概括
基因 3899
象征 AFF3
同义词 laf4 | mllt2 like
描述 AF4/FMR2家庭成员3
参考 MIM:601464|HGNC:HGNC:6473|ENSEMBL:ENSG00000144218|HPRD:03272|Vega:Otthumg00000153011
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2Q11.2-Q12
Pascal P值 0.028
胎儿β 1.784
DMG 1(#研究)
主持人 尾状基底神经节
小脑
皮质
额叶皮质BA9
下丘脑
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 3
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0004

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG11428546 2 100723110 AFF3 1.227E-4 0.533 0.03 DMG:Wockner_2014
CG25350306 2 100190218 AFF3 3.266E-4 0.54 0.04 DMG:Wockner_2014
CG11577355 2 100722474 AFF3 5.69E-4 0.318 0.049 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0006350 转录 IEA -
去:0007275 多细胞生物发育 塔斯 8555498
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 塔斯 8555498

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 194 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 175 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向 238 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应FIMA DN 284 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向DN 90 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN 185 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低 162 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高DN 180 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌DN 181 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche乳头状瘤进度风险 74 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高与低DN 32 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发和癌症Box1 DN 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 165 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
格雷希克癌症复制号码 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D 139 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zembutsu对Nimustine的敏感性 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 4074 4080 1a HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-129-5p 3964 3970 1a HSA-MIR-129 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
mir-134 4065 4071 M8 HSA-MIR-134 ugugacuggugaccagaggg
mir-138 4069 4075 M8 HSA-MIR-138 Agcugguuguguugaauc
mir-145 3519 3525 1a HSA-MIR-145 guccaguuucccaggaaucccuu
MiR-200BC/429 496 503 1A,M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-224 4101 4108 1A,M8 HSA-MIR-224 caagucacuaguguguccuuua
mir-486 4086 4093 1A,M8 HSA-MIR-486 uccuguacugagcugcccccgag
mir-493-5p 4084 4090 M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu