概括
基因 391
象征 Rhog
同义词 arhg
描述 RAS同源家庭成员G
参考 MIM:179505|HGNC:HGNC:672|ENSEMBL:ENSG00000177105|HPRD:01537|Vega:Otthumg0000000012287
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P15.5-P15.4
Pascal P值 0.332
Sherlock P值 0.041
胎儿β -1.086
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG12991791 11 3863056 Rhog 1.37E-9 -0.02 1.37E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7830259 CHR8 14087643 Rhog 391 0.04 反式
RS6632306 Chrx 35590460 Rhog 391 0.06 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ACAP2 0.87 0.88
LIFR 0.86 0.87
PTAR1 0.86 0.85
DNAJC3 0.85 0.86
PIK3C2A 0.85 0.87
STK38L 0.85 0.84
itgav 0.84 0.83
dpy19l4 0.84 0.85
KIAA1033 0.84 0.82
mkln1 0.84 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AL022328.1 -0.46 -0.47
IL32 -0.45 -0.43
HES4 -0.43 -0.46
MRPL52 -0.42 -0.38
nudt8 -0.41 -0.45
AC016757.1 -0.41 -0.39
AF347015.21 -0.41 -0.30
DPM3 -0.40 -0.43
apoc1 -0.40 -0.33
ST20 -0.40 -0.37

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
Arhgdig Rhogdi-3 RHO GDP解离抑制剂(GDI)伽玛 - HPRD,Biogrid 8939998
DOCK1 DOCK180 |CED5 细胞因子1 - HPRD,Biogrid 12879077
ECT2 FLJ10461 |MGC138291 上皮细胞转化序列2癌基因 - HPRD 12376551
Elmo1 CED-12 |Ced12 |Elmo-1 |KIAA0281 |MGC126406 吞噬和细胞运动1 ELMO1与RHOG相互作用。 绑定 15620647
Elmo2 CED-12 |Ced12 |Elmo-2 |FLJ11656 |KIAA1834 吞噬和细胞运动2 - HPRD 12879077
Elmod2 9830169G11rik |MGC10084 Elmo/Ced-12域,包含2个 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 12879077
IQGAP2 - 含有GTPase激活蛋白2的智商基序2 重构的复合物 Biogrid 12376551
KTN1 CG1 |KIAA0004 |KNT |MGC133337 |MU-RMS-40.19 动力蛋白1(动力素受体) - HPRD,Biogrid 11689693
MAP3K11 MGC17114 |MLK-3 |MLK3 |ptk1 |泉水 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶11 - HPRD,Biogrid 12376551
MCF2L Arhgef14 |DBS |FLJ12122 |KIAA0362 |Ost MCF.2细胞系导出的转化序列样 - HPRD 12376551
PLD1 - 磷脂酶D1,磷脂酰胆碱特异性 - HPRD 12376551
vav2 - VAV 2鸟嘌呤核苷酸交换因子 - HPRD 11909943
vav3 FLJ40431 VAV 3鸟嘌呤核苷酸交换因子 - HPRD,Biogrid 10523675


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID幼稚园 45 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TRKR途径 62 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rho GTPases的Reactome信号传导 113 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPVI介导的激活级联 31 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha1213信号传导事件 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Semaphorin信号中的Reactome SemA4D 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Smaphorin相互作用 68 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SemA4D诱导细胞迁移和生长锥塌陷 27 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板激活信号传导和聚集 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS DN 182 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标12小时DN 209 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马良性皮肤肿瘤向上 18 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马恶性皮肤肿瘤 16 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dirmeier LMP1响应迟到 57 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移DN 261 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath MYC带Ebox的目标 230 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与B淋巴细胞DN 38 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Magrangeas多发性骨髓瘤IgLL与IgLK DN 24 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiba对TSA的反应 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1 C2的反应 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1的早期反应 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee衰老的新皮层 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李小脑老化 84 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ITO PTTG1靶向DN 9 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan早期分化基因dn 42 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤间充质 216 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acosta增殖独立MYC目标DN 116 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huang Gata2靶向 149 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因