基因页:KCNJ8
概括?
基因 | 3764 |
象征 | KCNJ8 |
同义词 | Kir6.1 | UKATP-1 |
描述 | 钾电源门控通道亚家族j成员8 |
参考 | MIM:600935|HGNC:HGNC:6269|ENSEMBL:ENSG00000121361|HPRD:02962|Vega:Otthumg00000169093 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12p11.23 |
Pascal P值 | 0.47 |
Sherlock P值 | 0.205 |
胎儿β | -1.182 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | 兴奋性 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 1 |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值:1.517 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG03243946 | 12 | 21811034 | KCNJ8 | 0.004 | -2.405 | DMG:Vaneijk_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11046386 | CHR12 | 22513129 | KCNJ8 | 3764 | 0.16 | 顺式 | ||
RS12316081 | CHR12 | 22515892 | KCNJ8 | 3764 | 0.1 | 顺式 | ||
RS10841998 | CHR12 | 22531239 | KCNJ8 | 3764 | 0.08 | 顺式 | ||
RS12303966 | CHR12 | 22665916 | KCNJ8 | 3764 | 0.2 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KCNJ8_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005244 | 电压门控离子通道活性 | IEA | - | |
GO:0015272 | ATP激活的向内整流钾通道活性 | IEA | - | |
去:0030955 | 钾离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007507 | 心脏发展 | IEA | - | |
去:0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
去:0006813 | 钾离子运输 | 塔斯 | 7890693 | |
GO:0051607 | 对病毒的防御反应 | IEA | - | |
GO:0032496 | 对脂多糖的反应 | IEA | - | |
去:0043330 | 对外源性dsRNA的反应 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0030016 | 肌原纤维 | IEA | - | |
去:0008076 | 电压门控钾通道复合物 | 塔斯 | 7890693 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome钾通道 | 98 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组向内纠正K通道 | 31 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
THUM收缩心力衰竭DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗伊伤口血管向上 | 50 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
roversi神经胶质瘤区域 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射5的响应5 | 147 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 | 153 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iizuka肝癌进展G1 G2 UP | 12 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen LVAD支持失败的心脏DN | 42 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖DN | 179 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |