基因页面:KCNK1
总结吗?
GeneID | 3775年 |
象征 | KCNK1 |
同义词 | DPK |不怀好意的笑| K2P1 | K2p1.1 | KCNO1 | TWIK-1 | TWIK1 |
描述 | 钾两个孔隙域通道亚K成员1 |
参考 | MIM: 601745|HGNC: HGNC: 6272|运用:ENSG00000135750|HPRD: 03447|织女:OTTHUMG00000037923 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 1 q42.2 |
夏洛克假定值 | 0.52 |
胎儿β | -3.406 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 元 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
表达式 | 荟萃分析的基因表达 | P值:1.506 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg20947082 | 1 | 233749643 | KCNK1 | 3.6 e-6 | -0.452 | 0.009 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KCNK1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
DLG2 | 0.88 | 0.86 |
AL133410.3 | 0.86 | 0.85 |
MYO5A | 0.86 | 0.90 |
RAB11FIP4 | 0.86 | 0.83 |
KALRN | 0.86 | 0.86 |
MAP2 | 0.85 | 0.87 |
RIMS1 | 0.85 | 0.82 |
GARNL4 | 0.85 | 0.84 |
GAS7 | 0.84 | 0.87 |
AKAP6 | 0.84 | 0.86 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RHOC | -0.52 | -0.59 |
C1orf61 | -0.51 | -0.63 |
C1orf54 | -0.51 | -0.58 |
RAB34 | -0.50 | -0.57 |
AF347015.21 | -0.50 | -0.47 |
NUDT8 | -0.50 | -0.51 |
ENHO | -0.49 | -0.54 |
EIF4EBP3 | -0.47 | -0.50 |
METRN | -0.47 | -0.48 |
VAMP5 | -0.47 | -0.46 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005242 | 内向整流钾通道的活动 | 助教 | 8605869 | |
去:0005244 | 电压门控离子通道的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005267 | 钾离子通道的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005216 | 离子通道的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0030955 | 钾离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006811 | 离子传输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006813 | 钾离子运输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006813 | 钾离子运输 | 助教 | 8605869 | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008076 | 电压门控钾通道复杂 | 助教 | 8605869 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
REACTOME神经系统 | 279年 | 221年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME串联孔隙域钾离子通道 | 12 | 7 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME钾离子通道 | 98年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
父母MTOR信号了 | 567年 | 375年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHARAFE乳腺癌基底与间充质 | 121年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日WT1目标了 | 214年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日WT1目标12小时 | 162年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WAMUNYOKOLI卵巢癌成绩1 2 | 137年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ENK紫外线反应表皮DN | 508年 | 354年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DELYS甲状腺癌了 | 443年 | 294年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王食道癌和正常 | 121年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MCBRYAN发育期乳房4 5周 | 271年 | 175年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MCBRYAN发育期乳房5 6周 | 116年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WEINMANN适应缺氧 | 29日 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WEINMANN适应缺氧的DN | 41 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRUETZMANN胰腺癌起来 | 358年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲 | 479年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN NUYTTEN NIPP1目标 | 848年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN NUYTTEN EZH2目标 | 1024年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布伊泰尔特说光动力治疗压力 | 811年 | 508年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
里克曼转移DN | 261年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SCHAEFFER前列腺癌发展48小时 | 487年 | 286年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
吴细胞迁移 | 184年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
唱转移基质上 | 110年 | 70年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李PTCH1和SUFU DN的目标 | 83年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
不知道背景目标2 DN | 464年 | 276年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LE EGR2 DN的目标 | 108年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VERNELL视网膜母细胞瘤的途径了 | 70年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗感染血巨细胞病毒16人力资源 | 225年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KAAB心脏心房和心室 | 249年 | 170年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陈使用支持失败的心 | 103年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
山崎TCEB3 DN的目标 | 215年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WELCSH BRCA1目标了 | 198年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SESTO应对紫外线C1 | 72年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
《图片报》极品致癌签名 | 261年 | 166年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
霍林CITED1目标1 | 35 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由4 nqo或紫外线KYNG DNA损伤 | 63年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KYNG DNA损伤了 | 226年 | 164年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
海勒HDAC DN的目标 | 292年 | 189年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
海勒HDAC目标被甲基化DN | 281年 | 179年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BOQUEST干细胞起 | 260年 | 174年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
YAUCH刺猬信号旁分泌DN | 264年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
甜蜜的肺癌喀斯特 | 491年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
蒋介石肝癌CTNNB1子类 | 176年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王复发性肝癌 | 20. | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳人大HCP H3K4ME2和H3K27ME3 | 349年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
开罗肝母细胞癌类DN | 210年 | 141年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森人大HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 210年 | 148年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BAE BRCA1目标了 | 75年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金所有障碍少突细胞数量。柯尔 | 756年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金所有障碍CALB1 CORR | 548年 | 370年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VERHAAK胶质母细胞瘤神经 | 129年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李BMP2目标了 | 745年 | 475年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KOINUMA SMAD2或SMAD3的目标 | 824年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PURBEY CTBP1不是SATB1 DN的目标 | 448年 | 282年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PLASARI TGFB1 10人力资源的目标 | 199年 | 143年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
冯氏TNF通过P38完成响应 | 227年 | 151年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-26 | 272年 | 279年 | 1、m8 | hsa-miR-26a大脑 | UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC |
hsa-miR-26b深圳 | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
mir - 539 | 632年 | 638年 | m8 | hsa - mir - 539 | GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU |