SZGR2 - Beplay体育中心

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GeneID	3768
Symbol	KCNJ12
同义词	IRK-2\|IRK2\|KCNJN1\|Kir2.2\|Kir2.2v\|hIRK\|hIRK1\|hkir2.2x\|kcnj12x
描述	potassium voltage-gated channel subfamily J member 12
参考	MIM：602323\|HGNC:HGNC:6258\|Ensembl:ENSG00000184185\|HPRD：09083\|Vega：Otthumg00000132039
基因类型	蛋白质编码
地图位置	17p11.2
Pascal P值	0.17
胎儿β	-3.314
DMG	1(# studies)
主持人	Myers' cis & trans
支持	兴奋性

Gene in Data Sources

基因集名称	基因组方法	描述	信息
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
DMG：Wockner_2014	全基因组DNA甲基化分析	该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。	1
网络	Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network	PPI网络中最短路径的贡献：0.006

Section I. Genetics and epigenetics annotation

差异甲基化基因

探测	染色体	位置	最近的基因	p（dis）	beta（dis）	fdr（dis）	学习
cg26857910	17	21279619	KCNJ12	3.76E-6	-0.391	0.009	DMG：Wockner_2014

EQTL注释

SNP ID	染色体	位置	主持人	Gene Entrez ID	PVALUE	QVALUE	TSS距离	eQTL type
RS16829545	CHR2	151977407	KCNJ12	3768		2.846E-4		反式
RS16955618	CHR15	29937543	KCNJ12	3768		2.319E-4		反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

No co-expressed genes in brain regions

第三节。基因本体论注释

Molecular function	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005242	内向整流器钾通道活动	IEA		-
去：0005242	内向整流器钾通道活动	TAS		7859381
去：0005244	电压门控离子通道活性	IEA		-
去：0008200	ion channel inhibitor activity	TAS		8647284
GO：0015459	钾通道调节剂活性	TAS		8647284
去：0030955	potassium ion binding	IEA		-
Biological process	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0008015	blood circulation	nas		7859381
去：0008016	心脏收缩的调节	TAS		7859381
去：0006811	离子运输	IEA		-
去：0006813	钾离子运输	IEA		-
去：0006813	钾离子运输	TAS		7859381\|8647284
去：0006936	肌肉收缩	TAS		7859381
细胞分量	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
GO:0016020	membrane	IEA		-
GO:0016021	膜不可或缺	IEA		-

Section IV. Protein-protein interaction annotation

Interactors	别名b	官方全名b	实验	Source	PubMed ID
ABLIM1	Ablim \|DKFZP781D0148 \|FLJ14564 \|KIAA0059 \|Limab1 \|limatin \|MGC1224	actin binding LIM protein 1	-	HPRD，Biogrid	15024025
APBA1	D9S411E \|mint1 \|x11 \|x11a \|x11alpha	淀粉样β（A4）前体蛋白质结合，家族A，成员1	-	HPRD，Biogrid	14960569\|15024025
桶	CAGH39 \|CMG \|FLJ22219 \|FLJ31914 \|lin2 \|Micpch \|TNRC8	钙/钙调蛋白依赖性丝氨酸蛋白激酶（Maguk家族）	-	HPRD，Biogrid	14960569\|15024025
DLG1	DKFZP761P0818 \|DKFZP781B0426 \|dlgh1 \|SAP97 \|DJ1061C18.1.1 \|HDLG	圆盘，大型同源物1（果蝇）	-	HPRD，Biogrid	5024025\|11181181 \|14960569
DLG2	DKFZp781D1854 \| DKFZp781E0954 \| FLJ37266 \| MGC131811 \| PSD-93	discs, large homolog 2, chapsyn-110 (Drosophila)	-	HPRD，Biogrid	15024025
DLG3	KIAA1232 \|MRX \|MRX90 \|NE-DLG \|nedlg \|SAP102	圆盘，大型同源物3（果蝇神经内分泌-DLG，果蝇）	-	HPRD，Biogrid	15024025
DLG4	FLJ97752 \|FLJ98574 \|PSD95 \|SAP90	圆盘，大型同源物4（果蝇）	-	HPRD，Biogrid	15024025
DMD	BMD \| CMD3B \| DXS142 \| DXS164 \| DXS206 \| DXS230 \| DXS239 \| DXS268 \| DXS269 \| DXS270 \| DXS272	肌营养不良	-	HPRD，Biogrid	15024025
DTNA	D18S892E \| DRP3 \| DTN \| FLJ96209 \| LVNC1	Dystrobrevin，Alpha	-	HPRD，Biogrid	15024025
lin7a	lin-7a \|lin7 \|mals-1 \|MGC148143 \|提示-33 \|veli1	lin-7 homolog A (C. elegans)	-	HPRD，Biogrid	14960569\|15024025
lin7b	LIN-7B \| MALS-2 \| MALS2 \| VELI2	lin-7 homolog B (C. elegans)	亲和力捕获 - 韦斯特恩重构的复合物	Biogrid	14960569\|15024025
lin7c	FLJ11215 \|Lin-7-C \|lin-7c \|mals-3 \|mals3 \|veli3	LIN-7同源物C（秀丽隐杆线虫）	Affinity Capture-MS 亲和力捕获 - 韦斯特恩重构的复合物	Biogrid	14960569\|15024025
mpp6	pals2 \|VAM-1 \|vam1 \|p55t	膜蛋白，棕榈酰化6（Maguk P55亚家族成员6）	Affinity Capture-MS	Biogrid	15024025
SNTA1	SNT1 \|tacip1 \|DJ1187J4.5	Syntrophin，Alpha 1（肌营养不良蛋白相关的蛋白A1，59KDA，酸性成分）	-	HPRD，Biogrid	15024025
SNTB1	59-DAP \|A1b \|bsyn2 \|DAPA1B \|FLJ22442 \|MGC111389 \|SNT2 \|SNT2B1 \|提示43	Syntrophin，β1（肌营养不良蛋白相关的蛋白A1，59KDA，碱性成分1）	-	HPRD，Biogrid	15024025
SNTB2	D16S2531E \|EST25263 \|SNT2B2 \|SNT3 \|SNTL	Syntrophin，β2（肌营养不良蛋白相关的蛋白A1，59KDA，碱性成分2）	-	HPRD，Biogrid	15024025

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
跨化学突触的反应组传播	186	155	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome神经元系统	279	221	All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播	137	110	All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过GBETA伽马亚基对电压门控Ca2通道的反应组抑制	25	17	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome GABA B受体激活	38	26	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome GABA受体激活	52	40	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome钾通道	98	68	All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组向内纠正K通道	31	20	All SZGR 2.0 genes in this pathway
中村肿瘤区周围与中央DN	634	384	All SZGR 2.0 genes in this pathway
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA UP	1821年	933	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PEREZ TP53 TARGETS	1174	695	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Perez TP63目标	355	243	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Perez TP53和TP63目标	205	145	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Amit EGF响应40 HELA	42	29	All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦凯布（McCabe）由HOXC6绑定	469	239	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上	1725年	838	All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

miRNA family	目标位置			miRNA ID	mirna seq
miRNA family	UTR开始	UTR结束	匹配方法	miRNA ID	mirna seq
mir-124.1	1021	1027	m8	HSA-MIR-124A	UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506	1020	1027	1A，M8	HSA-MIR-506	uaaggcacccuucugugaguaga
mir-124/506	1020	1027	1A，M8	HSA-MIR-124^大脑	UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
miR-125/351	800	806	m8	hsa-miR-125b^大脑	ucccugagacccuaacuuguga
miR-125/351	800	806	m8	hsa-miR-125a^大脑	UCCCUGAGACCCUUUAACCUGUG
mir-132/212	427	433	m8	hsa-miR-212^SZ	uaacagucuccagucacgccc
mir-132/212	427	433	m8	HSA-MIR-132^大脑	UAACAGUCUACAGCCAUGGUCG
miR-143	2356	2362	m8	HSA-MIR-143^大脑	ugagaugaagcacuguagcuca
miR-145	3131	3137	m8	HSA-MIR-145	GUCCAGUUUUCCCAGGAAUCCCUU
mir-29	3002	3008	m8	HSA-MIR-29A^SZ	uagcaccaucugaaaucgguu
				HSA-MIR-29B^SZ	uagcaccauuugaaaucaguguu
				HSA-MIR-29C^SZ	uagcaccauuugaaaucggu
mir-30-5p	430	437	1A，M8	hsa-miR-30a-5p	uguaaaacauccuccugagaag
				HSA-MIR-30C^大脑	UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
				HSA-MIR-30D^SZ	UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
				HSA-MIR-30B^SZ	uguaaacauccuaccucucagcu
				HSA-MIR-30E-5P	UGUAAACAUCCUUGACUGGA

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击hereto see the list of SZ related miRNAs.
Brain: miRNAs which are expressed in brain based on miRNA microarray expression studies. Clickhere查看与大脑相关的miRNA列表。