基因页：C12orf42

概括？
基因 374470
象征 C12orf42
同义词 -
描述 染色体12开放阅读框42
参考 HGNC：HGNC：24729|ENSEMBL：ENSG00000179088|HPRD：13393|Vega：Otthumg00000169988
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12q23.2
Pascal P值 0.002
胎儿β 0.005
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
简历：PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历：PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS10860964 CHR12 103596455 TC 9.921E-8 基因间 LOC101929058，C12ORF42 dist = 34369; dist = 99264

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG16775198 12 103885883 C12orf42 2.72E-5 0.243 0.018 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Gaussmann MLL AF4融合靶向 191 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因