概括
基因 390916
象征 NUDT19
同义词 RP2
描述 NUDIX水解酶19
参考 HGNC:HGNC:32036|ENSEMBL:ENSG00000213965|Vega:Otthumg00000180228
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.11
Pascal P值 0.028
主持人 前扣带回皮层BA24
皮质
额叶皮质BA9

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12972109 19 33171346 NUDT19 ENSG00000213965.3 9.587E-8 0.01 -11521 gtex_brain_ba24
RS11878434 19 33175938 NUDT19 ENSG00000213965.3 3.763E-7 0.01 -6929 gtex_brain_ba24
RS71351189 19 33176508 NUDT19 ENSG00000213965.3 5.748e-7 0.01 -6359 gtex_brain_ba24
RS371537893 19 33179574 NUDT19 ENSG00000213965.3 5.164e-7 0.01 -3293 gtex_brain_ba24
RS8104531 19 33180434 NUDT19 ENSG00000213965.3 4.93E-7 0.01 -2433 gtex_brain_ba24
RS3892630 19 33181484 NUDT19 ENSG00000213965.3 5.91E-7 0.01 -1383 gtex_brain_ba24
RS80137870 19 33182750 NUDT19 ENSG00000213965.3 1.881E-6 0.01 -117 gtex_brain_ba24
RS10413282 19 33182751 NUDT19 ENSG00000213965.3 1.851E-6 0.01 -116 gtex_brain_ba24
RS8108621 19 33183291 NUDT19 ENSG00000213965.3 5.948e-7 0.01 424 gtex_brain_ba24
RS8109823 19 33183316 NUDT19 ENSG00000213965.3 5.948e-7 0.01 449 gtex_brain_ba24
RS6510277 19 33183669 NUDT19 ENSG00000213965.3 5.948e-7 0.01 802 gtex_brain_ba24
RS12611419 19 33184369 NUDT19 ENSG00000213965.3 5.924e-7 0.01 1502 gtex_brain_ba24
RS12609866 19 33184412 NUDT19 ENSG00000213965.3 5.953E-7 0.01 1545年 gtex_brain_ba24
RS8107610 19 33186579 NUDT19 ENSG00000213965.3 5.969E-7 0.01 3712 gtex_brain_ba24
RS35408716 19 33187961 NUDT19 ENSG00000213965.3 5.782E-7 0.01 5094 gtex_brain_ba24
RS66788054 19 33190146 NUDT19 ENSG00000213965.3 6.029E-7 0.01 7279 gtex_brain_ba24
RS8112955 19 33191192 NUDT19 ENSG00000213965.3 6.049E-7 0.01 8325 gtex_brain_ba24
RS2903759 19 33195947 NUDT19 ENSG00000213965.3 6.167E-7 0.01 13080 gtex_brain_ba24
RS1827701 19 33196644 NUDT19 ENSG00000213965.3 6.185E-7 0.01 13777 gtex_brain_ba24
RS12975429 19 33199227 NUDT19 ENSG00000213965.3 6.233E-7 0.01 16360 gtex_brain_ba24
RS34870938 19 33204251 NUDT19 ENSG00000213965.3 7.046e-7 0.01 21384 gtex_brain_ba24
RS34201346 19 33204309 NUDT19 ENSG00000213965.3 7.135E-7 0.01 21442 gtex_brain_ba24
RS1061686 19 33204544 NUDT19 ENSG00000213965.3 7.046e-7 0.01 21677 gtex_brain_ba24
RS11878394 19 33205844 NUDT19 ENSG00000213965.3 1.306E-6 0.01 22977 gtex_brain_ba24
RS1976501 19 33208155 NUDT19 ENSG00000213965.3 8.109E-8 0.01 25288 gtex_brain_ba24
RS7246451 19 33209614 NUDT19 ENSG00000213965.3 7.007E-7 0.01 26747 gtex_brain_ba24
RS12610260 19 33210030 NUDT19 ENSG00000213965.3 6.077E-7 0.01 27163 gtex_brain_ba24
RS1559177 19 33210646 NUDT19 ENSG00000213965.3 6.928e-7 0.01 27779 gtex_brain_ba24
RS114224536 19 33211232 NUDT19 ENSG00000213965.3 2.237E-6 0.01 28365 gtex_brain_ba24
RS71336954 19 33212301 NUDT19 ENSG00000213965.3 5.821E-7 0.01 29434 gtex_brain_ba24
RS12981545 19 33220973 NUDT19 ENSG00000213965.3 6.951E-7 0.01 38106 gtex_brain_ba24
RS35971584 19 33221607 NUDT19 ENSG00000213965.3 7.063E-7 0.01 38740 gtex_brain_ba24
RS12327732 19 33221767 NUDT19 ENSG00000213965.3 6.951E-7 0.01 38900 gtex_brain_ba24
RS35654350 19 33223766 NUDT19 ENSG00000213965.3 6.951E-7 0.01 40899 gtex_brain_ba24
RS28787932 19 33226229 NUDT19 ENSG00000213965.3 9.906E-7 0.01 43362 gtex_brain_ba24
RS34425841 19 33231619 NUDT19 ENSG00000213965.3 1.719E-6 0.01 48752 gtex_brain_ba24
RS7247264 19 33239846 NUDT19 ENSG00000213965.3 7.956E-7 0.01 56979 gtex_brain_ba24
RS34748593 19 33240447 NUDT19 ENSG00000213965.3 7.956E-7 0.01 57580 gtex_brain_ba24
RS7260037 19 33242701 NUDT19 ENSG00000213965.3 1.136E-6 0.01 59834 gtex_brain_ba24
RS7245709 19 33242755 NUDT19 ENSG00000213965.3 1.116E-6 0.01 59888 gtex_brain_ba24
RS10414476 19 33243855 NUDT19 ENSG00000213965.3 1.206E-6 0.01 60988 gtex_brain_ba24
RS71336960 19 33246034 NUDT19 ENSG00000213965.3 1.209E-6 0.01 63167 gtex_brain_ba24
RS12610342 19 33250690 NUDT19 ENSG00000213965.3 1.437E-6 0.01 67823 gtex_brain_ba24
RS11880753 19 33267080 NUDT19 ENSG00000213965.3 2.043E-6 0.01 84213 gtex_brain_ba24
RS12609685 19 33284750 NUDT19 ENSG00000213965.3 2.292E-6 0.01 101883 gtex_brain_ba24
RS7248798 19 33303684 NUDT19 ENSG00000213965.3 9.745e-7 0.01 120817 gtex_brain_ba24
RS397747228 19 33308824 NUDT19 ENSG00000213965.3 6.503E-7 0.01 125957 gtex_brain_ba24
RS12327661 19 33313609 NUDT19 ENSG00000213965.3 6.721E-7 0.01 130742 gtex_brain_ba24
RS2112917 19 33317543 NUDT19 ENSG00000213965.3 9.745e-7 0.01 134676 gtex_brain_ba24
RS2287884 19 33321447 NUDT19 ENSG00000213965.3 6.882e-7 0.01 138580 gtex_brain_ba24
RS10417797 19 33322414 NUDT19 ENSG00000213965.3 9.544e-7 0.01 139547 gtex_brain_ba24
RS35700505 19 33325006 NUDT19 ENSG00000213965.3 6.826E-7 0.01 142139 gtex_brain_ba24
RS2287882 19 33332952 NUDT19 ENSG00000213965.3 6.882e-7 0.01 150085 gtex_brain_ba24
RS2287881 19 33333155 NUDT19 ENSG00000213965.3 9.745e-7 0.01 150288 gtex_brain_ba24
RS35646563 19 33338605 NUDT19 ENSG00000213965.3 6.285E-7 0.01 155738 gtex_brain_ba24
RS62124983 19 33342844 NUDT19 ENSG00000213965.3 1.278E-6 0.01 159977 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg过氧化物酶体 78 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 165 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chesler Brain QTL顺式 75 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戈德拉斯体内平衡增殖 171 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应11 103 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因