概括
基因 3837
象征 KPNB1
同义词 IMB1 | IPO1 | IPOB | IMPNB | NTF97
描述 核桃蛋白亚基β1
参考 MIM:602738|HGNC:HGNC:6400|HPRD:04114|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q21.32
Pascal P值 0.595
Sherlock P值 0.513
胎儿β 0.112
DMG 2(#研究)
支持 结构可塑性
COMPOSITESET
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:2.337

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02415717 17 45727607 KPNB1 3.865e-4 -0.253 0.043 DMG:Wockner_2014
CG24438655 17 45727598 KPNB1 -0.019 0.61 DMG:Nishioka_2013


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008270 锌离子结合 塔斯 7615630
去:0008565 蛋白质转运蛋白活性 IEA -
去:0008139 核定位序列结合 塔斯 7627554
GO:0019904 蛋白质域特异性结合 IPI 11984006
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000059 蛋白质进口到核,对接 IEA -
去:0000060 蛋白质进口到核,易位 塔斯 7615630
去:0006607 含有NLS的底物进口到核中 塔斯 7627554
去:0006610 核糖体蛋白进口到核中 IEA -
GO:0044419 生物之间的种间相互作用 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 经验 1985200|7559393|9405152
去:0005634 IEA -
去:0005635 核信封 IEA -
去:0005643 核孔 塔斯 7627554
去:0005654 核质 经验 1985200|7559393|9405152
去:0005737 细胞质 塔斯 7615630

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
CD99 MIC2 |MIC2X |云 CD99分子 CD99与KPNB1相互作用。 绑定 15388255
Elavl1 Elav1 |hur |hua |梅尔 Elav(胚胎致死,异常视力,果蝇) - 类似1(Hu抗原R) - HPRD 15037768|15342649
FGFR1 BFGFR |CD331 |Cek |FGFBR |flg |FLJ99988 |flt2 |HBGFR |kal2 |n-sam 成纤维细胞生长因子受体1 - HPRD,Biogrid 11257130
H1F0 H10 |H1FV |MGC5241 H1组蛋白家庭,成员0 体外 Biogrid 10228156
IPO7 FLJ14581 |imp7 |MGC138673 |RANBP7 Importin 7 - HPRD,Biogrid 9214382|10228156
IPO8 FLJ26580 |RANBP8 Importin 8 - HPRD,Biogrid 9214382
KPNA1 IPOA5 |NPI-1 |RCH2 |SRP1 核桃蛋白α1(importin alpha 5) 重构的复合物 Biogrid 9102465|10523667
KPNA2 IPOA1 |qip2 |RCH1 |srp1alpha 核桃蛋白α2(抹布队1,importin alpha 1) 重构的复合物 Biogrid 9323134|10523667
|11283257
KPNA2 IPOA1 |qip2 |RCH1 |srp1alpha 核桃蛋白α2(抹布队1,importin alpha 1) - HPRD 8617226
KPNA3 IPOA4 |srp1gamma |srp4 |HSRP1 核桃蛋白α3(importin alpha 4) 重构的复合物 Biogrid 9435235|10523667
KPNA4 IPOA3 |MGC12217 |MGC26703 |QIP1 |srp3 核桃蛋白α4(Importin alpha 3) 重构的复合物 Biogrid 10523667
KPNA6 FLJ11249 |IPOA7 |kpna7 |MGC17918 核桃蛋白α6(importin alpha 7) - HPRD,Biogrid 10523667
莱斯特 CHS |CHS1 溶酶体贩运调节剂 - HPRD,Biogrid 11984006
NUP153 HNUP153 |N153 核孔蛋白153KDA - HPRD 9275187 | 10749866
NUP153 HNUP153 |N153 核孔蛋白153KDA 重构的复合物 Biogrid 10202161|10749866
|11266456
NUP50 MGC39961 |NPAP60 |NPAP60L 核孔蛋白50KDA - HPRD,Biogrid 12176322
NUP54 MGC13407 核孔蛋白54KDA 重构的复合物 Biogrid 11266456
NUP62 DKFZP547L134 |FLJ20822 |FLJ43869 |IBSN |MGC841 |sndi |p62 核孔蛋白62KDA 重构的复合物 Biogrid 9102465|11266456
NUP98 adir2 |NUP196 |NUP96 核孔蛋白98KDA - HPRD,Biogrid 9144189
nutf2 NTF2 |PP15 核运输因子2 重构的复合物 Biogrid 9102465
pthlh hhm |MGC14611 |PLP |PTHR |PTHRP 甲状旁腺激素样激素 - HPRD,Biogrid 11401507|12504010
PTMA MGC104802 |TMSA 螺赛蛋白,α - HPRD 11310559
ARA24 |GSP1 |TC4 RAN,RAS成员Ras Oncogene家族 远西方
重构的复合物
Biogrid 9102465|9135132
|10779340
ARA24 |GSP1 |TC4 RAN,RAS成员Ras Oncogene家族 - HPRD 8576188|9135132
ARA24 |GSP1 |TC4 RAN,RAS成员Ras Oncogene家族 KPNB1(PDB ID:1IBR_B)和RAN(PDB ID:1IBR_A)之间的相互作用。 绑定 7615630|7627554
|8896452|10367892
RANBP1 htf9a |MGC88701 运行结合蛋白1 重构的复合物 Biogrid 10473610|10779340
RANBP2 NUP358 |trp1 |TRP2 运行结合蛋白2 - HPRD,Biogrid 10473610
runx1t1 AML1T1 |CBFA2T1 |CDR |Eto |MGC2796 |mtg8 |mtg8b |zmynd2 与RUNT相关的转录因子1;易位为1(Cyclin D相关) - HPRD,Biogrid 10951564
Smad3 DKFZP586N0721 |DKFZP686J10186 |HSPC193 |HST17436 |JV15-2 |madh3 |MGC60396 SMAD家庭成员3 - HPRD,Biogrid 10846168
Smad4 DPC4 |jip |madh4 SMAD家庭成员4 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 10846168
SMN1 BCD541 |SMA |sma1 |sma2 |sma3 |sma4 |sma@ |SMN |SMNT |T-BCD541 运动神经元1,端粒的生存 - HPRD,Biogrid 12095920
snupn kpnbl |rnut1 |Snurportin1 Snurportin 1 - HPRD 12095920
Sox9 CMD1 |cmpd1 |SRA1 sry(性别确定区域y) - 框9 KPNB1(importin beta)与SOX9相互作用。 绑定 15889150
Sox9 CMD1 |cmpd1 |SRA1 sry(性别确定区域y) - 框9 - HPRD 11323423
SREBF2 SREBP2 |BHLHD2 固醇调节元件结合转录因子2 重构的复合物 Biogrid 11283257
terf1 FLJ41416 |PIN2 |trbf1 |trf |trf1 |htrf1-as |T-TRF1 端粒重复结合因子(NIMA相互作用)1 重构的复合物 Biogrid 12135354
TP53 FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 肿瘤蛋白p53 - HPRD,Biogrid 11297531
传统 HS.89862 |MGC11078 通过死亡域与TNFRSF1A相关 - HPRD 14743216
UBR5 DD5 |EDD |EDD1 |FLJ11310 |hyd |KIAA0896 |MGC57263 泛素蛋白连接酶E3成分N-验证蛋白5 - HPRD 12011095


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Biocarta Ranms途径 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID遇到了路径 80 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TCPTP途径 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID NFAT 3 Pathway 54 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SMAD2 3 Pathway 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IFN刺激基因的反应组抗病毒机制 66 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡诱导的DNA片段化 13 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素信号传导 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡 148 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感生命周期 203 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HIV感染 207 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
核糖核蛋白转运到宿主核的反应组转运 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 132 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome凋亡执行阶段 54 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钟对偶氮丁丁和TSA DN的反应 70 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Puiffe入侵被腹水抑制 82 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Timofeeva生长应力通过STAT1 DN 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Horiuchi WTAP目标DN 310 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hwang前列腺癌标记 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche乳头状瘤进度风险 74 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤复制编号 181 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李·威尔姆斯肿瘤的肿瘤变性 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘乳腺癌 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferrando T与MLL ENR融合DN一起 87 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL CBP融合DN的王目标 45 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园HSC和多能祖先 50 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
flt3的大风apl突变 56 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧正常 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制肌肉DN 51 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性4 307 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 118 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mueller Plurinet 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 UP 188 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卡波西肝癌遇到了 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇2的时间反应2 86 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kamminga衰老 41 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期M G1 148 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga PML Interactome 42 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向 279 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
山乳房干细胞DN 146 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
艾布拉姆森与艾尔互动 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-101 492 499 1A,M8 HSA-MIR-101 uacaguacugauaacugaag
mir-145 36 42 1a HSA-MIR-145 guccaguuucccaggaaucccuu
mir-148/152 207 213 1a HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-181 876 883 1A,M8 HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
mir-182 1093 1099 1a HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-194 953 959 1a HSA-MIR-194 uguaacagcaacuccauga
mir-199 35 41 1a HSA-MIR-199A cccaguucagacuaccuguuc
HSA-MIR-199B cccaguguuuagacuaucuuc
mir-203.1 635 641 1a HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-218 673 679 1a HSA-MIR-218 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-27 872 879 1A,M8 HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc
mir-342 554 560 M8 HSA-MIR-342 ucucacacagaaaucgcacccccguc
mir-361 1208 1215 1A,M8 HSA-MIR-361 uuaucagaaucuccagggguac
mir-377 553 559 M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-9 1095 1101 1a HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga
mir-96 1092 1099 1A,M8 HSA-MIR-96 uuuggcacuagcacauuuuugc