基因页:KCNE1
概括?
基因 | 3753 |
象征 | KCNE1 |
同义词 | ISK | JLNS | JLNS2 | LQT2/5 | LQT5 | Mink |
描述 | 钾电场门控通道亚家族E监管亚基1 |
参考 | MIM:176261|HGNC:HGNC:6240|Ensembl:ENSG00000180509|HPRD:01442|Vega:Otthumg00000086236 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 21q22.12 |
Pascal P值 | 0.205 |
胎儿β | 0.435 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | 兴奋性 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1578978 | CHR8 | 118196802 | KCNE1 | 3753 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KCNE1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KCNB1 | 0.95 | 0.90 |
SCN8A | 0.95 | 0.84 |
CNNM1 | 0.93 | 0.88 |
C2ORF21 | 0.93 | 0.90 |
ARHGAP26 | 0.93 | 0.88 |
AADACL1 | 0.93 | 0.92 |
CMTM4 | 0.92 | 0.91 |
纳尔克 | 0.92 | 0.86 |
GABRB2 | 0.92 | 0.86 |
grin2a | 0.92 | 0.84 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Bcl7c | -0.51 | -0.61 |
C9orf46 | -0.48 | -0.52 |
RPL23A | -0.48 | -0.55 |
exosc8 | -0.46 | -0.45 |
C21orf57 | -0.46 | -0.53 |
GTF3C6 | -0.46 | -0.48 |
RPL35 | -0.46 | -0.54 |
RPLP1 | -0.45 | -0.52 |
RPS6 | -0.45 | -0.52 |
rps19p3 | -0.45 | -0.58 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |