基因页面:SLC6A17

总结吗?
GeneID 388662年
象征 SLC6A17
同义词 MRT48 | NTT4
描述 溶质载体家庭6成员17
参考 MIM: 610299|HGNC: HGNC: 31399|运用:ENSG00000197106|HPRD: 18061|织女:OTTHUMG00000011761
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 1 p13.3
帕斯卡假定值 0.221
这样假定值 0.015
胎儿β -3.026
DMG 1(#研究)
支持 神经递质代谢
CompositeSet
达内尔FMRP目标

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 1
认为:Fromer_2014 全外显子组测序分析 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。
GSMA_I 基因组扫描分析 Psr: 0.0235
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:2

部分即遗传学和表观遗传学注释

@认为表

基因 染色体 位置 裁判 Alt 成绩单 AA变化 突变类型 筛选 CG46 特征 研究
SLC6A17 chr1 110719326 G 一个 NM_001010898 p.277A > T 错义 精神分裂症 认为:Fromer_2014

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg08535374 1 110679730 SLC6A17 6.65平台以及 -0.034 9.63 e - DMG: Jaffe_2016


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005328 神经递质:钠同向转运活动 国际能源机构 神经递质(术语层面:9) - - - - - -
去:0015293 同向转运活动 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006836 神经递质运输 国际能源机构 神经元,神经递质(术语层面:5) - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0016020 膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0005887 不可或缺的质膜 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 1069年 729年 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳人大HCP H3K4ME2和H3K27ME3 349年 234年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 435年 318年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森人大HCP H3K27ME3 341年 243年 所有SZGR 2.0基因通路
马顿斯维甲酸反应了 857年 456年 所有SZGR 2.0基因通路