基因页面:KIF5A
总结吗?
| GeneID | 3798年 |
| 象征 | KIF5A |
| 同义词 | D12S1889 | MY050 | NKHC | SPG10 |
| 描述 | 驱动蛋白家族成员5 |
| 参考 | MIM: 602821|HGNC: HGNC: 6323|运用:ENSG00000155980|HPRD: 09108|织女:OTTHUMG00000170143 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 12 q13.13 |
| 帕斯卡假定值 | 0.343 |
| 夏洛克假定值 | 0.003 |
| 胎儿β | -0.541 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | CompositeSet 达内尔FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg17083982 | 12 | 57946083 | KIF5A | 2.192的军医 | 0.404 | 0.036 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs10148807 | chr14 | 47975679 | KIF5A | 3798年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs10483569 | chr14 | 47985281 | KIF5A | 3798年 | 0.03 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| S100B | 0.79 | 0.85 |
| KLRC2 | 0.77 | 0.80 |
| NR0B1 | 0.77 | 0.80 |
| S100A13 | 0.75 | 0.83 |
| B2M | 0.75 | 0.86 |
| PSMB9 | 0.73 | 0.82 |
| ACYP2 | 0.73 | 0.77 |
| ACOT13 | 0.72 | 0.78 |
| DDIT3 | 0.72 | 0.76 |
| AC021016.1 | 0.72 | 0.81 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FAM40A | -0.66 | -0.75 |
| LSM14B | -0.66 | -0.76 |
| RNF40 | -0.66 | -0.75 |
| EWSR1 | -0.66 | -0.76 |
| DAZAP1 | -0.66 | -0.78 |
| MORC2 | -0.65 | -0.78 |
| PDCD11 | -0.65 | -0.76 |
| DBN1 | -0.65 | -0.77 |
| PJA1 | -0.65 | -0.73 |
| WDR6 | -0.65 | -0.75 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003777 | 微管马达活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005524 | ATP结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007268 | 突触传递 | 助教 | Synap神经元,神经递质(术语层面:6) | 7514426 |
| 去:0007018 | microtubule-based运动 | 助教 | 7514426 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0043005 | 神经元投射 | 国际能源机构 | 神经元,轴突、轴突、树突(术语层面:5) | - - - - - - |
| 去:0005871 | 驱动蛋白复合体 | 助教 | 7514426 | |
| 去:0005874 | 微管 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005624 | 膜分数 | 助教 | 7514426 | |
| 去:0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0035253 | 纤毛细根 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME MHC II级抗原 | 91年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME因素参与巨核细胞和血小板的生产发展 | 132年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME驱动蛋白 | 24 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME止血 | 466年 | 331年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME免疫系统 | 933年 | 616年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME适应性免疫系统 | 539年 | 350年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王CLIM2目标了 | 269年 | 146年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 压抑的徐HGF目标AKT1 DN | 95年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过ELK3 DN严重缺氧 | 156年 | 106年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过HIF1A DN严重缺氧 | 110年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过ELK3和HIF1A严重缺氧 | 142年 | 104年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李PTCH1和SUFU DN的目标 | 83年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHESLER大脑最高表达 | 40 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MOREAUX TACI了多发性骨髓瘤 | 412年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 麦克朗三角洲FOSB目标8周 | 47 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃造血干细胞 | 254年 | 164年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李卡路里限制大脑皮层DN | 88年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BANDRES应对CARMUSTIN管理48小时DN | 161年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LEIN本地化的远端和近端树突 | 17 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 拉贝风TGFB1目标了 | 102年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG下降2 EGF的脉搏 | 293年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-103/107 | 68年 | 75年 | 1、m8 | hsa - mir - 103大脑 | AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUGA |
| hsa - mir - 107大脑 | AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUCA | ||||
| mir - 124.1 | 467年 | 473年 | 1 | hsa - mir - 124 a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| miR-15/16/195/424/497 | 195年 | 202年 | 1、m8 | hsa-miR-15a大脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
| hsa-miR-16大脑 | UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG | ||||
| hsa-miR-15b大脑 | UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA | ||||
| hsa - mir - 195深圳 | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
| hsa - mir - 424 | CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA | ||||
| hsa - mir - 497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU | ||||
| miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d | 27 | 33 | m8 | hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
| hsa-miR-20a大脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 106 a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
| hsa - mir - 106 b深圳 | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
| hsa-miR-20b深圳 | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 519 d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||