.025
Sherlock P值 0.978
支持 兴奋性

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PRDX3 0.57 0.57
Phyh 0.57 0.58
Selt 0.56 0.60
NGB 0.54 0.53
PCCB 0.54 0.54
glo1 0.53 0.53
KCNMB2 0.53 0.53
DHRS7B 0.52 0.54
smyd2 0.52 0.53
commd10 0.51 0.53
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
淫秽 -0.46 -0.33
ZNF814 -0.43 -0.46
AC005921.3 -0.42 -0.48
UPF3A -0.42 -0.43
ZRSR1 -0.41 -0.42
C1orf145 -0.41 -0.27
AC010522.1 -0.40 -0.36
ZNF587 -0.39 -0.36
AC004148.1 -0.38 -0.41
ZNF552 -0.37 -0.36

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
DLG1 DKFZP761P0818 |DKFZP781B0426 |dlgh1 |SAP97 |DJ1061C18.1.1 |HDLG 圆盘,大型同源物1(果蝇) - HPRD,Biogrid 12860415
DLG2 DKFZP781D1854 |DKFZP781E0954 |FLJ37266 |MGC131811 |PSD-93 圆盘,大型同源物2,Chapsyn-1110(果蝇) - HPRD,Biogrid 11997254
DLG4 FLJ97752 |FLJ98574 |PSD95 |SAP90 圆盘,大型同源物4(果蝇) - HPRD 8938729|9581762
|12435606
DLG4 FLJ97752 |FLJ98574 |PSD95 |SAP90 圆盘,大型同源物4(果蝇) 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 8938729|9581762
|11997254|12435606
DLGAP1 DAP-1 |DAP-1-Alpha |DAP-1-beta |gkap |MGC88156 |SAPAP1 |HGKAP 圆盘,大(果蝇)同源物相关蛋白1 - HPRD 9024696
erbb2ip Erbin |LAP2 ERBB2相互作用蛋白 重构的复合物 Biogrid 11278603
KCNA1 aemk |EA1 |HBK1 |huk1 |KV1.1 |MBK1 |MGC126782 |MGC138385 |Mk1 |RBK1 钾电压门控通道,与振动器相关的亚家族,成员1(肌动物的情节性共济失调) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 10428084
KCNA2 HBK5 |HK4 |Hukiv |KV1.2 |MGC50217 |Mk2 |ngk1 |RBK2 钾电压门控通道,与振动振动器相关的亚家族,成员2 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 10428084
KCNA3 HGK5 |HLK3 |HPCN3 |Hukiii |KV1.3 |Mk3 |PCN3 钾电压门控通道,与振动振动器相关的亚家族,成员3 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 10428084
NDUFA4L2 FLJ26118 |nuoms NADH脱氢酶(泛氨基酮)1α子复杂,4类样2 两个杂交 Biogrid 16169070
SAT1 DC21 |KFSD |星期六|SSAT |SSAT-1 精子/精子N1-乙酰转移酶1 两个杂交 Biogrid 16169070
SNTG1 g1syn |SYN4 Syntrophin,伽马1 - HPRD 11352924


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome电压门控钾通道 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome钾通道 98 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova在APL中甲基化 68 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Creb1靶向DN 57 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈里斯脑癌祖细胞 44 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D DN 270 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向DN 68 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 204 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 ICP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 34 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF ICP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 38 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang MLL目标 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因