概括
基因 3889
象征 KRT83
同义词 HB3 | HB-3 | KRTHB3
描述 角蛋白83
参考 MIM:602765|HGNC:HGNC:6460|ENSEMBL:ENSG00000170523|HPRD:09097|Vega:Otthumg00000169632
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q13
Pascal P值 0.027
胎儿β -0.584
主持人 前扣带回皮层BA24
皮质
额叶皮质BA9

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS182106839 12 52698045 KRT83 ENSG00000170523.3 2.183E-6 0.02 17137 gtex_brain_ba24
RS2857673 12 52707973 KRT83 ENSG00000170523.3 7.525e-7 0.02 7209 gtex_brain_ba24
RS11285858 12 52708090 KRT83 ENSG00000170523.3 7.524e-7 0.02 7092 gtex_brain_ba24
RS2852469 12 52709429 KRT83 ENSG00000170523.3 7.522e-7 0.02 5753 gtex_brain_ba24
RS2852468 12 52709880 KRT83 ENSG00000170523.3 7.512E-7 0.02 5302 gtex_brain_ba24
RS2248473 12 52709883 KRT83 ENSG00000170523.3 7.512E-7 0.02 5299 gtex_brain_ba24
RS11611330 12 52710037 KRT83 ENSG00000170523.3 7.522e-7 0.02 5145 gtex_brain_ba24
RS56118466 12 52710102 KRT83 ENSG00000170523.3 7.522e-7 0.02 5080 gtex_brain_ba24
RS55722266 12 52710198 KRT83 ENSG00000170523.3 7.522e-7 0.02 4984 gtex_brain_ba24
RS2270267 12 52710246 KRT83 ENSG00000170523.3 7.522e-7 0.02 4936 gtex_brain_ba24
RS2257286 12 52710309 KRT83 ENSG00000170523.3 7.522e-7 0.02 4873 gtex_brain_ba24
RS2857669 12 52710715 KRT83 ENSG00000170523.3 7.522e-7 0.02 4467 gtex_brain_ba24
RS2852464 12 52710721 KRT83 ENSG00000170523.3 2.334E-6 0.02 4461 gtex_brain_ba24
RS2852463 12 52710897 KRT83 ENSG00000170523.3 7.513E-7 0.02 4285 gtex_brain_ba24
RS2857668 12 52710898 KRT83 ENSG00000170523.3 7.522e-7 0.02 4284 gtex_brain_ba24
RS2852462 12 52710913 KRT83 ENSG00000170523.3 7.522e-7 0.02 4269 gtex_brain_ba24
RS2852460 12 52711416 KRT83 ENSG00000170523.3 7.522e-7 0.02 3766 gtex_brain_ba24
RS2857667 12 52711549 KRT83 ENSG00000170523.3 1.529E-6 0.02 3633 gtex_brain_ba24
RS2857666 12 52711624 KRT83 ENSG00000170523.3 7.61E-7 0.02 3558 gtex_brain_ba24
RS2852459 12 52711776 KRT83 ENSG00000170523.3 7.687E-7 0.02 3406 gtex_brain_ba24
RS2852458 12 52712249 KRT83 ENSG00000170523.3 8.306E-7 0.02 2933 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FAM43B 0.74 0.78
KIF17 0.72 0.78
阿尔 0.72 0.78
cacna2d3 0.71 0.69
myh7 0.71 0.73
GLT1D1 0.69 0.79
Brunol4 0.69 0.72
3月11日 0.69 0.73
fut1 0.68 0.65
CDH8 0.68 0.77
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Neurod6 -0.32 -0.06
SLA -0.32 -0.00
DAB1 -0.31 0.01
Dact1 -0.31 0.05
AF347015.21 -0.31 -0.11
FAT4 -0.31 -0.02
TMEM108 -0.30 -0.04
Neurod2 -0.30 -0.03
Scube1 -0.30 -0.17
klhl1 -0.30 0.03

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因