基因页:ATP9B
概括?
基因 | 374868 |
象征 | ATP9B |
同义词 | atpasep | atpiib | hussy-20 | neo1l | hmmr1 |
描述 | ATPase磷脂运输9B(推定) |
参考 | MIM:614446|HGNC:HGNC:13541|ENSEMBL:ENSG00000166377|HPRD:16528|Vega:Otthumg00000132898 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 18Q23 |
Pascal P值 | 0.477 |
Sherlock P值 | 0.042 |
胎儿β | 0.936 |
主持人 | 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11634651 | CHR15 | 86093925 | ATP9B | 374868 | 0.14 | 反式 | ||
RS17618909 | CHR15 | 86095461 | ATP9B | 374868 | 0.07 | 反式 | ||
RS11633893 | CHR15 | 86148437 | ATP9B | 374868 | 0.09 | 反式 | ||
RS17635450 | CHR15 | 86199048 | ATP9B | 374868 | 0.13 | 反式 | ||
RS11631660 | CHR15 | 86215411 | ATP9B | 374868 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ATP9B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
P型ATPases的Reactome离子传输 | 34 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome离子通道传输 | 55 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
igarashi atf4靶向dn | 90 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 | 275 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg KDM3A靶向缺氧 | 208 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |