基因页面:KPNA3
总结吗?
| GeneID | 3839年 |
| 象征 | KPNA3 |
| 同义词 | IPOA4 | SRP1 | SRP1gamma | SRP4 | hSRP1 |
| 描述 | karyopherinα亚基3 |
| 参考 | MIM: 601892|HGNC: HGNC: 6396|运用:ENSG00000102753|HPRD: 03536|织女:OTTHUMG00000016922 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 13 q14.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.164 |
| 夏洛克假定值 | 0.207 |
| 胎儿β | 0.53 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 协会 | 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 | 1 | 链接到SZGene |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005488 | 绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 15057270|17353931|17981117 |
|
| 去:0008565 | 转运蛋白活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008139 | 核本地化序列绑定 | 助教 | 9435235 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006461 | 蛋白质复合体组装 | 助教 | 9435235 | |
| 去:0006607 | NLS-bearing衬底导入到细胞核 | 助教 | 9435235 | |
| 去:0006886 | 细胞内蛋白质的运输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005643 | 核孔 | 助教 | 9154134 | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 通过干扰素刺激基因REACTOME抗病毒机制 | 66年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME干扰素信号 | 159年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME免疫系统 | 933年 | 616年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME细胞因子在免疫系统信号 | 270年 | 204年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 奥斯曼膀胱癌了 | 404年 | 246年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN MC和阿霉素DN | 770年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 | 855年 | 609年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN | 483年 | 336年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 胎儿肝脏DN MARTORIATI MDM4目标 | 514年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SOX2目标 | 734年 | 436年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TCGA胶质母细胞瘤拷贝数DN | 31日 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTROEM与IL5 DN | 64年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 彭雷帕霉素反应DN | 245年 | 154年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NEMETH炎症反应有限合伙人 | 88年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森受FOXP3刺激 | 1022年 | 619年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 巨噬细胞培养宽容DN | 409年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 林黑色素瘤拷贝数DN | 41 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝癌了 | 973年 | 570年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BONCI MIR15A MIR16 1的目标 | 91年 | 75年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 年级结肠癌和直肠癌 | 285年 | 167年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 西方肾上腺皮质肿瘤了 | 294年 | 199年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 张及目标36小时DN | 185年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋触性了 | 518年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陆EZH2 DN的目标 | 414年 | 237年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应早期晚了 | 317年 | 190年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 101 | 1045年 | 1051年 | 1 | hsa - mir - 101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG |
| miR-103/107 | 2303年 | 2309年 | 1 | hsa - mir - 103大脑 | AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUGA |
| hsa - mir - 107大脑 | AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUCA | ||||
| miR-124/506 | 1844年 | 1850年 | m8 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir - 128 | 1512年 | 1518年 | 1 | hsa - mir - 128 a | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU |
| hsa - mir - 128 b | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC | ||||
| mir - 134 | 141年 | 147年 | m8 | hsa - mir - 134大脑 | UGUGACUGGUUGACCAGAGGG |
| mir - 135 | 130年 | 136年 | m8 | hsa - mir - 135 a | UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA |
| hsa - mir - 135 b | UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG | ||||
| mir - 138 | 1114年 | 1120年 | 1 | hsa - mir - 138大脑 | AGCUGGUGUUGUGAAUC |
| miR-141/200a | 2327年 | 2333年 | m8 | hsa - mir - 141 | UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG |
| hsa - mir - 200 a | UAACACUGUCUGGUAACGAUGU | ||||
| mir - 144 | 1045年 | 1051年 | 1 | hsa - mir - 144 | UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG |
| miR-15/16/195/424/497 | 2459年 | 2465年 | 1 | hsa-miR-15a大脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
| hsa-miR-16大脑 | UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG | ||||
| hsa-miR-15b大脑 | UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA | ||||
| hsa - mir - 195深圳 | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
| hsa - mir - 424 | CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA | ||||
| hsa - mir - 497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU | ||||
| miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d | 2307年 | 2313年 | m8 | hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
| hsa-miR-20a大脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 106 a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
| hsa - mir - 106 b深圳 | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
| hsa-miR-20b深圳 | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 519 d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
| hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU | ||||
| hsa-miR-20a大脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 106 a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
| hsa - mir - 106 b深圳 | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
| hsa-miR-20b深圳 | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 519 d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
| mir - 182 | 155年 | 162年 | 1、m8 | hsa - mir - 182 | UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA |
| mir - 186 | 1854年 | 1860年 | 1 | hsa - mir - 186 | CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU |
| mir - 188 | 1462年 | 1469年 | 1、m8 | hsa - mir - 188 | CAUCCCUUGCAUGGUGGAGGGU |
| miR-19 | 2100年 | 2107年 | 1、m8 | hsa-miR-19a | UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA |
| hsa-miR-19b | UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA | ||||
| mir - 208 | 1057年 | 1063年 | 1 | hsa - mir - 208 | AUAAGACGAGCAAAAAGCUUGU |
| mir - 214 | 757年 | 763年 | m8 | hsa - mir - 214大脑 | ACAGCAGGCACAGACAGGCAG |
| mir - 223 | 524年 | 531年 | 1、m8 | hsa - mir - 223 | UGUCAGUUUGUCAAAUACCCC |
| miR-23 | 1457年 | 1463年 | 1 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
| hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
| miR-24 | 428年 | 434年 | m8 | hsa-miR-24深圳 | UGGCUCAGUUCAGCAGGAACAG |
| miR-26 | 821年 | 827年 | 1 | hsa-miR-26a大脑 | UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC |
| hsa-miR-26b深圳 | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
| miR-27 | 1512年 | 1518年 | m8 | hsa-miR-27a大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC |
| hsa-miR-27b大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC | ||||
| miR-30-5p | 1041年 | 1047年 | m8 | hsa-miR-30a-5p | UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG |
| hsa-miR-30c大脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
| hsa-miR-30d深圳 | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
| hsa-miR-30b深圳 | UGUAAACAUCCUACACUCAGCU | ||||
| hsa-miR-30e-5p | UGUAAACAUCCUUGACUGGA | ||||
| mir - 323 | 1096年 | 1102年 | m8 | hsa - mir - 323大脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |
| mir - 324 - 3 - p | 1270年 | 1276年 | 1 | hsa - mir - 324 - 3 - p | CCACUGCCCCAGGUGCUGCUGG |
| miR-33 | 1447年 | 1453年 | m8 | hsa-miR-33 | GUGCAUUGUAGUUGCAUUG |
| hsa-miR-33b | GUGCAUUGCUGUUGCAUUGCA | ||||
| mir - 381 | 1657年 | 1663年 | m8 | hsa - mir - 381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU |
| hsa - mir - 381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU | ||||
| mir - 409 - 5 - p | 1079年 | 1085年 | 1 | hsa - mir - 409 - 5 - p | AGGUUACCCGAGCAACUUUGCA |
| hsa - mir - 409 - 5 - p | AGGUUACCCGAGCAACUUUGCA | ||||
| mir - 431 | 370年 | 376年 | 1 | hsa - mir - 431 | UGUCUUGCAGGCCGUCAUGCA |
| mir - 448 | 190年 | 196年 | m8 | hsa - mir - 448 | UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU |
| mir - 455 | 1817年 | 1823年 | 1 | hsa - mir - 455 | UAUGUGCCUUUGGACUACAUCG |
| mir - 499 | 1056年 | 1063年 | 1、m8 | hsa - mir - 499 | UUAAGACUUGCAGUGAUGUUUAA |
| mir - 500 | 414年 | 420年 | m8 | hsa - mir - 500 | AUGCACCUGGGCAAGGAUUCUG |
| mir - 503 | 2459年 | 2465年 | 1 | hsa - mir - 503 | UAGCAGCGGGAACAGUUCUGCAG |
| mir - 539 | 1779年 | 1785年 | m8 | hsa - mir - 539 | GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU |
| mir - 542 - 3 - p | 1399年 | 1406年 | 1、m8 | hsa - mir - 542 - 3 - p | UGUGACAGAUUGAUAACUGAAA |
| mir - 96 | 156年 | 162年 | 1 | hsa - mir - 96大脑 | UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC |