基因页：KCNN3
概括？
| 基因 | 3782 |
| 象征 | KCNN3 |
| 同义词 | KCA2.3 | SK3 | SKCA3 | HSK3 |
| 描述 | 钙钙激活的通道亚家族n成员3 |
| 参考 | MIM：602983|HGNC：HGNC：6292|ENSEMBL：ENSG00000143603|HPRD：04283|Vega：Otthumg0000000037260 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q21.3 |
| Sherlock P值 | 0.258 |
| 胎儿β | 1.523 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 | 2 | 链接到Szgene |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00814 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17070904 | CHR18 | 60917055 | KCNN3 | 3782 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005516 | 钙调蛋白结合 | IEA | - | |
| 去：0005216 | 离子通道活动 | IEA | - | |
| GO：0016286 | 小电导钙激活的钾通道活性 | IEA | - | |
| GO：0015269 | 钙激活的钾通道活性 | IEA | - | |
| GO：0015269 | 钙激活的钾通道活性 | 塔斯 | 8781233 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007268 | 突触传输 | 塔斯 | 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） | 8781233 |
| 去：0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突（GO期限：5） | 9491810 |
| 去：0006813 | 钾离子运输 | IEA | - | |
| 去：0006813 | 钾离子运输 | 塔斯 | 8781233 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0008076 | 电压门控钾通道复合物 | 塔斯 | 8781233 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome钾通道 | 98 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过CD40 UP的Hollmann凋亡 | 201 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni pax foxo1手臂签名 | 59 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 巴索CD40信号传导DN | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牙槽横纹肌肉瘤 | 98 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向DN | 292 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 | 281 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshioka肝癌早期复发 | 40 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 | 206 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤HP DN | 47 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 137 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BMI1和PCGF2的Wiederschain目标 | 57 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smirnov对IR 2小时DN的响应 | 55 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smirnov对IR 6小时的回应 | 166 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-122 | 12 | 18 | 1a | HSA-MIR-122A | uggagugugacaaugguuuugu |
| mir-150 | 206 | 212 | M8 | HSA-MIR-150 | ucucccaacccuuguaccagug |
| mir-155 | 21 | 27 | M8 | HSA-MIR-155 | uuaaugcuaaucgugauagggg |
| mir-185 | 55 | 61 | M8 | HSA-MIR-185脑 | Uggagaaaggcaguuc |
| mir-208 | 35 | 41 | 1a | HSA-MIR-208 | auaagacgaaaaaagcuugu |
| mir-499 | 35 | 41 | 1a | HSA-MIR-499 | uuaagacuugcagugauguuaa |