基因页:KRT83
概括?
基因 | 3889 |
象征 | KRT83 |
同义词 | HB3 | HB-3 | KRTHB3 |
描述 | 角蛋白83 |
参考 | MIM:602765|HGNC:HGNC:6460|ENSEMBL:ENSG00000170523|HPRD:09097|Vega:Otthumg00000169632 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12Q13 |
Pascal P值 | 0.027 |
胎儿β | -0.584 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 皮质 额叶皮质BA9 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS182106839 | 12 | 52698045 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 2.183E-6 | 0.02 | 17137 | gtex_brain_ba24 |
RS2857673 | 12 | 52707973 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.525e-7 | 0.02 | 7209 | gtex_brain_ba24 |
RS11285858 | 12 | 52708090 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.524e-7 | 0.02 | 7092 | gtex_brain_ba24 |
RS2852469 | 12 | 52709429 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.522e-7 | 0.02 | 5753 | gtex_brain_ba24 |
RS2852468 | 12 | 52709880 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.512E-7 | 0.02 | 5302 | gtex_brain_ba24 |
RS2248473 | 12 | 52709883 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.512E-7 | 0.02 | 5299 | gtex_brain_ba24 |
RS11611330 | 12 | 52710037 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.522e-7 | 0.02 | 5145 | gtex_brain_ba24 |
RS56118466 | 12 | 52710102 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.522e-7 | 0.02 | 5080 | gtex_brain_ba24 |
RS55722266 | 12 | 52710198 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.522e-7 | 0.02 | 4984 | gtex_brain_ba24 |
RS2270267 | 12 | 52710246 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.522e-7 | 0.02 | 4936 | gtex_brain_ba24 |
RS2257286 | 12 | 52710309 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.522e-7 | 0.02 | 4873 | gtex_brain_ba24 |
RS2857669 | 12 | 52710715 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.522e-7 | 0.02 | 4467 | gtex_brain_ba24 |
RS2852464 | 12 | 52710721 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 2.334E-6 | 0.02 | 4461 | gtex_brain_ba24 |
RS2852463 | 12 | 52710897 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.513E-7 | 0.02 | 4285 | gtex_brain_ba24 |
RS2857668 | 12 | 52710898 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.522e-7 | 0.02 | 4284 | gtex_brain_ba24 |
RS2852462 | 12 | 52710913 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.522e-7 | 0.02 | 4269 | gtex_brain_ba24 |
RS2852460 | 12 | 52711416 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.522e-7 | 0.02 | 3766 | gtex_brain_ba24 |
RS2857667 | 12 | 52711549 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 1.529E-6 | 0.02 | 3633 | gtex_brain_ba24 |
RS2857666 | 12 | 52711624 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.61E-7 | 0.02 | 3558 | gtex_brain_ba24 |
RS2852459 | 12 | 52711776 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 7.687E-7 | 0.02 | 3406 | gtex_brain_ba24 |
RS2852458 | 12 | 52712249 | KRT83 | ENSG00000170523.3 | 8.306E-7 | 0.02 | 2933 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FAM43B | 0.74 | 0.78 |
KIF17 | 0.72 | 0.78 |
阿尔 | 0.72 | 0.78 |
cacna2d3 | 0.71 | 0.69 |
myh7 | 0.71 | 0.73 |
GLT1D1 | 0.69 | 0.79 |
Brunol4 | 0.69 | 0.72 |
3月11日 | 0.69 | 0.73 |
fut1 | 0.68 | 0.65 |
CDH8 | 0.68 | 0.77 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Neurod6 | -0.32 | -0.06 |
SLA | -0.32 | -0.00 |
DAB1 | -0.31 | 0.01 |
Dact1 | -0.31 | 0.05 |
AF347015.21 | -0.31 | -0.11 |
FAT4 | -0.31 | -0.02 |
TMEM108 | -0.30 | -0.04 |
Neurod2 | -0.30 | -0.03 |
Scube1 | -0.30 | -0.17 |
klhl1 | -0.30 | 0.03 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |