基因页:NUDT19
概括?
基因 | 390916 |
象征 | NUDT19 |
同义词 | RP2 |
描述 | NUDIX水解酶19 |
参考 | HGNC:HGNC:32036|ENSEMBL:ENSG00000213965|Vega:Otthumg00000180228 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.11 |
Pascal P值 | 0.028 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 皮质 额叶皮质BA9 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12972109 | 19 | 33171346 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 9.587E-8 | 0.01 | -11521 | gtex_brain_ba24 |
RS11878434 | 19 | 33175938 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 3.763E-7 | 0.01 | -6929 | gtex_brain_ba24 |
RS71351189 | 19 | 33176508 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 5.748e-7 | 0.01 | -6359 | gtex_brain_ba24 |
RS371537893 | 19 | 33179574 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 5.164e-7 | 0.01 | -3293 | gtex_brain_ba24 |
RS8104531 | 19 | 33180434 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 4.93E-7 | 0.01 | -2433 | gtex_brain_ba24 |
RS3892630 | 19 | 33181484 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 5.91E-7 | 0.01 | -1383 | gtex_brain_ba24 |
RS80137870 | 19 | 33182750 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 1.881E-6 | 0.01 | -117 | gtex_brain_ba24 |
RS10413282 | 19 | 33182751 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 1.851E-6 | 0.01 | -116 | gtex_brain_ba24 |
RS8108621 | 19 | 33183291 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 5.948e-7 | 0.01 | 424 | gtex_brain_ba24 |
RS8109823 | 19 | 33183316 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 5.948e-7 | 0.01 | 449 | gtex_brain_ba24 |
RS6510277 | 19 | 33183669 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 5.948e-7 | 0.01 | 802 | gtex_brain_ba24 |
RS12611419 | 19 | 33184369 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 5.924e-7 | 0.01 | 1502 | gtex_brain_ba24 |
RS12609866 | 19 | 33184412 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 5.953E-7 | 0.01 | 1545年 | gtex_brain_ba24 |
RS8107610 | 19 | 33186579 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 5.969E-7 | 0.01 | 3712 | gtex_brain_ba24 |
RS35408716 | 19 | 33187961 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 5.782E-7 | 0.01 | 5094 | gtex_brain_ba24 |
RS66788054 | 19 | 33190146 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 6.029E-7 | 0.01 | 7279 | gtex_brain_ba24 |
RS8112955 | 19 | 33191192 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 6.049E-7 | 0.01 | 8325 | gtex_brain_ba24 |
RS2903759 | 19 | 33195947 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 6.167E-7 | 0.01 | 13080 | gtex_brain_ba24 |
RS1827701 | 19 | 33196644 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 6.185E-7 | 0.01 | 13777 | gtex_brain_ba24 |
RS12975429 | 19 | 33199227 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 6.233E-7 | 0.01 | 16360 | gtex_brain_ba24 |
RS34870938 | 19 | 33204251 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 7.046e-7 | 0.01 | 21384 | gtex_brain_ba24 |
RS34201346 | 19 | 33204309 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 7.135E-7 | 0.01 | 21442 | gtex_brain_ba24 |
RS1061686 | 19 | 33204544 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 7.046e-7 | 0.01 | 21677 | gtex_brain_ba24 |
RS11878394 | 19 | 33205844 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 1.306E-6 | 0.01 | 22977 | gtex_brain_ba24 |
RS1976501 | 19 | 33208155 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 8.109E-8 | 0.01 | 25288 | gtex_brain_ba24 |
RS7246451 | 19 | 33209614 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 7.007E-7 | 0.01 | 26747 | gtex_brain_ba24 |
RS12610260 | 19 | 33210030 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 6.077E-7 | 0.01 | 27163 | gtex_brain_ba24 |
RS1559177 | 19 | 33210646 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 6.928e-7 | 0.01 | 27779 | gtex_brain_ba24 |
RS114224536 | 19 | 33211232 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 2.237E-6 | 0.01 | 28365 | gtex_brain_ba24 |
RS71336954 | 19 | 33212301 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 5.821E-7 | 0.01 | 29434 | gtex_brain_ba24 |
RS12981545 | 19 | 33220973 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 6.951E-7 | 0.01 | 38106 | gtex_brain_ba24 |
RS35971584 | 19 | 33221607 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 7.063E-7 | 0.01 | 38740 | gtex_brain_ba24 |
RS12327732 | 19 | 33221767 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 6.951E-7 | 0.01 | 38900 | gtex_brain_ba24 |
RS35654350 | 19 | 33223766 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 6.951E-7 | 0.01 | 40899 | gtex_brain_ba24 |
RS28787932 | 19 | 33226229 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 9.906E-7 | 0.01 | 43362 | gtex_brain_ba24 |
RS34425841 | 19 | 33231619 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 1.719E-6 | 0.01 | 48752 | gtex_brain_ba24 |
RS7247264 | 19 | 33239846 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 7.956E-7 | 0.01 | 56979 | gtex_brain_ba24 |
RS34748593 | 19 | 33240447 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 7.956E-7 | 0.01 | 57580 | gtex_brain_ba24 |
RS7260037 | 19 | 33242701 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 1.136E-6 | 0.01 | 59834 | gtex_brain_ba24 |
RS7245709 | 19 | 33242755 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 1.116E-6 | 0.01 | 59888 | gtex_brain_ba24 |
RS10414476 | 19 | 33243855 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 1.206E-6 | 0.01 | 60988 | gtex_brain_ba24 |
RS71336960 | 19 | 33246034 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 1.209E-6 | 0.01 | 63167 | gtex_brain_ba24 |
RS12610342 | 19 | 33250690 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 1.437E-6 | 0.01 | 67823 | gtex_brain_ba24 |
RS11880753 | 19 | 33267080 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 2.043E-6 | 0.01 | 84213 | gtex_brain_ba24 |
RS12609685 | 19 | 33284750 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 2.292E-6 | 0.01 | 101883 | gtex_brain_ba24 |
RS7248798 | 19 | 33303684 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 9.745e-7 | 0.01 | 120817 | gtex_brain_ba24 |
RS397747228 | 19 | 33308824 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 6.503E-7 | 0.01 | 125957 | gtex_brain_ba24 |
RS12327661 | 19 | 33313609 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 6.721E-7 | 0.01 | 130742 | gtex_brain_ba24 |
RS2112917 | 19 | 33317543 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 9.745e-7 | 0.01 | 134676 | gtex_brain_ba24 |
RS2287884 | 19 | 33321447 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 6.882e-7 | 0.01 | 138580 | gtex_brain_ba24 |
RS10417797 | 19 | 33322414 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 9.544e-7 | 0.01 | 139547 | gtex_brain_ba24 |
RS35700505 | 19 | 33325006 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 6.826E-7 | 0.01 | 142139 | gtex_brain_ba24 |
RS2287882 | 19 | 33332952 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 6.882e-7 | 0.01 | 150085 | gtex_brain_ba24 |
RS2287881 | 19 | 33333155 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 9.745e-7 | 0.01 | 150288 | gtex_brain_ba24 |
RS35646563 | 19 | 33338605 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 6.285E-7 | 0.01 | 155738 | gtex_brain_ba24 |
RS62124983 | 19 | 33342844 | NUDT19 | ENSG00000213965.3 | 1.278E-6 | 0.01 | 159977 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NUDT19_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg过氧化物酶体 | 78 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 | 165 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chesler Brain QTL顺式 | 75 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
戈德拉斯体内平衡增殖 | 171 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应11 | 103 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |