基因页:KTN1
概括?
基因 | 3895 |
象征 | KTN1 |
同义词 | CG1 | KNT | MU-RMS-40.19 |
描述 | 动力素1 |
参考 | MIM:600381|HGNC:HGNC:6467|Ensembl:ENSG00000126777|HPRD:02661|Vega:Otthumg00000140312 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q22.1 |
Pascal P值 | 0.07 |
Sherlock P值 | 0.967 |
胎儿beta | -0.692 |
耶和华 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | 细胞内贩运 G2CDB.HUMANPSD G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID:COOCCUR | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS946067 | CHR14 | 55932549 | KTN1 | 3895 | 0.11 | 顺式 | ||
RS11158041 | CHR14 | 55934219 | KTN1 | 3895 | 0.01 | 顺式 | ||
RS11158043 | CHR14 | 55934726 | KTN1 | 3895 | 0.03 | 顺式 | ||
RS3742571 | CHR14 | 56016703 | KTN1 | 3895 | 0.01 | 顺式 | ||
RS10142497 | CHR14 | 56047947 | KTN1 | 3895 | 1.738E-5 | 顺式 | ||
RS10137340 | CHR14 | 56050988 | KTN1 | 3895 | 7.702E-6 | 顺式 | ||
RS17683656 | CHR14 | 56053360 | KTN1 | 3895 | 3.871E-4 | 顺式 | ||
RS8017891 | CHR14 | 56172966 | KTN1 | 3895 | 4.402E-5 | 顺式 | ||
RS17832389 | CHR14 | 56185835 | KTN1 | 3895 | 1.005E-4 | 顺式 | ||
RS10142497 | CHR14 | 56047947 | KTN1 | 3895 | 0 | 反式 | ||
RS10137340 | CHR14 | 56050988 | KTN1 | 3895 | 0 | 反式 | ||
RS17683656 | CHR14 | 56053360 | KTN1 | 3895 | 0.03 | 反式 | ||
RS8017891 | CHR14 | 56172966 | KTN1 | 3895 | 0.01 | 反式 | ||
RS17832389 | CHR14 | 56185835 | KTN1 | 3895 | 0.01 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KTN1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共同表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RNF13 | 0.95 | 0.93 |
ABCA8 | 0.94 | 0.86 |
安尔 | 0.94 | 0.77 |
Lipa | 0.94 | 0.94 |
PRRG1 | 0.94 | 0.87 |
Edil3 | 0.93 | 0.87 |
CDH19 | 0.93 | 0.81 |
UGT8 | 0.93 | 0.87 |
PLD1 | 0.93 | 0.84 |
endod1 | 0.93 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TBC1D10A | -0.52 | -0.47 |
Bcl7c | -0.50 | -0.66 |
SH3BP2 | -0.49 | -0.63 |
SH2B2 | -0.49 | -0.64 |
CCDC28B | -0.48 | -0.64 |
NR2C2AP | -0.48 | -0.52 |
plekho1 | -0.48 | -0.53 |
MMP25 | -0.47 | -0.52 |
KIAA1949 | -0.47 | -0.46 |
traf4 | -0.47 | -0.58 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
迪亚兹慢性巨型性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 DN | 281 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hahtola sezary综合征 | 98 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hahtola真菌病FUNGOIDES CD4 DN | 116 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan青春期乳房5 6WK | 116 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hamai凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时 | 176 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU CREBBP目标 | 26 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西部肾上腺皮质癌与腺瘤DN | 24 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Greshock Cancer Copy Number | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shaffer IRF4活化B淋巴细胞中的靶标 | 81 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng Werner综合征和正常衰老 | 93 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |