基因页面:KCNQ1
总结吗?
| GeneID | 3784年 |
| 象征 | KCNQ1 |
| 同义词 | ATFB1 | ATFB3 | JLNS1 | KCNA8 | KCNA9 | KVLQT1 | Kv1.9 | Kv7.1 | LQT | LQT1 |遥控武器站| SQT2 |采用 |
| 描述 | 电压门控钾通道亚问成员1 |
| 参考 | MIM: 607542|HGNC: HGNC: 6294|运用:ENSG00000053918|HPRD: 06341|织女:OTTHUMG00000009900 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11 p15.5 |
| 帕斯卡假定值 | 0.003 |
| 胎儿β | -1.032 |
| DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 简历:PheWAS | Phenome-wide协会研究(PheWAS) | 157个snp与精神分裂症有关 | 2 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 3 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
简历:PheWAS
简历:PheWAS| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | P | 函数 | 基因 | 上/下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs163182 | 11 | 0 | 零 | 1.55 | KCNQ1 | 零 | |
| rs2237878 | 11 | 2766282 | 零 | 0.3608 | KCNQ1 | 零 |
不同甲基化基因
| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg17402907 | 11 | 2697109 | KCNQ1; KCNQ1OT1 | 2.304的军医 | -0.676 | 0.036 | DMG: Wockner_2014 |
| cg03512098 | 11 | 2730129 | KCNQ1 | 5.08的军医 | 0.544 | 0.047 | DMG: Wockner_2014 |
| cg23049234 | 11 | 2595718 | KCNQ1 | 5.791的军医 | 0.271 | 0.049 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG霍乱弧菌感染 | 56 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME神经系统 | 279年 | 221年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME电压门控钾离子通道 | 43 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME钾离子通道 | 98年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 西方肾上腺皮质肿瘤标志物DN | 20. | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人DN | 463年 | 290年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯NTN1 DN的目标 | 158年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN NPM1突变签名1 DN | 126年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN NPM1突变签名2 DN | 77年 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN NPM1签名3 DN | 162年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 施莱辛格甲基化新创的癌症 | 88年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NUYTTEN EZH2的目标了 | 1037年 | 673年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 廖转移 | 539年 | 324年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 挞挞VS PLASMABLAST浆细胞 | 398年 | 262年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 桑塞姆APC目标了 | 126年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KAAB心脏心房和心室DN | 261年 | 183年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BONOME卵巢癌生存非最优减积 | 510年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 西方肾上腺皮质肿瘤DN | 546年 | 362年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K27ME3 | 79年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VALK AML集群5 | 33 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳大脑HCP H3K4ME2和H3K27ME3 | 59 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 | 435年 | 318年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大HCP H3K27ME3 | 341年 | 243年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 姚明时间响应黄体酮集群2 | 86年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 么时间响应黄体酮集群5 | 30. | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒4 hr DN | 254年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FEVR CTNNB1目标 | 553年 | 343年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FORTSCHEGGER PHF8目标 | 784年 | 464年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BRIDEAU印迹基因 | 63年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ROESSLER肝癌转移 | 107年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |