概括
基因 3786
象征 KCNQ3
同义词 BFNC2 | EBN2 | KV7.3
描述 钾电源门控通道亚家族Q成员3
参考 MIM:602232|HGNC:HGNC:6297|ENSEMBL:ENSG00000184156|HPRD:09077|Vega:Otthumg00000137472
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q24
Pascal P值 0.021
Sherlock P值 0.385
胎儿β -1.365
DMG 1(#研究)
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:2.129
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG13070215 8 133493171 KCNQ3 5.128E-4 0.725 0.047 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005244 电压门控离子通道活性 IEA -
去:0005249 电压门控钾通道活动 IEA -
去:0005249 电压门控钾通道活动 塔斯 9677360
去:0005216 离子通道活动 IEA -
去:0030955 钾离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007268 突触传输 塔斯 神经元,突触,神经递质(GO期限:6) 9425900
去:0006811 离子运输 IEA -
去:0006813 钾离子运输 IEA -
去:0006813 钾离子运输 塔斯 9677360
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0008076 电压门控钾通道复合物 IEA -
去:0008076 电压门控钾通道复合物 塔斯 9677360

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome L1CAM相互作用 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
L1和氨基链蛋白之间的反应组相互作用 23 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome电压门控钾通道 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome钾通道 98 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向DN 352 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Myc放大靶向 201 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌8Q23 Q24 AMPLICON 157 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼古斯基在乳腺癌中突变并扩增 94 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克莱门特乳腺癌复制号码 23 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF间隔 105 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因