基因页:KCNQ3
概括?
基因 | 3786 |
象征 | KCNQ3 |
同义词 | BFNC2 | EBN2 | KV7.3 |
描述 | 钾电源门控通道亚家族Q成员3 |
参考 | MIM:602232|HGNC:HGNC:6297|ENSEMBL:ENSG00000184156|HPRD:09077|Vega:Otthumg00000137472 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8Q24 |
Pascal P值 | 0.021 |
Sherlock P值 | 0.385 |
胎儿β | -1.365 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值:2.129 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG13070215 | 8 | 133493171 | KCNQ3 | 5.128E-4 | 0.725 | 0.047 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005244 | 电压门控离子通道活性 | IEA | - | |
去:0005249 | 电压门控钾通道活动 | IEA | - | |
去:0005249 | 电压门控钾通道活动 | 塔斯 | 9677360 | |
去:0005216 | 离子通道活动 | IEA | - | |
去:0030955 | 钾离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007268 | 突触传输 | 塔斯 | 神经元,突触,神经递质(GO期限:6) | 9425900 |
去:0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
去:0006813 | 钾离子运输 | IEA | - | |
去:0006813 | 钾离子运输 | 塔斯 | 9677360 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0008076 | 电压门控钾通道复合物 | IEA | - | |
去:0008076 | 电压门控钾通道复合物 | 塔斯 | 9677360 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome L1CAM相互作用 | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
L1和氨基链蛋白之间的反应组相互作用 | 23 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome电压门控钾通道 | 43 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome钾通道 | 98 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌8Q23 Q24 AMPLICON | 157 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼古斯基在乳腺癌中突变并扩增 | 94 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
克莱门特乳腺癌复制号码 | 23 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang EGF间隔 | 105 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |