基因页:KRT86
概括?
基因 | 3892 |
象征 | KRT86 |
同义词 | HB6 | HB1 | K86 | KRTHB1 | KRTHB6 | MNX |
描述 | 角蛋白86 |
参考 | MIM:601928|HGNC:HGNC:6463|ENSEMBL:ENSG00000170442|HPRD:03567|Vega:Otthumg00000184153 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12Q13 |
Pascal P值 | 0.034 |
胎儿β | -0.183 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG03675739 | 12 | 52702559 | KRT86 | 1.96E-10 | -0.015 | 5.52E-7 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KRT86_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
家长MTOR信号传导DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM对TSA和Decitabine的反应 | 129 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 | 205 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合粒细胞DN的TONKS目标 | 17 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14靶向 | 266 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
huper乳房基础与腔内DN | 59 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼(Hoffmann | 75 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zembutsu对甲氨蝶呤的敏感性 | 18 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2同工4的PEDERSEN转移4 | 110 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |