基因页:KCNJ4
概括?
基因 | 3761 |
象征 | KCNJ4 |
同义词 | hir | hirk2 | hrk1 | irk-3 | irk3 | kir2.3 |
描述 | 钾电源门控通道亚家族j成员4 |
参考 | MIM:600504|HGNC:HGNC:6265|ENSEMBL:ENSG00000168135|HPRD:02738|Vega:Otthumg00000151131 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q13.1 |
Pascal P值 | 0.015 |
Sherlock P值 | 0.956 |
胎儿β | -2.062 |
支持 | 兴奋性 G2CDB.HUMAN_TAP-PSD-95核 g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KCNJ4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
myo5a | 0.89 | 0.91 |
CDKL5 | 0.89 | 0.92 |
hecw2 | 0.87 | 0.88 |
刺。2 | 0.87 | 0.88 |
pclo | 0.86 | 0.89 |
inpp4a | 0.86 | 0.88 |
FAM20B | 0.86 | 0.88 |
DLG3 | 0.86 | 0.87 |
mef2a | 0.86 | 0.87 |
ASTN1 | 0.85 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Rab34 | -0.54 | -0.63 |
AL139819.3 | -0.54 | -0.60 |
AP002478.3 | -0.53 | -0.61 |
FXYD1 | -0.53 | -0.55 |
AF347015.21 | -0.52 | -0.56 |
ACSF2 | -0.52 | -0.57 |
higd1b | -0.52 | -0.57 |
AC021016.1 | -0.52 | -0.56 |
TLCD1 | -0.51 | -0.54 |
DBI | -0.51 | -0.61 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
桶 | CAGH39 |CMG |FLJ22219 |FLJ31914 |lin2 |Micpch |TNRC8 | 钙/钙调蛋白依赖性丝氨酸蛋白激酶(Maguk家族) | - | HPRD | 11742811 |
桶 | CAGH39 |CMG |FLJ22219 |FLJ31914 |lin2 |Micpch |TNRC8 | 钙/钙调蛋白依赖性丝氨酸蛋白激酶(Maguk家族) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14960569|15024025 |
DLG1 | DKFZP761P0818 |DKFZP781B0426 |dlgh1 |SAP97 |DJ1061C18.1.1 |HDLG | 圆盘,大型同源物1(果蝇) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 11181181|14960569 |15024025 |
DLG2 | DKFZP781D1854 |DKFZP781E0954 |FLJ37266 |MGC131811 |PSD-93 | 圆盘,大型同源物2,Chapsyn-1110(果蝇) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11997254 |
DLG4 | FLJ97752 |FLJ98574 |PSD95 |SAP90 | 圆盘,大型同源物4(果蝇) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 10627592|11997254 |14960569 |
DMD | BMD |CMD3B |DXS142 |DXS164 |DXS206 |DXS230 |DXS239 |DXS268 |DXS269 |DXS270 | DXS272 | 肌营养不良 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15024025 |
gngt2 | G-Gamma-8 |G-Gamma-C |gng8 |gng9 |gngt8 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),伽马转导活性多肽2 | - | HPRD,Biogrid | 8943291 |
IL16 | FLJ16806 |FLJ42735 |FLJ44234 |HST19289 |IL-16 |LCF |Pril-16 | 白介素16(淋巴细胞趋化因子) | - | HPRD,Biogrid | 10479680 |
lin7a | lin-7a |lin7 |mals-1 |MGC148143 |提示-33 |veli1 | LIN-7同源物A(秀丽隐杆线虫) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14960569 |
lin7b | lin-7b |mals-2 |mals2 |veli2 | LIN-7同源物B(秀丽隐杆线虫) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 11742811 |
lin7c | FLJ11215 |Lin-7-C |lin-7c |mals-3 |mals3 |veli3 | LIN-7同源物C(秀丽隐杆线虫) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14960569|15024025 |
SNTA1 | SNT1 |tacip1 |DJ1187J4.5 | Syntrophin,Alpha 1(肌营养不良蛋白相关的蛋白A1,59KDA,酸性成分) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15024025 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 | 137 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过GBETA伽马亚基对电压门控Ca2通道的反应组抑制 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GABA B受体激活 | 38 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GABA受体激活 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome钾通道 | 98 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组向内纠正K通道 | 31 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP | 309 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌DN | 203 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 | 94 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iizuka肝癌进展G1 G2 UP | 12 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 common | 77 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 142 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 210 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |