基因页:GPR153
概括?
基因 | 387509 |
象征 | GPR153 |
同义词 | pgr1 |
描述 | G蛋白偶联受体153 |
参考 | MIM:614269|HGNC:HGNC:23618|Ensembl:ENSG00000158292|HPRD:13600|Vega:Otthumg00000001272 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p36.31 |
Pascal P值 | 0.554 |
胎儿β | 0.52 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 皮质 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
DNM:Ambalavanan_2016 | 整个外显子组测序 | 该数据集包括在17个cos概率中检测到的20个从头突变。 | |
DNM:XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
GPR153 | CHR1 | 6314661 | G | 一个 | NM_207370 | p.102t> i | 错过 | 精神分裂症 | DNM:XU_2012 | ||
GPR153 | CHR1 | 6314749 | G | 一个 | NM_207370 | p。(arg73cys) | 非单词snv | 0.011 | 儿童期精神分裂症 | DNM:Ambalavanan_2016 |
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG13071306 | 1 | 6314113 | GPR153 | 1.427E-4 | 0.837 | 0.031 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GPR153_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向D | 38 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
白色神经母细胞瘤,有1P36.3缺失 | 21 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Okawa神经母细胞瘤136 31删除 | 22 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应480 MCF10A | 43 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bernard PPAPDC1B目标DN | 58 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |