概括
基因 3753
象征 KCNE1
同义词 ISK | JLNS | JLNS2 | LQT2/5 | LQT5 | Mink
描述 钾电场门控通道亚家族E监管亚基1
参考 MIM:176261|HGNC:HGNC:6240|Ensembl:ENSG00000180509|HPRD:01442|Vega:Otthumg00000086236
基因类型 蛋白质编码
地图位置 21q22.12
Pascal P值 0.205
胎儿β 0.435
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 兴奋性

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1578978 CHR8 118196802 KCNE1 3753 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KCNB1 0.95 0.90
SCN8A 0.95 0.84
CNNM1 0.93 0.88
C2ORF21 0.93 0.90
ARHGAP26 0.93 0.88
AADACL1 0.93 0.92
CMTM4 0.92 0.91
纳尔克 0.92 0.86
GABRB2 0.92 0.86
grin2a 0.92 0.84
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Bcl7c -0.51 -0.61
C9orf46 -0.48 -0.52
RPL23A -0.48 -0.55
exosc8 -0.46 -0.45
C21orf57 -0.46 -0.53
GTF3C6 -0.46 -0.48
RPL35 -0.46 -0.54
RPLP1 -0.45 -0.52
RPS6 -0.45 -0.52
rps19p3 -0.45 -0.58

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Liu Sox4靶向DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌DN 349 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因