概括
基因 3785
象征 KCNQ2
同义词 bfnc | bfns1 | ebn | ebn1 | eiee7 | enb1 | hnspc | kcna11 | kv7.2 | kvebn1
描述 钾电源门控通道亚家族Q成员2
参考 MIM:602235|HGNC:HGNC:6296|Ensembl:ENSG00000075043|HPRD:03757|Vega:Otthumg00000033049
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20q13.3
Pascal P值 3.787E-5
Sherlock P值 0.951
胎儿β -0.263
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005244 电压门控离子通道活性 IEA -
去:0005249 电压门控钾通道活动 塔斯 9677360
去:0030955 钾离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007268 突触传输 塔斯 神经元,突触,神经递质(GO期限:6) 9425895
去:0007399 神经系统的发展 塔斯 神经突(GO期限:5) 9425895
去:0006811 离子运输 IEA -
去:0006813 钾离子运输 塔斯 9677360
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0008076 电压门控钾通道复合物 塔斯 9677360

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome L1CAM相互作用 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
L1和氨基链蛋白之间的反应组相互作用 23 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome电压门控钾通道 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome钾通道 98 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pramoonjago Sox4靶向DN 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌20q12 Q13 Amplicon 149 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过nova2拼接 43 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine乳头状甲状腺癌DN 80 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nielsen滑膜肉瘤 18 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Abdelmohsen Elavl4目标 16 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因