基因页:Rhog
概括?
基因 | 391 |
象征 | Rhog |
同义词 | arhg |
描述 | RAS同源家庭成员G |
参考 | MIM:179505|HGNC:HGNC:672|ENSEMBL:ENSG00000177105|HPRD:01537|Vega:Otthumg0000000012287 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P15.5-P15.4 |
Pascal P值 | 0.332 |
Sherlock P值 | 0.041 |
胎儿β | -1.086 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG12991791 | 11 | 3863056 | Rhog | 1.37E-9 | -0.02 | 1.37E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7830259 | CHR8 | 14087643 | Rhog | 391 | 0.04 | 反式 | ||
RS6632306 | Chrx | 35590460 | Rhog | 391 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RHOG_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ACAP2 | 0.87 | 0.88 |
LIFR | 0.86 | 0.87 |
PTAR1 | 0.86 | 0.85 |
DNAJC3 | 0.85 | 0.86 |
PIK3C2A | 0.85 | 0.87 |
STK38L | 0.85 | 0.84 |
itgav | 0.84 | 0.83 |
dpy19l4 | 0.84 | 0.85 |
KIAA1033 | 0.84 | 0.82 |
mkln1 | 0.84 | 0.81 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AL022328.1 | -0.46 | -0.47 |
IL32 | -0.45 | -0.43 |
HES4 | -0.43 | -0.46 |
MRPL52 | -0.42 | -0.38 |
nudt8 | -0.41 | -0.45 |
AC016757.1 | -0.41 | -0.39 |
AF347015.21 | -0.41 | -0.30 |
DPM3 | -0.40 | -0.43 |
apoc1 | -0.40 | -0.33 |
ST20 | -0.40 | -0.37 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
Arhgdig | Rhogdi-3 | RHO GDP解离抑制剂(GDI)伽玛 | - | HPRD,Biogrid | 8939998 |
DOCK1 | DOCK180 |CED5 | 细胞因子1 | - | HPRD,Biogrid | 12879077 |
ECT2 | FLJ10461 |MGC138291 | 上皮细胞转化序列2癌基因 | - | HPRD | 12376551 |
Elmo1 | CED-12 |Ced12 |Elmo-1 |KIAA0281 |MGC126406 | 吞噬和细胞运动1 | ELMO1与RHOG相互作用。 | 绑定 | 15620647 |
Elmo2 | CED-12 |Ced12 |Elmo-2 |FLJ11656 |KIAA1834 | 吞噬和细胞运动2 | - | HPRD | 12879077 |
Elmod2 | 9830169G11rik |MGC10084 | Elmo/Ced-12域,包含2个 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 12879077 |
IQGAP2 | - | 含有GTPase激活蛋白2的智商基序2 | 重构的复合物 | Biogrid | 12376551 |
KTN1 | CG1 |KIAA0004 |KNT |MGC133337 |MU-RMS-40.19 | 动力蛋白1(动力素受体) | - | HPRD,Biogrid | 11689693 |
MAP3K11 | MGC17114 |MLK-3 |MLK3 |ptk1 |泉水 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶11 | - | HPRD,Biogrid | 12376551 |
MCF2L | Arhgef14 |DBS |FLJ12122 |KIAA0362 |Ost | MCF.2细胞系导出的转化序列样 | - | HPRD | 12376551 |
PLD1 | - | 磷脂酶D1,磷脂酰胆碱特异性 | - | HPRD | 12376551 |
vav2 | - | VAV 2鸟嘌呤核苷酸交换因子 | - | HPRD | 11909943 |
vav3 | FLJ40431 | VAV 3鸟嘌呤核苷酸交换因子 | - | HPRD,Biogrid | 10523675 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID幼稚园 | 45 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TRKR途径 | 62 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rho GTPases的Reactome信号传导 | 113 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPVI介导的激活级联 | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha1213信号传导事件 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Semaphorin信号中的Reactome SemA4D | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Smaphorin相互作用 | 68 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SemA4D诱导细胞迁移和生长锥塌陷 | 27 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome血小板激活信号传导和聚集 | 208 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni分子臂与ERMS DN | 182 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1目标12小时DN | 209 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
悍马良性皮肤肿瘤向上 | 18 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
悍马恶性皮肤肿瘤 | 16 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dirmeier LMP1响应迟到 | 57 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移DN | 261 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与B淋巴细胞DN | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Magrangeas多发性骨髓瘤IgLL与IgLK DN | 24 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chiba对TSA的反应 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verrecchia对TGFB1 C2的反应 | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verrecchia对TGFB1的早期反应 | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee衰老的新皮层 | 89 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李小脑老化 | 84 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ITO PTTG1靶向DN | 9 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan早期分化基因dn | 42 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤间充质 | 216 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acosta增殖独立MYC目标DN | 116 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huang Gata2靶向 | 149 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |