基因页:KPNB1
概括?
基因 | 3837 |
象征 | KPNB1 |
同义词 | IMB1 | IPO1 | IPOB | IMPNB | NTF97 |
描述 | 核桃蛋白亚基β1 |
参考 | MIM:602738|HGNC:HGNC:6400|HPRD:04114| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q21.32 |
Pascal P值 | 0.595 |
Sherlock P值 | 0.513 |
胎儿β | 0.112 |
DMG | 2(#研究) |
支持 | 结构可塑性 COMPOSITESET Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值:2.337 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG02415717 | 17 | 45727607 | KPNB1 | 3.865e-4 | -0.253 | 0.043 | DMG:Wockner_2014 |
CG24438655 | 17 | 45727598 | KPNB1 | -0.019 | 0.61 | DMG:Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KPNB1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008270 | 锌离子结合 | 塔斯 | 7615630 | |
去:0008565 | 蛋白质转运蛋白活性 | IEA | - | |
去:0008139 | 核定位序列结合 | 塔斯 | 7627554 | |
GO:0019904 | 蛋白质域特异性结合 | IPI | 11984006 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000059 | 蛋白质进口到核,对接 | IEA | - | |
去:0000060 | 蛋白质进口到核,易位 | 塔斯 | 7615630 | |
去:0006607 | 含有NLS的底物进口到核中 | 塔斯 | 7627554 | |
去:0006610 | 核糖体蛋白进口到核中 | IEA | - | |
GO:0044419 | 生物之间的种间相互作用 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | 经验 | 1985200|7559393|9405152 |
|
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005635 | 核信封 | IEA | - | |
去:0005643 | 核孔 | 塔斯 | 7627554 | |
去:0005654 | 核质 | 经验 | 1985200|7559393|9405152 |
|
去:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 7615630 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CD99 | MIC2 |MIC2X |云 | CD99分子 | CD99与KPNB1相互作用。 | 绑定 | 15388255 |
Elavl1 | Elav1 |hur |hua |梅尔 | Elav(胚胎致死,异常视力,果蝇) - 类似1(Hu抗原R) | - | HPRD | 15037768|15342649 |
FGFR1 | BFGFR |CD331 |Cek |FGFBR |flg |FLJ99988 |flt2 |HBGFR |kal2 |n-sam | 成纤维细胞生长因子受体1 | - | HPRD,Biogrid | 11257130 |
H1F0 | H10 |H1FV |MGC5241 | H1组蛋白家庭,成员0 | 体外 | Biogrid | 10228156 |
IPO7 | FLJ14581 |imp7 |MGC138673 |RANBP7 | Importin 7 | - | HPRD,Biogrid | 9214382|10228156 |
IPO8 | FLJ26580 |RANBP8 | Importin 8 | - | HPRD,Biogrid | 9214382 |
KPNA1 | IPOA5 |NPI-1 |RCH2 |SRP1 | 核桃蛋白α1(importin alpha 5) | 重构的复合物 | Biogrid | 9102465|10523667 |
KPNA2 | IPOA1 |qip2 |RCH1 |srp1alpha | 核桃蛋白α2(抹布队1,importin alpha 1) | 重构的复合物 | Biogrid | 9323134|10523667 |11283257 |
KPNA2 | IPOA1 |qip2 |RCH1 |srp1alpha | 核桃蛋白α2(抹布队1,importin alpha 1) | - | HPRD | 8617226 |
KPNA3 | IPOA4 |srp1gamma |srp4 |HSRP1 | 核桃蛋白α3(importin alpha 4) | 重构的复合物 | Biogrid | 9435235|10523667 |
KPNA4 | IPOA3 |MGC12217 |MGC26703 |QIP1 |srp3 | 核桃蛋白α4(Importin alpha 3) | 重构的复合物 | Biogrid | 10523667 |
KPNA6 | FLJ11249 |IPOA7 |kpna7 |MGC17918 | 核桃蛋白α6(importin alpha 7) | - | HPRD,Biogrid | 10523667 |
莱斯特 | CHS |CHS1 | 溶酶体贩运调节剂 | - | HPRD,Biogrid | 11984006 |
NUP153 | HNUP153 |N153 | 核孔蛋白153KDA | - | HPRD | 9275187 | 10749866 |
NUP153 | HNUP153 |N153 | 核孔蛋白153KDA | 重构的复合物 | Biogrid | 10202161|10749866 |11266456 |
NUP50 | MGC39961 |NPAP60 |NPAP60L | 核孔蛋白50KDA | - | HPRD,Biogrid | 12176322 |
NUP54 | MGC13407 | 核孔蛋白54KDA | 重构的复合物 | Biogrid | 11266456 |
NUP62 | DKFZP547L134 |FLJ20822 |FLJ43869 |IBSN |MGC841 |sndi |p62 | 核孔蛋白62KDA | 重构的复合物 | Biogrid | 9102465|11266456 |
NUP98 | adir2 |NUP196 |NUP96 | 核孔蛋白98KDA | - | HPRD,Biogrid | 9144189 |
nutf2 | NTF2 |PP15 | 核运输因子2 | 重构的复合物 | Biogrid | 9102465 |
pthlh | hhm |MGC14611 |PLP |PTHR |PTHRP | 甲状旁腺激素样激素 | - | HPRD,Biogrid | 11401507|12504010 |
PTMA | MGC104802 |TMSA | 螺赛蛋白,α | - | HPRD | 11310559 |
跑 | ARA24 |GSP1 |TC4 | RAN,RAS成员Ras Oncogene家族 | 远西方 重构的复合物 |
Biogrid | 9102465|9135132 |10779340 |
跑 | ARA24 |GSP1 |TC4 | RAN,RAS成员Ras Oncogene家族 | - | HPRD | 8576188|9135132 |
跑 | ARA24 |GSP1 |TC4 | RAN,RAS成员Ras Oncogene家族 | KPNB1(PDB ID:1IBR_B)和RAN(PDB ID:1IBR_A)之间的相互作用。 | 绑定 | 7615630|7627554 |8896452|10367892 |
RANBP1 | htf9a |MGC88701 | 运行结合蛋白1 | 重构的复合物 | Biogrid | 10473610|10779340 |
RANBP2 | NUP358 |trp1 |TRP2 | 运行结合蛋白2 | - | HPRD,Biogrid | 10473610 |
runx1t1 | AML1T1 |CBFA2T1 |CDR |Eto |MGC2796 |mtg8 |mtg8b |zmynd2 | 与RUNT相关的转录因子1;易位为1(Cyclin D相关) | - | HPRD,Biogrid | 10951564 |
Smad3 | DKFZP586N0721 |DKFZP686J10186 |HSPC193 |HST17436 |JV15-2 |madh3 |MGC60396 | SMAD家庭成员3 | - | HPRD,Biogrid | 10846168 |
Smad4 | DPC4 |jip |madh4 | SMAD家庭成员4 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10846168 |
SMN1 | BCD541 |SMA |sma1 |sma2 |sma3 |sma4 |sma@ |SMN |SMNT |T-BCD541 | 运动神经元1,端粒的生存 | - | HPRD,Biogrid | 12095920 |
snupn | kpnbl |rnut1 |Snurportin1 | Snurportin 1 | - | HPRD | 12095920 |
Sox9 | CMD1 |cmpd1 |SRA1 | sry(性别确定区域y) - 框9 | KPNB1(importin beta)与SOX9相互作用。 | 绑定 | 15889150 |
Sox9 | CMD1 |cmpd1 |SRA1 | sry(性别确定区域y) - 框9 | - | HPRD | 11323423 |
SREBF2 | SREBP2 |BHLHD2 | 固醇调节元件结合转录因子2 | 重构的复合物 | Biogrid | 11283257 |
terf1 | FLJ41416 |PIN2 |trbf1 |trf |trf1 |htrf1-as |T-TRF1 | 端粒重复结合因子(NIMA相互作用)1 | 重构的复合物 | Biogrid | 12135354 |
TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | 肿瘤蛋白p53 | - | HPRD,Biogrid | 11297531 |
传统 | HS.89862 |MGC11078 | 通过死亡域与TNFRSF1A相关 | - | HPRD | 14743216 |
UBR5 | DD5 |EDD |EDD1 |FLJ11310 |hyd |KIAA0896 |MGC57263 | 泛素蛋白连接酶E3成分N-验证蛋白5 | - | HPRD | 12011095 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Biocarta Ranms途径 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID遇到了路径 | 80 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TCPTP途径 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID NFAT 3 Pathway | 54 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID SMAD2 3 Pathway | 17 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IFN刺激基因的反应组抗病毒机制 | 66 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组凋亡诱导的DNA片段化 | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素信号传导 | 159 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组凋亡 | 148 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感生命周期 | 203 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
核糖核蛋白转运到宿主核的反应组转运 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 | 132 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome凋亡执行阶段 | 54 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钟对偶氮丁丁和TSA DN的反应 | 70 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Puiffe入侵被腹水抑制 | 82 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Timofeeva生长应力通过STAT1 DN | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Horiuchi WTAP目标DN | 310 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hwang前列腺癌标记 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
darwiche乳头状瘤进度风险 | 74 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤复制编号 | 181 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与腔内 | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李·威尔姆斯肿瘤的肿瘤变性 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘乳腺癌 | 30 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferrando T与MLL ENR融合DN一起 | 87 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MLL CBP融合DN的王目标 | 45 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
公园HSC和多能祖先 | 50 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
flt3的大风apl突变 | 56 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制肌肉DN | 51 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性4 | 307 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 | 118 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G3 UP | 188 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
卡波西肝癌遇到了 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇2的时间反应2 | 86 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kamminga衰老 | 41 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期M G1 | 148 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Karlsson TGFB1靶向 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga PML Interactome | 42 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向 | 279 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
山乳房干细胞DN | 146 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
艾布拉姆森与艾尔互动 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-101 | 492 | 499 | 1A,M8 | HSA-MIR-101 | uacaguacugauaacugaag |
mir-145 | 36 | 42 | 1a | HSA-MIR-145 | guccaguuucccaggaaucccuu |
mir-148/152 | 207 | 213 | 1a | HSA-MIR-148A | ucagugcacuacaacuuugu |
HSA-MIR-152脑 | UCAGUGCAUGACACUUGGG | ||||
HSA-MIR-148B | ucagugcaucacacaacuuugu | ||||
mir-181 | 876 | 883 | 1A,M8 | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
mir-182 | 1093 | 1099 | 1a | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
mir-194 | 953 | 959 | 1a | HSA-MIR-194 | uguaacagcaacuccauga |
mir-199 | 35 | 41 | 1a | HSA-MIR-199A | cccaguucagacuaccuguuc |
HSA-MIR-199B | cccaguguuuagacuaucuuc | ||||
mir-203.1 | 635 | 641 | 1a | HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
mir-218 | 673 | 679 | 1a | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
mir-27 | 872 | 879 | 1A,M8 | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
mir-342 | 554 | 560 | M8 | HSA-MIR-342脑 | ucucacacagaaaucgcacccccguc |
mir-361 | 1208 | 1215 | 1A,M8 | HSA-MIR-361脑 | uuaucagaaucuccagggguac |
mir-377 | 553 | 559 | M8 | HSA-MIR-377 | aucacacaaaggaacuuuuugu |
mir-9 | 1095 | 1101 | 1a | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |
mir-96 | 1092 | 1099 | 1A,M8 | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |