基因页:KCNA4
概括?
基因 | 3739 |
象征 | KCNA4 |
同义词 | hbk4 | hk1 | hpcn2 | hukii | kcna4l | kcna8 | kv1.4 | pcn2 |
描述 | 钾电源门控通道亚家族成员4 |
参考 | MIM:176266|HGNC:HGNC:6222|ENSEMBL:ENSG00000182255|HPRD:01444|Vega:Otthumg00000166144 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P14 |
Pascal P值 | 0.025 |
Sherlock P值 | 0.978 |
支持 | 兴奋性 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KCNA4_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PRDX3 | 0.57 | 0.57 |
Phyh | 0.57 | 0.58 |
Selt | 0.56 | 0.60 |
NGB | 0.54 | 0.53 |
PCCB | 0.54 | 0.54 |
glo1 | 0.53 | 0.53 |
KCNMB2 | 0.53 | 0.53 |
DHRS7B | 0.52 | 0.54 |
smyd2 | 0.52 | 0.53 |
commd10 | 0.51 | 0.53 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
淫秽 | -0.46 | -0.33 |
ZNF814 | -0.43 | -0.46 |
AC005921.3 | -0.42 | -0.48 |
UPF3A | -0.42 | -0.43 |
ZRSR1 | -0.41 | -0.42 |
C1orf145 | -0.41 | -0.27 |
AC010522.1 | -0.40 | -0.36 |
ZNF587 | -0.39 | -0.36 |
AC004148.1 | -0.38 | -0.41 |
ZNF552 | -0.37 | -0.36 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
DLG1 | DKFZP761P0818 |DKFZP781B0426 |dlgh1 |SAP97 |DJ1061C18.1.1 |HDLG | 圆盘,大型同源物1(果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 12860415 |
DLG2 | DKFZP781D1854 |DKFZP781E0954 |FLJ37266 |MGC131811 |PSD-93 | 圆盘,大型同源物2,Chapsyn-1110(果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 11997254 |
DLG4 | FLJ97752 |FLJ98574 |PSD95 |SAP90 | 圆盘,大型同源物4(果蝇) | - | HPRD | 8938729|9581762 |12435606 |
DLG4 | FLJ97752 |FLJ98574 |PSD95 |SAP90 | 圆盘,大型同源物4(果蝇) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 8938729|9581762 |11997254|12435606 |
DLGAP1 | DAP-1 |DAP-1-Alpha |DAP-1-beta |gkap |MGC88156 |SAPAP1 |HGKAP | 圆盘,大(果蝇)同源物相关蛋白1 | - | HPRD | 9024696 |
erbb2ip | Erbin |LAP2 | ERBB2相互作用蛋白 | 重构的复合物 | Biogrid | 11278603 |
KCNA1 | aemk |EA1 |HBK1 |huk1 |KV1.1 |MBK1 |MGC126782 |MGC138385 |Mk1 |RBK1 | 钾电压门控通道,与振动器相关的亚家族,成员1(肌动物的情节性共济失调) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10428084 |
KCNA2 | HBK5 |HK4 |Hukiv |KV1.2 |MGC50217 |Mk2 |ngk1 |RBK2 | 钾电压门控通道,与振动振动器相关的亚家族,成员2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10428084 |
KCNA3 | HGK5 |HLK3 |HPCN3 |Hukiii |KV1.3 |Mk3 |PCN3 | 钾电压门控通道,与振动振动器相关的亚家族,成员3 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10428084 |
NDUFA4L2 | FLJ26118 |nuoms | NADH脱氢酶(泛氨基酮)1α子复杂,4类样2 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
SAT1 | DC21 |KFSD |星期六|SSAT |SSAT-1 | 精子/精子N1-乙酰转移酶1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
SNTG1 | g1syn |SYN4 | Syntrophin,伽马1 | - | HPRD | 11352924 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome电压门控钾通道 | 43 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome钾通道 | 98 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nouzova在APL中甲基化 | 68 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung Creb1靶向DN | 57 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈里斯脑癌祖细胞 | 44 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN NPAS4靶向DN | 68 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 | 204 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 ICP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 34 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF ICP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 38 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |