概括
基因 3761
象征 KCNJ4
同义词 hir | hirk2 | hrk1 | irk-3 | irk3 | kir2.3
描述 钾电源门控通道亚家族j成员4
参考 MIM:600504|HGNC:HGNC:6265|ENSEMBL:ENSG00000168135|HPRD:02738|Vega:Otthumg00000151131
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q13.1
Pascal P值 0.015
Sherlock P值 0.956
胎儿β -2.062
支持 兴奋性
G2CDB.HUMAN_TAP-PSD-95核
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
myo5a 0.89 0.91
CDKL5 0.89 0.92
hecw2 0.87 0.88
刺。2 0.87 0.88
pclo 0.86 0.89
inpp4a 0.86 0.88
FAM20B 0.86 0.88
DLG3 0.86 0.87
mef2a 0.86 0.87
ASTN1 0.85 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Rab34 -0.54 -0.63
AL139819.3 -0.54 -0.60
AP002478.3 -0.53 -0.61
FXYD1 -0.53 -0.55
AF347015.21 -0.52 -0.56
ACSF2 -0.52 -0.57
higd1b -0.52 -0.57
AC021016.1 -0.52 -0.56
TLCD1 -0.51 -0.54
DBI -0.51 -0.61

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
CAGH39 |CMG |FLJ22219 |FLJ31914 |lin2 |Micpch |TNRC8 钙/钙调蛋白依赖性丝氨酸蛋白激酶(Maguk家族) - HPRD 11742811
CAGH39 |CMG |FLJ22219 |FLJ31914 |lin2 |Micpch |TNRC8 钙/钙调蛋白依赖性丝氨酸蛋白激酶(Maguk家族) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 14960569|15024025
DLG1 DKFZP761P0818 |DKFZP781B0426 |dlgh1 |SAP97 |DJ1061C18.1.1 |HDLG 圆盘,大型同源物1(果蝇) 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 11181181|14960569
|15024025
DLG2 DKFZP781D1854 |DKFZP781E0954 |FLJ37266 |MGC131811 |PSD-93 圆盘,大型同源物2,Chapsyn-1110(果蝇) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11997254
DLG4 FLJ97752 |FLJ98574 |PSD95 |SAP90 圆盘,大型同源物4(果蝇) 亲和力捕获 - 韦斯特恩
两个杂交
Biogrid 10627592|11997254
|14960569
DMD BMD |CMD3B |DXS142 |DXS164 |DXS206 |DXS230 |DXS239 |DXS268 |DXS269 |DXS270 | DXS272 肌营养不良 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 15024025
gngt2 G-Gamma-8 |G-Gamma-C |gng8 |gng9 |gngt8 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),伽马转导活性多肽2 - HPRD,Biogrid 8943291
IL16 FLJ16806 |FLJ42735 |FLJ44234 |HST19289 |IL-16 |LCF |Pril-16 白介素16(淋巴细胞趋化因子) - HPRD,Biogrid 10479680
lin7a lin-7a |lin7 |mals-1 |MGC148143 |提示-33 |veli1 LIN-7同源物A(秀丽隐杆线虫) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 14960569
lin7b lin-7b |mals-2 |mals2 |veli2 LIN-7同源物B(秀丽隐杆线虫) 亲和力捕获 - 韦斯特恩
两个杂交
Biogrid 11742811
lin7c FLJ11215 |Lin-7-C |lin-7c |mals-3 |mals3 |veli3 LIN-7同源物C(秀丽隐杆线虫) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 14960569|15024025
SNTA1 SNT1 |tacip1 |DJ1187J4.5 Syntrophin,Alpha 1(肌营养不良蛋白相关的蛋白A1,59KDA,酸性成分) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 15024025


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 137 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过GBETA伽马亚基对电压门控Ca2通道的反应组抑制 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GABA B受体激活 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GABA受体激活 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome钾通道 98 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组向内纠正K通道 31 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP 309 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌DN 203 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 94 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iizuka肝癌进展G1 G2 UP 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 common 77 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 142 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因