概括
基因 3895
象征 KTN1
同义词 CG1 | KNT | MU-RMS-40.19
描述 动力素1
参考 MIM:600381|HGNC:HGNC:6467|Ensembl:ENSG00000126777|HPRD:02661|Vega:Otthumg00000140312
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q22.1
Pascal P值 0.07
Sherlock P值 0.967
胎儿beta -0.692
耶和华 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 细胞内贩运
G2CDB.HUMANPSD
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
PMID:COOCCUR 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 耶和华 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS946067 CHR14 55932549 KTN1 3895 0.11 顺式
RS11158041 CHR14 55934219 KTN1 3895 0.01 顺式
RS11158043 CHR14 55934726 KTN1 3895 0.03 顺式
RS3742571 CHR14 56016703 KTN1 3895 0.01 顺式
RS10142497 CHR14 56047947 KTN1 3895 1.738E-5 顺式
RS10137340 CHR14 56050988 KTN1 3895 7.702E-6 顺式
RS17683656 CHR14 56053360 KTN1 3895 3.871E-4 顺式
RS8017891 CHR14 56172966 KTN1 3895 4.402E-5 顺式
RS17832389 CHR14 56185835 KTN1 3895 1.005E-4 顺式
RS10142497 CHR14 56047947 KTN1 3895 0 反式
RS10137340 CHR14 56050988 KTN1 3895 0 反式
RS17683656 CHR14 56053360 KTN1 3895 0.03 反式
RS8017891 CHR14 56172966 KTN1 3895 0.01 反式
RS17832389 CHR14 56185835 KTN1 3895 0.01 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共同表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RNF13 0.95 0.93
ABCA8 0.94 0.86
安尔 0.94 0.77
Lipa 0.94 0.94
PRRG1 0.94 0.87
Edil3 0.93 0.87
CDH19 0.93 0.81
UGT8 0.93 0.87
PLD1 0.93 0.84
endod1 0.93 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TBC1D10A -0.52 -0.47
Bcl7c -0.50 -0.66
SH3BP2 -0.49 -0.63
SH2B2 -0.49 -0.64
CCDC28B -0.48 -0.64
NR2C2AP -0.48 -0.52
plekho1 -0.48 -0.53
MMP25 -0.47 -0.52
KIAA1949 -0.47 -0.46
traf4 -0.47 -0.58

V.途径注释

路径名 路径大小 #SZGR 2.0途径中的基因 信息
迪亚兹慢性巨型性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola sezary综合征 98 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola真菌病FUNGOIDES CD4 DN 116 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan青春期乳房5 6WK 116 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hamai凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时 176 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB目标 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU CREBBP目标 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质癌与腺瘤DN 24 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Greshock Cancer Copy Number 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shaffer IRF4活化B淋巴细胞中的靶标 81 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常衰老 93 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因