基因页:FAM73A
概括?
基因 | 374986 |
象征 | FAM73A |
同义词 | MIGA1 |
描述 | 具有序列相似性的家庭73成员A |
参考 | MIM:616773|HGNC:HGNC:24741|ENSEMBL:ENSG00000180488|HPRD:13415|Vega:Otthumg00000009766 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p31.1 |
Pascal P值 | 0.04 |
Sherlock P值 | 0.084 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.02692 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS3769467 | CHR2 | 201205340 | FAM73A | 374986 | 0.06 | 反式 | ||
RS3769461 | CHR2 | 201222657 | FAM73A | 374986 | 0.06 | 反式 | ||
RS9851931 | CHR3 | 191826057 | FAM73A | 374986 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FAM73A_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Basaki YBX1靶向DN | 384 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合目标F DN | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性5 | 482 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-125/351 | 105 | 111 | 1a | HSA-MIR-125B脑 | ucccugagacccuaacuuguga |
HSA-MIR-125A脑 | ucccugagacccuuaaccugug | ||||
mir-130/301 | 2658 | 2665 | 1A,M8 | HSA-MIR-130A脑 | cagugcaauguaaaaggggau |
HSA-MIR-301 | cagugcaauaugucaaagc | ||||
HSA-MIR-130b脑 | Cagugcaaugaagggauggau | ||||
HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu |