概括
基因 3764
象征 KCNJ8
同义词 Kir6.1 | UKATP-1
描述 钾电源门控通道亚家族j成员8
参考 MIM:600935|HGNC:HGNC:6269|ENSEMBL:ENSG00000121361|HPRD:02962|Vega:Otthumg00000169093
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12p11.23
Pascal P值 0.47
Sherlock P值 0.205
胎儿β -1.182
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 兴奋性

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 1
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.517

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG03243946 12 21811034 KCNJ8 0.004 -2.405 DMG:Vaneijk_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11046386 CHR12 22513129 KCNJ8 3764 0.16 顺式
RS12316081 CHR12 22515892 KCNJ8 3764 0.1 顺式
RS10841998 CHR12 22531239 KCNJ8 3764 0.08 顺式
RS12303966 CHR12 22665916 KCNJ8 3764 0.2 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005244 电压门控离子通道活性 IEA -
GO:0015272 ATP激活的向内整流钾通道活性 IEA -
去:0030955 钾离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007507 心脏发展 IEA -
去:0006811 离子运输 IEA -
去:0006813 钾离子运输 塔斯 7890693
GO:0051607 对病毒的防御反应 IEA -
GO:0032496 对脂多糖的反应 IEA -
去:0043330 对外源性dsRNA的反应 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0030016 肌原纤维 IEA -
去:0008076 电压门控钾通道复合物 塔斯 7890693

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome钾通道 98 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组向内纠正K通道 31 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗伊伤口血管向上 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
roversi神经胶质瘤区域 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射5的响应5 147 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 153 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iizuka肝癌进展G1 G2 UP 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen LVAD支持失败的心脏DN 42 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 UP 176 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖DN 179 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因