基因页：RHOA

概括?
GeneID 387
Symbol RHOA
Synonyms ARH12|ARHA|RHO12|RHOH12
Description RAS同源家庭成员
Reference MIM:165390|HGNC:HGNC:667|Ensembl:ENSG00000067560|HPRD:01323|Vega:OTTHUMG00000156838
Gene type protein-coding
地图位置 3p21.3
Pascal p-value 0.026
Sherlock P值 0.006
Fetal beta -0.426
支持 INTRACELLULAR SIGNAL TRANSDUCTION
Potential synaptic genes

数据源中的基因
基因集名称 Method of gene set Description Info
CV:PGCnp 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 1
PMID:cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature High-throughput literature-search 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details
go_annotation Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations Hits with neuro-related keywords: 2
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.0603

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position 最近的基因 P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg16951854 3 49449507 RHOA;TCTA 9.37E-5 0.351 0.027 DMG:Wockner_2014


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

前10个积极共表达的基因
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
H2AFY2 0.87 0.92
STAG1 0.86 0.89
PHF16 0.85 0.81
RNF122 0.85 0.72
LRCH2 0.84 0.92
KDM1 0.84 0.94
ZNF491 0.84 0.79
ZNF738 0.84 0.85
ZBTB5 0.84 0.90
PRIM1 0.84 0.85
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
HLA-F -0.60 -0.84
TNFSF12 -0.59 -0.67
C5orf53 -0.59 -0.78
PTH1R -0.58 -0.74
FBXO2 -0.58 -0.68
AIFM3 -0.58 -0.81
ALDOC -0.58 -0.74
LHPP -0.57 -0.64
LDHD -0.56 -0.69
SLC9A3R2 -0.56 -0.57

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000166 核苷酸结合 IEA -
GO:0000287 magnesium ion binding IEA -
去：0003924 GTPase activity 塔斯 10436159
GO:0005515 protein binding IPI 15644318
GO:0005525 GTP结合 IEA -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0007519 骨骼肌发育 IEA neuron (GO term level: 8) -
GO:0043524 神经元细胞凋亡的阴性调节 IEA neuron (GO term level: 9) -
GO:0000902 cell morphogenesis IEA -
GO:0007160 cell-matrix adhesion IEA -
GO:0007155 细胞粘附 IEA -
GO:0007266 RHO蛋白信号转导 塔斯 10436159
GO:0007264 small GTPase mediated signal transduction IEA -
GO：0043149 stress fiber formation IEA -
GO:0042346 positive regulation of NF-kappaB import into nucleus NAS 12761501
GO:0030154 cell differentiation IEA -
去：0030036 actin cytoskeleton organization 塔斯 10436159
GO：0043123 positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade IEP 12761501
Cellular component 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005829 cytosol IEA -
GO:0005856 cytoskeleton IEA -
GO:0005622 intracellular IEA -
去：0005634 nucleus IEA -
GO:0005737 cytoplasm IEA -
去：0005886 质膜 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental Source PubMed ID
AKAP13 AKAP-LBC |brx |FLJ11952 |FLJ43341 |ha-3 |HT31 |LBC |原始-LB |原始-LBC |C-LBC A kinase (PRKA) anchor protein 13 - HPRD，Biogrid 11696353|12423633
ARHGAP1 cdc42gap |Rhogap |Rhogap1 |p50rhogap Rho GTPase activating protein 1 - HPRD，Biogrid 9407060|9548756
ARHGAP10 FLJ20896 | FLJ41791 | GRAF2 | PS-GAP Rho GTPase激活蛋白10 Biochemical Activity BioGRID 11432776
ARHGAP21 ARHGAP10 | DKFZp761L0424 | FLJ33323 | FLJ90108 Rho GTPase激活蛋白21 ARHGAP21 interacts with RhoA-GTP, and acts as a GAP to increase RhoA GTPase activity. 绑定 15793564
ARHGAP26 FLJ42530 | GRAF | KIAA0621 | OPHN1L | OPHN1L1 Rho GTPase激活蛋白26 Biochemical Activity BioGRID 11432776
ARHGAP5 GFI2 | RhoGAP5 | p190-B Rho GTPase activating protein 5 Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex		 BioGRID 12842009
ARHGAP8 BPGAP1 | FLJ20185 | PP610 Rho GTPase activating protein 8 BPGAP1 interacts with RhoA. 绑定 12944407
ARHGDIA GDIA1 |MGC117248 |Rhogdi |Rhogdi-1 Rho GDP dissociation inhibitor (GDI) alpha - HPRD，Biogrid 11149925
ARHGDIB D4 | GDIA2 | GDID4 | LYGDI | Ly-GDI | RAP1GN1 | RhoGDI2 RHO GDP解离抑制剂（GDI）β - HPRD，Biogrid 9799233
ARHGDIG RHOGDI-3 Rho GDP dissociation inhibitor (GDI) gamma - HPRD，Biogrid 9113980
Arhgef1 GEF1 | LBCL2 | LSC | P115-RHOGEF | SUB1.5 Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1 Biochemical Activity BioGRID 12748184
Arhgef11 DKFZp667F1223 | GTRAP48 | KIAA0380 | PDZ-RHOGEF Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 11 - HPRD，Biogrid 10526156
Arhgef12 DKFZp686O2372 | KIAA0382 | LARG | PRO2792 Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 12 - HPRD，Biogrid 11373293
Arhgef18 KIAA0521 | MGC15913 Rho/RAC鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEF）18 - HPRD，Biogrid 11085924
Arhgef2 DKFZP547L106 |DKFZP547P1516 |GEF |GEF-H1 |gefh1 |KIAA0651 |LFP40 |P40 Rho/RAC鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEF）2 - HPRD，Biogrid 9857026
Arhgef3 DKFZp434F2429 | FLJ98126 | GEF3 | MGC118905 | STA3 | XPLN Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 3 - HPRD，Biogrid 12221096
Arhgef4 ASEF | ASEF1 | GEF4 | STM6 Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 4 - HPRD，Biogrid 10947987
BID FP497 |MGC15319 |MGC42355 BH3互动域死亡激动剂 Co-purification BioGRID 15659383
CASP10 Alps2 |flice2 |MCH4 caspase 10，与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 Co-purification BioGRID 15659383
CASP8 ALPS2B | CAP4 | FLICE | FLJ17672 | MACH | MCH5 | MGC78473 caspase 8，与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 Co-purification BioGRID 15659383
CIT CRIK | KIAA0949 | STK21 citron (rho-interacting, serine/threonine kinase 21) 远西方
Reconstituted Complex
两个杂交		 BioGRID 8543060|12773565
CNKSR1 CNK | CNK1 | KSR connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1 - HPRD 14749388
CNKSR1 CNK | CNK1 | KSR connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1 hCNK1 interacts with RhoA. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between human CNK1 and RhoA from an unspecified species. 绑定 14749388
CNTNAP1 CASPR | CNTNAP | NRXN4 | P190 contactin associated protein 1 - HPRD 9407060
CRMP1 DPYSL1 | DRP-1 | DRP1 折叠蛋白反应介质蛋白1 Phenotypic Suppression BioGRID 12482610
daam1 FLJ41657 |KIAA0666 dishevelled associated activator of morphogenesis 1 - HPRD 11779461
DEF6 IBP | SLAT differentially expressed in FDCP 6 homolog (mouse) - HPRD，Biogrid 15023524
DEF6 IBP | SLAT differentially expressed in FDCP 6 homolog (mouse) DEF6 interacts with RhoA. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between human DEF6 and RhoA from an unspecified species. 绑定 15023524
DGKQ DAGK | DAGK4 | DAGK7 二酰基甘油激酶，theta 110kDa - HPRD，Biogrid 10066731
DIAPH1 DFNA1 |dia1 |drf1 |FLJ25265 |lfhl1 |HDIA1 diaphanous homolog 1 (Drosophila) Reconstituted Complex
两个杂交		 BioGRID 12773565
DOCK7 KIAA1771 |ZIR2 dedicator of cytokinesis 7 - HPRD 12432077
DPYSL2 CRMP2 | DHPRP2 | DRP-2 | DRP2 dihydropyrimidinase-like 2 Phenotypic Suppression BioGRID 12482610
EZR cvil |CVL |DKFZP762H157 |FLJ26216 |MGC1584 |vil2 ezrin Co-purification BioGRID 15659383
FADD Gig3 |MGC8528 |Mort1 Fas (TNFRSF6)-associated via death domain Co-purification BioGRID 15659383
FAS ALPS1A | APO-1 | APT1 | CD95 | FAS1 | FASTM | TNFRSF6 Fas (TNF receptor superfamily, member 6) Co-purification BioGRID 15659383
FASLG APT1LG1 | CD178 | CD95L | FASL | TNFSF6 Fas ligand (TNF superfamily, member 6) Co-purification BioGRID 15659383
FLNA ABP-280 | ABPX | DKFZp434P031 | FLN | FLN1 | FMD | MNS | NHBP | OPD | OPD1 | OPD2 filamin A, alpha (actin binding protein 280) - HPRD 10051605
GEFT p63RhoGEF RhoA/RAC/CDC42 exchange factor - HPRD，Biogrid 15069594
GMIP - 宝石相互作用的蛋白质 - HPRD 12093360
GNA12 MGC104623 |MGC99644 |nnx3 |rmp |GEP guanine nucleotide binding protein (G protein) alpha 12 Reconstituted Complex BioGRID 12515866
GRLF1 GRF-1 | KIAA1722 | MGC10745 | P190-A | P190A | p190RhoGAP glucocorticoid receptor DNA binding factor 1 Reconstituted Complex BioGRID 9548756
HSPA1A FLJ54303 | FLJ54370 | FLJ54392 | FLJ54408 | FLJ75127 | HSP70-1 | HSP70-1A | HSP70I | HSP72 | HSPA1 | HSPA1B heat shock 70kDa protein 1A Affinity Capture-Western BioGRID 12490434
ICMT HSTE14 | MGC39955 | MST098 | MSTP098 | PCCMT | PCMT | PPMT isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase - HPRD，Biogrid 9614111
ITPR1 INSP3R1 | IP3R | IP3R1 | SCA15 | SCA16 inositol 1,4,5-triphosphate receptor, type 1 Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex		 BioGRID 12766172
KCNA2 HBK5 | HK4 | HUKIV | KV1.2 | MGC50217 | MK2 | NGK1 | RBK2 钾电压门控通道，与振动振动器相关的亚家族，成员2 Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
两个杂交		 BioGRID 9635436
KTN1 CG1 | KIAA0004 | KNT | MGC133337 | MU-RMS-40.19 kinectin 1 (kinesin receptor) - HPRD 8769096|11689693
KTN1 CG1 | KIAA0004 | KNT | MGC133337 | MU-RMS-40.19 kinectin 1 (kinesin receptor) 两个杂交 BioGRID 8769096|11162552
|11689693|12773565
MAPK8 JNK | JNK1 | JNK1A2 | JNK21B1/2 | PRKM8 | SAPK1 mitogen-activated protein kinase 8 Co-purification BioGRID 15659383
MCF2 DBL MCF.2细胞系导出转换序列 - HPRD，Biogrid 10854437
MCF2L Arhgef14 | DBS | FLJ12122 | KIAA0362 | OST MCF.2细胞系导出转换序列-like RhoA specifically interacts with Dbl-homology and pleckstrin-homology domains of the nucleotide exchange factor Dbs. This interaction is modelled on a demonstrated interaction between mouse Dbs and human RhoA. 绑定 12006984
MCF2L Arhgef14 | DBS | FLJ12122 | KIAA0362 | OST MCF.2细胞系导出转换序列-like - HPRD，Biogrid 12006984
MPRIP KIAA0864 | M-RIP | RHOIP3 | p116Rip myosin phosphatase Rho interacting protein - HPRD 14506264
MPRIP KIAA0864 | M-RIP | RHOIP3 | p116Rip myosin phosphatase Rho interacting protein - HPRD，Biogrid 9199174
MSN - Moesin Co-purification BioGRID 15659383
net1 ARHGEF8 | NET1A neuroepithelial cell transforming 1 两个杂交 BioGRID 9535835
OPHN1 MRX60 | OPN1 寡素1 - HPRD，Biogrid 9582072|11998687
PDE6D PDED 磷酸二酯酶6D，CGMP特异性，杆，三角洲 - HPRD，Biogrid 11786539
PITPNM1 DRES9 | FLJ44997 | NIR2 | PITPNM | RDGB | RDGB1 | RDGBA | RDGBA1 | Rd9 phosphatidylinositol transfer protein, membrane-associated 1 Nir2 interacts with RhoA. 绑定 15125835
PKN1 DBK |MGC46204 |pak1 |PKN |pkn-alpha |prk1 |PRKCL1 protein kinase N1 - HPRD，Biogrid 9446575
PKN2 MGC150606 |MGC71074 |pak2 |prk2 |prkcl2 |Pro2042 |PAK-2 protein kinase N2 - HPRD，Biogrid 8910519
PLCG1 PLC-II |PLC1 |PLC148 |Plcgamma1 phospholipase C, gamma 1 - HPRD，Biogrid 12071848
PLD1 - phospholipase D1, phosphatidylcholine-specific - HPRD，Biogrid 11311142|12593858
PLEKHG2 CLG | DKFZp667J2325 | FLJ00018 | FLJ22458 | FLJ38638 PLECKSTRIN同源域包含family G（带有Rhogef域）成员2 - HPRD，Biogrid 11839748
PPP1R12A MBS | MGC133042 | MYPT1 protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 12A - HPRD 9354661
prkca AAG6 | MGC129900 | MGC129901 | PKC-alpha | PKCA | PRKACA protein kinase C, alpha in vivo BioGRID 11284700
RABAC1 PRA1 | PRAF1 | YIP3 Rab acceptor 1 (prenylated) - HPRD 11335720
RAP1GDS1 GDS1 | MGC118859 | MGC118861 | SmgGDS RAP1, GTP-GDP dissociation stimulator 1 - HPRD，Biogrid 11948427
RHPN1 KIAA1929 | ODF5 | RHOPHILIN | RHPN rhophilin, Rho GTPase binding protein 1 - HPRD 12221077
RHPN2 RhoBP | p76RBE rhophilin, Rho GTPase binding protein 2 - HPRD 12221077
RHPN2 RhoBP | p76RBE rhophilin, Rho GTPase binding protein 2 两个杂交 BioGRID 12773565
RICS GC-GAP | GRIT | KIAA0712 | MGC1892 | p200RhoGAP | p250GAP Rho GTPase-activating protein Biochemical Activity BioGRID 12446789|12454018
|12857875
RIPK4 ANKK2 | ANKRD3 | DIK | MGC129992 | MGC129993 | PKK | RIP4 receptor-interacting serine-threonine kinase 4 两个杂交 BioGRID 9199174
ROCK1 MGC131603 |MGC43611 |P160ROCK |Pro0435 Rho-associated, coiled-coil containing protein kinase 1 - HPRD，Biogrid 8798490
ROCK2 KIAA0619 Rho-associated, coiled-coil containing protein kinase 2 Affinity Capture-Western BioGRID 11350930
rtkn - 罗特金 RhoA interacts with RTKN (Rhotekin). This interaction was modeled on a demonstrated interaction between RhoA and RTKN from an unspecified species. 绑定 15652748
rtkn - 罗特金 Rhotekin与Rhoa-GTP相互作用。这种相互作用是建立在未指定物种和人类Rho-GTP的Rhotekin之间的相互作用的模型的。 绑定 15467718
rtkn - 罗特金 - HPRD 8662891
rtkn - 罗特金 rtkn(rhotekin) interacts with RhoA. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between mouse RTKN and human RhoA. 绑定 15766663
rtkn - 罗特金 Reconstituted Complex BioGRID 12593858
rtkn - 罗特金 RhoA与Rhotekin交互。这种互动modeled on a demonstrated interaction between human RhoA and Rhotekin from an unspecified species. 绑定 15834426
rtkn - 罗特金 Active, GTP-bound RhoA interacts with the RTKN (Rhotekin) Rho binding domain. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between human RhoA and Rhotekin from an unspecified species. 绑定 15889147
SH3BP1 - SH3-domain binding protein 1 - HPRD 9548756
SPRED2 FLJ21897 | FLJ31917 | MGC163164 | Spred-2 sprouty-related, EVH1 domain containing 2 - HPRD 15184877
SRGAP1 ARHGAP13 | FLJ22166 | KIAA1304 缝隙 - robo rho gtpase激活蛋白1 - HPRD 11672528
tec MGC126760 |MGC126762 |PSCTK4 tec protein tyrosine kinase Reconstituted Complex BioGRID 12515866
TGM2 G-ALPHA-h | GNAH | TG2 | TGC 转谷氨酰胺酶2（C多肽，蛋白质 - 谷氨酰胺 - 谷氨酸转移酶） - HPRD 11350930
TNFRSF10B CD262 | DR5 | KILLER | KILLER/DR5 | TRAIL-R2 | TRAILR2 | TRICK2 | TRICK2A | TRICK2B | TRICKB | ZTNFR9 tumor necrosis factor receptor superfamily, member 10b Co-purification BioGRID 15659383
TNFRSF1A CD120a | FPF | MGC19588 | TBP1 | TNF-R | TNF-R-I | TNF-R55 | TNFAR | TNFR1 | TNFR55 | TNFR60 | p55 | p55-R | p60 tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1A Co-purification BioGRID 15659383
三人组 FLJ42780 | tgat 三重功能域（PTPRF相互作用） - HPRD，Biogrid 10948190
TRPC1 HTRP-1 | MGC133334 | MGC133335 | TRP1 transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 1 - HPRD，Biogrid 12766172
VAV2 - vav 2 guanine nucleotide exchange factor - HPRD 11909943
VAV3 FLJ40431 vav 3 guanine nucleotide exchange factor - HPRD，Biogrid 10523675


V.途径注释

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
KEGG CHEMOKINE SIGNALING PATHWAY 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg血管平滑肌收缩 115 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg wnt信号通路 151 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg tgf beta信号通路 86 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG AXON GUIDANCE 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG FOCAL ADHESION 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ADHERENS JUNCTION 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG TIGHT JUNCTION 134 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG T CELL RECEPTOR SIGNALING PATHWAY 108 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG LEUKOCYTE TRANSENDOTHELIAL MIGRATION 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG NEUROTROPHIN SIGNALING PATHWAY 126 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG REGULATION OF ACTIN CYTOSKELETON 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PATHOGENIC ESCHERICHIA COLI INFECTION 59 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PATHWAYS IN CANCER 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG COLORECTAL CANCER 62 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CCR3 PATHWAY 23 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA ECM PATHWAY 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA RACCYCD PATHWAY 26 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA INTEGRIN PATHWAY 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA EDG1 PATHWAY 27 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA AKAPCENTROSOME PATHWAY 15 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA RAS PATHWAY 23 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA RHO PATHWAY 32 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA AKAP13 PATHWAY 12 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CARDIACEGF PATHWAY 18 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA MAL PATHWAY 19 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CDC42RAC PATHWAY 16 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA PAR1 PATHWAY 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA TFF PATHWAY 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA UCALPAIN PATHWAY 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA TRKA RECEPTOR 17 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ENDOTHELIN PATHWAY 63 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PRL SIGNALING EVENTS PATHWAY 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RHOA PATHWAY 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid aurora b途径 39 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID溶物磷脂途径 66 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID WNT NONCANONICAL PATHWAY 32 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ER NONGENOMIC PATHWAY 41 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID遇到了路径 80 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PTP1B PATHWAY 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P3 PATHWAY 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3 OPN途径 31 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P4途径 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RHOA REG PATHWAY 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RET PATHWAY 39 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TXA2PATHWAY 57 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SHP2途径 58 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P1 PATHWAY 21 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Netrin途径 32 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ARF6 DOWNSTREAM PATHWAY 15 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MTOR 4 Pathway 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL2 1 Pathway 55 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR4 PATHWAY 102 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PLK1 PATHWAY 46 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID凝血酶PAR4途径 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PI3KCI PATHWAY 49 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P75 NTR PATHWAY 69 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Ecadherin新生AJ途径 39 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AMB2中性粒细胞途径 41 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3整合素途径 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID LIS1 PATHWAY 28 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Syndecan 4途径 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID EPHA FWDPATHWAY 34 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ECADHERIN KERATINOCYTE PATHWAY 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PDGFRB PATHWAY 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TRKR途径 62 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ECADHERIN STABILIZATION PATHWAY 42 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID VEGFR1 2 PATHWAY 69 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID THROMBIN PAR1 PATHWAY 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SYNDECAN 2 PATHWAY 33 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TOLL ENDOGENOUS PATHWAY 25 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID NCADHERIN途径 33 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P2途径 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID EPHA2 FWD PATHWAY 19 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FAK PATHWAY 59 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TGFBR PATHWAY 55 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY RHO GTPASES 113 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 137 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome TGFβ受体信号在EMT上皮向间充质转变中 16 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PI3K AKT ACTIVATION 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME我正常受体介导信号关系 81 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GPVI MEDIATED ACTIVATION CASCADE 31 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME AXON GUIDANCE 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha1213信号传导事件 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SEMA4D IN SEMAPHORIN SIGNALING 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SEMAPHORIN INTERACTIONS 68 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SEMA4D INDUCED CELL MIGRATION AND GROWTH CONE COLLAPSE 27 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G BETA GAMMA SIGNALLING THROUGH PI3KGAMMA 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G蛋白β伽马信号传导 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY TGF BETA RECEPTOR COMPLEX 63 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIARADONNA NEOPLASTIC TRANSFORMATION CDC25 DN 153 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI LUNG CANCER 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALCALA APOPTOSIS 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ MBD TARGETS 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN METASTASIS DN 261 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西葫芦转移DN 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IIZUKA LIVER CANCER PROGRESSION L0 L1 DN 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZAMORA NOS2 TARGETS UP 69 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS LATE PROGENITOR 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiba对TSA的反应 50 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MACLACHLAN BRCA1 TARGETS UP 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG PROLIFERATING VS QUIESCENT 51 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELLA RESPONSE TO TSA AND BUTYRATE 21 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERRECCHIA EARLY RESPONSE TO TGFB1 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
兰普早期丰富学习环境 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERRECCHIA RESPONSE TO TGFB1 C3 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOSEPH RESPONSE TO SODIUM BUTYRATE UP 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHONG SECRETOME OF LUNG CANCER AND FIBROBLAST 132 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO METHYLATED IN LIVER CANCER DN 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO HOUSEKEEPING GENES 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS UNANNOTATED DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML WITH INV 16 TRANSLOCATION 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与T 9 11易位 130 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金所有障碍少突细胞数量ORR UP 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM BIPOLAR DISORDER OLIGODENDROCYTE DENSITY CORR UP 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABDELMOHSEN ELAVL4 TARGETS 16 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Holleman daunorubicin B全部DN 12 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position miRNA ID miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-142-5p 330 337 1A,m8 hsa-miR-142-5p CAUAAAGUAGAAAGCACUAC
mir-185 987 994 1A,m8 hsa-miR-185brain Uggagaaaggcaguuc
MiR-200BC/429 133 139 m8 HSA-MIR-200B UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-361 742 749 1A,m8 hsa-miR-361brain UUAUCAGAAUCUCCAGGGGUAC
mir-381 614 620 1A hsa-miR-381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
miR-485-3p 62 68 m8 hsa-miR-485-3p GUCAUACACGGCUCUCCUCUCU