概括
基因 3766
象征 KCNJ10
同义词 birk-10 | kcnj13-pen | kir1.2 | kir4.1 |芝麻
描述 钾电源门控通道亚家族j成员10
参考 MIM:602208|HGNC:HGNC:6256|ENSEMBL:ENSG00000177807|HPRD:03732|Vega:Otthumg00000024073
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q23.2
Sherlock P值 0.314
胎儿β -2.301
支持 兴奋性

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00814
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FN1 0.84 0.84
LAMC1 0.80 0.78
itga1 0.79 0.79
喇嘛4 0.77 0.76
ETS1 0.76 0.73
AFAP1L1 0.76 0.72
CD93 0.74 0.77
NID1 0.74 0.78
VCL 0.74 0.71
FAM124B 0.73 0.64
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Trex1 -0.42 -0.51
AC018755.7 -0.42 -0.50
aspdh -0.40 -0.46
josd2 -0.40 -0.42
MT3 -0.40 -0.46
arl6ip4 -0.39 -0.46
CHCHD10 -0.39 -0.47
KB-1839H6.1 -0.39 -0.47
TMEM219 -0.38 -0.46
sftpc -0.38 -0.43

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0005244 电压门控离子通道活性 IEA -
去:0005267 钾通道活动 IEA -
GO:0015272 ATP激活的向内整流钾通道活性 塔斯 8995301
去:0030955 钾离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006811 离子运输 IEA -
去:0006813 钾离子运输 塔斯 8995301
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 8995301

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 137 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过GBETA伽马亚基对电压门控Ca2通道的反应组抑制 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GABA B受体激活 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GABA受体激活 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome钾通道 98 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组向内纠正K通道 31 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 205 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
coates巨噬细胞M1 vs M2向上 81 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 2221 2228 1A,M8 HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu