基因页：KCNS3

概括？
基因 3790
象征 KCNS3
同义词 Kv9.3
描述 钾电源门控通道修饰符亚家族成员3
参考 MIM：603888|HGNC：HGNC：6302|ENSEMBL：ENSG00000170745|HPRD：04865|Vega：Otthumg000000444150
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P24
Pascal P值 1.994E-5
胎儿β -2.223
DMG 2（＃研究）
主持人 尾状基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
表达 基因表达的荟萃分析 p价值：1.544
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG26119806 2 18061572 KCNS3 3.38e-4 -0.707 0.041 DMG：Wockner_2014
CG20940661 2 18060086 KCNS3 -0.022 0.46 DMG：Nishioka_2013


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
LRP12 0.82 0.90
WDR47 0.82 0.90
SMAP1 0.81 0.90
pank1 0.80 0.88
papd5 0.80 0.90
ralgps2 0.80 0.88
GFPT1 0.80 0.88
TTC13 0.80 0.87
Vezt 0.80 0.89
Trim36 0.80 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.64 -0.82
AF347015.31 -0.64 -0.80
AF347015.33 -0.63 -0.78
FXYD1 -0.62 -0.79
mt-cyb -0.61 -0.77
higd1b -0.61 -0.79
AF347015.27 -0.60 -0.76
HLA-F -0.60 -0.69
AF347015.8 -0.60 -0.78
ifi27 -0.60 -0.76

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
去：0005244 电压门控离子通道活性 IEA -
去：0005251 整流器钾通道活动延迟 塔斯 10484328
GO：0015459 钾通道调节剂活性 塔斯 10484328
去：0030955 钾离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006811 离子运输 IEA -
去：0006813 钾离子运输 塔斯 10484328
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -
去：0005886 质膜 IEA -
去：0008076 电压门控钾通道复合物 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
能量代谢的反应组整合 120 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰像肽等胰高血糖素分泌的反应组调节胰岛素分泌1 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素分泌的反应组调节 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome电压门控钾通道 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome钾通道 98 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni pax foxo1手臂签名 59 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
igarashi atf4靶向dn 90 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘cmyb靶向 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘vmyb的目标 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ozen mir125b1靶标 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染18小时 178 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A4 196 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF间隔DN 214 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-125/351 95 101 M8 HSA-MIR-125B脑 ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A脑 ucccugagacccuuaaccugug
mir-135 112 118 1a HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
mir-142-5p 56 62 1a HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-320 53 60 1A，M8 HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-33 400 406 M8 HSA-MIR-33 Gugcauuguuguugcauug
HSA-MIR-33B Gugcauugcuguugcauugca
mir-409-3p 124 130 1a HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu
mir-496 377 383 M8 HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc