基因页面:C6orf222
总结吗?
| GeneID | 389384年 |
| 象征 | C6orf222 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 222年6号染色体开放阅读框 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 33769|运用:ENSG00000189325|HPRD: 16824|织女:OTTHUMG00000014591 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 p21.31 |
| 帕斯卡假定值 | 0.184 |
| 胎儿β | -0.653 |
| 支持 | CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 | |
| GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.04433 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C6orf222 | chr6 | 36294377 | C | T | NM_001010903 | p.316V >我 | 错义 | 精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 伊万诺娃造血干细胞和祖 | 681年 | 420年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应通过TP53 D组 | 280年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FEVR CTNNB1目标了 | 682年 | 433年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 338 | 1532年 | 1538年 | m8 | hsa - mir - 338大脑 | UCCAGCAUCAGUGAUUUUGUUGA |
| mir - 378 | 1454年 | 1461年 | 1、m8 | hsa - mir - 378 | CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU |