基因页：ZC3H6

概括？
基因 376940
象征 ZC3H6
同义词 ZC3HDC6
描述 锌指CCCH型包含6个
参考 HGNC：HGNC：24762|ENSEMBL：ENSG00000188177|HPRD：15698|Vega：Otthumg00000153286
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2Q13
Pascal P值 0.146
Sherlock P值 0.237
胎儿β 1.229
DMG 1（＃研究）
主持人 元
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
DNM：Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.0004
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.00755

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
ZC3H6 CHR2 113080284 G C NM_198581 p.382r> t 错过 精神分裂症 DNM：Fromer_2014

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG14190740 2 113033328 ZC3H6 4.898E-4 -0.158 0.047 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003676 核酸结合 IEA -
去：0008270 锌离子结合 IEA -
GO：0046872 金属离子结合 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应很晚 317 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-137 357 364 1A，M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-140 128 134 1a HSA-MIR-140脑 agugguuuuacccuaugguag
mir-15/16/195/424/497 114 120 1a HSA-MIR-15A脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B脑 uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-181 574 580 M8 HSA-MIR-181A脑 aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C脑 aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D脑 aacauucauuguugucggggguggguu
MiR-200BC/429 388 394 M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-374 97 103 1a HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-410 166 172 1a HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-433-3p 828 834 M8 HSA-MIR-433脑 aucaugauggggcuccucggugu
HSA-MIR-433脑 aucaugauggggcuccucggugu
mir-503 114 120 1a HSA-MIR-503 uagcagcgggaacaguucugcag
mir-539 2289 2295 1a HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu