基因页：LAMA2
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| 基因ID | 3908 |
| Symbol | LAMA2 |
| 同义词 | LAMM |
| 描述 | 层粘连蛋白亚基2 |
| 参考 | MIM：156225|HGNC：HGNC：6482|Ensembl：ENSG00000196569|HPRD：01125|Vega：Otthumg0000000015545 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6Q22-Q23 |
| Pascal P值 | 0.075 |
| Sherlock P值 | 0.216 |
| TADA P值 | 1.98E-6 |
| 胎儿β | -0.659 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 元 |
| 支持 | CompositeSet |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| DNM：Gulsuner_2013 | 整个外显子组测序分析 | 155 DNM通过外显子组对精神分裂症个体及其父母的三重奏测序确定。 | |
| DNM：XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中，通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 2 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | Sift | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LAMA2 | CHR6 | 129835668..129835675 | GAAGCCCA | G | NM_000426 NM_001079823 |
。 。 |
frameshift frameshift |
Schizophrenia | DNM：XU_2012 | ||
| LAMA2 | CHR6 | 129670483 | C | t | NM_000426 NM_001079823 |
p.1493r> c p.1493r> c |
错义 错义 |
Schizophrenia | DNM：Gulsuner_2013 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG19358568 | 6 | 129614126 | LAMA2 | 2.731E-4 | 0.379 | 0.038 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005102 | 受体结合 | IEA | 神经递质（GO期限：4） | - |
| 去：0005198 | 结构分子活性 | 塔斯 | 2185464 | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0032224 | positive regulation of synaptic transmission, cholinergic | IEA | 神经元，胆碱能，突触，神经递质（GO期限：10） | - |
| 去：0007517 | 肌肉发育 | 塔斯 | 7550355 | |
| 去：0030155 | regulation of cell adhesion | IEA | - | |
| 走:0030334 | 细胞迁移的调节 | IEA | - | |
| GO：0045995 | 胚胎发育的调节 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
| 去：0005604 | 地下膜 | IEA | - | |
| 去：0005605 | 基底薄片 | IEA | - | |
| 去：0005606 | laminin-1 complex | IEA | - | |
| GO：0042383 | 肌膜 | IEA | - |