概括
基因 387509
象征 GPR153
同义词 pgr1
描述 G蛋白偶联受体153
参考 MIM:614269|HGNC:HGNC:23618|Ensembl:ENSG00000158292|HPRD:13600|Vega:Otthumg00000001272
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p36.31
Pascal P值 0.554
胎儿β 0.52
DMG 1(#研究)
主持人 皮质
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
DNM:Ambalavanan_2016 整个外显子组测序 该数据集包括在17个cos概率中检测到的20个从头突变。
DNM:XU_2012 整个外显子组测序分析 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
GPR153 CHR1 6314661 G 一个 NM_207370 p.102t> i 错过 精神分裂症 DNM:XU_2012
GPR153 CHR1 6314749 G 一个 NM_207370 p。(arg73cys) 非单词snv 0.011 儿童期精神分裂症 DNM:Ambalavanan_2016

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG13071306 1 6314113 GPR153 1.427E-4 0.837 0.031 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向D 38 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
白色神经母细胞瘤,有1P36.3缺失 21 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Okawa神经母细胞瘤136 31删除 22 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应480 MCF10A 43 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bernard PPAPDC1B目标DN 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因