基因页面:KCNC3

总结吗?
GeneID 3748年
象征 KCNC3
同义词 KSHIIID | KV3.3 | SCA13
描述 电压门控钾通道亚科3 C成员
参考 MIM: 176264|HGNC: HGNC: 6235|运用:ENSG00000131398|HPRD: 08886|织女:OTTHUMG00000044580
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 19 q13.33
帕斯卡假定值 0.018
胎儿β -0.842
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式
支持 CompositeSet
达内尔FMRP目标

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg13378394 19 50831811 KCNC3 1.485的军医 -0.242 0.032 DMG: Wockner_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs17714461 chr19 51425105 KCNC3 3748年 0.08 独联体

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
GLUD1 0.86 0.83
GJA1 0.81 0.79
EDNRB 0.81 0.84
GLUD2 0.81 0.81
PLSCR4 0.80 0.83
RAB31 0.79 0.83
S1PR1 0.78 0.71
SLC15A2 0.77 0.81
SUCLG2 0.76 0.76
PIPOX 0.76 0.78
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
RTF1 -0.44 -0.58
DBN1 -0.40 -0.53
TMEM81 -0.40 -0.53
LDB1 -0.40 -0.53
BZW2 -0.40 -0.56
USF1 -0.40 -0.55
UCK2 -0.40 -0.53
ZNF589 -0.40 -0.50
GMEB1 -0.40 -0.52
DPF1 -0.39 -0.51

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
REACTOME神经系统 279年 221年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME电压门控钾离子通道 43 32 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME钾离子通道 98年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
YOSHIMURA MAPK8目标了 1305年 895年 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 1069年 729年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 435年 318年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 590年 403年 所有SZGR 2.0基因通路