基因页面:HES5
总结吗?
GeneID | 388585年 |
象征 | HES5 |
同义词 | bHLHb38 |
描述 | 他的家人bHLH转录因子5 |
参考 | MIM: 607348|HGNC: HGNC: 19764|运用:ENSG00000197921|HPRD: 16240|织女:OTTHUMG00000000793 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 1 p36.32 |
帕斯卡假定值 | 0.117 |
胎儿β | 0.484 |
eGene | 元 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:3 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HES5_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003677 | DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0030528 | 转录监管机构活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0042668 | 听觉受体细胞命运的决心 | 国际能源机构 | 神经元(术语层面:13) | - - - - - - |
去:0045665 | 负调节神经元分化 | 国际能源机构 | 神经元(词级:10) | - - - - - - |
去:0007399 | 神经系统发育 | 国际能源机构 | 神经突(术语层面:5) | - - - - - - |
去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0007155 | 细胞粘附 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0048469 | 细胞成熟 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0007275 | 多细胞有机体的发展 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0030154 | 细胞分化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0042491 | 听觉受体细胞分化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG NOTCH信号通路 | 47 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID CDC42通路 | 70年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME NOTCH1胞内域调节转录 | 46 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由NOTCH1 REACTOME信号 | 70年 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME信号通过切口 | 103年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GUENTHER增长球形VS附着 | 21 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 | 882年 | 572年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
詹多发性骨髓瘤磅了 | 48 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
麦克朗CREB1 DN的目标 | 57 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米利伪足趋触性了 | 518年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 | 435年 | 318年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHYLA CBFA2T3目标了 | 387年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 224 | 267年 | 273年 | m8 | hsa - mir - 224 | CAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUA |
mir - 376 | 300年 | 306年 | m8 | hsa - mir - 376 a | AUCAUAGAGGAAAAUCCACGU |
hsa - mir - 376 b | AUCAUAGAGGAAAAUCCAUGUU | ||||
mir - 455 | 412年 | 418年 | m8 | hsa - mir - 455 | UAUGUGCCUUUGGACUACAUCG |