基因页：PNPLA7

概括？
基因 375775
象征 PNPLA7
同义词 c9orf111 | nte-r1 | ntel1
描述 patatin类似于含7的磷脂酶结构域
参考 MIM：612122|HGNC：HGNC：24768|Ensembl：ENSG00000130653|HPRD：12933|Vega：Otthumg00000020990
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9Q34.3
Pascal P值 0.266
Sherlock P值 0.356
胎儿β -0.599
DMG 1（＃研究）
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别
元

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 2
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG01111842 9 140444966 PNPLA7; MRPL41 3.62E-5 -0.273 0.02 DMG：Wockner_2014
CG17959722 9 140446823 PNPLA7 8.51E-5 -3.253 DMG：Vaneijk_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS9288129 CHR2 187302875 PNPLA7 375775 0.08 反式
RS10497671 CHR2 187374602 PNPLA7 375775 0.11 反式
RS10497672 0 PNPLA7 375775 0.01 反式
RS2254149 9 140441177 PNPLA7 ENSG00000130653.11 6.36237E-7 0.01 3809 gtex_brain_putamen_basal
RS10746563 9 140444078 PNPLA7 ENSG00000130653.11 1.42294E-6 0.01 908 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Koyama Sema3b靶向 292 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Weng Por靶向肝脏DN 20 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN 274 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ohguchi肝HNF4A靶向DN 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因