基因页：喇嘛5
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| 基因ID | 3911 |
| 象征 | 喇嘛5 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 层粘连蛋白亚基5 |
| 参考 | MIM：601033|HGNC：HGNC：6485|ENSEMBL：ENSG00000130702|HPRD：03020|Vega：Otthumg0000000032908 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 20Q13.2-Q13.3 |
| Pascal P值 | 0.011 |
| Sherlock P值 | 0.77 |
| 胎儿β | -0.273 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG01059881 | 20 | 60927922 | 喇嘛5 | 1.598E-4 | -0.344 | 0.032 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | 喇嘛5 | 3911 | 5.143E-5 | 反式 | ||
| RS3845734 | CHR2 | 171125572 | 喇嘛5 | 3911 | 0.01 | 反式 | ||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | 喇嘛5 | 3911 | 6.154E-4 | 反式 | ||
| rs6574467 | CHR14 | 79179744 | 喇嘛5 | 3911 | 0.09 | 反式 | ||
| RS10146003 | CHR14 | 79191170 | 喇嘛5 | 3911 | 0.09 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | 喇嘛5 | 3911 | 5.398e-12 | 反式 | ||
| RS1041786 | CHR21 | 22617710 | 喇嘛5 | 3911 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ITGB2 | 0.85 | 0.79 |
| NCKAP1L | 0.84 | 0.78 |
| TLR7 | 0.84 | 0.74 |
| laptm5 | 0.83 | 0.76 |
| Cybb | 0.83 | 0.82 |
| CSF1R | 0.82 | 0.77 |
| FCGR3A | 0.82 | 0.76 |
| DOCK2 | 0.82 | 0.76 |
| HCK | 0.81 | 0.70 |
| IRF8 | 0.80 | 0.74 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.18 | -0.26 | -0.25 |
| AF347015.21 | -0.26 | -0.21 |
| EIF4EBP3 | -0.25 | -0.31 |
| AL022328.1 | -0.25 | -0.32 |
| AC098691.2 | -0.24 | -0.24 |
| CXCL14 | -0.24 | -0.20 |
| AC120053.1 | -0.23 | -0.30 |
| RP9P | -0.23 | -0.33 |
| AC010300.1 | -0.23 | -0.23 |
| MT-CO2 | -0.23 | -0.24 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg焦点粘附 | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG ECM受体相互作用 | 84 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 小细胞肺癌 | 84 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Integin1途径 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Integin4途径 | 11 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Syndecan 1途径 | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID A6B1 A6B4整合素途径 | 46 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome整合素细胞表面相互作用 | 79 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HUTTMANN B CLL POOR SURVIVAL UP | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan MLL签名1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan MLL签名2 DN | 281 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dittmer Pthlh靶向 | 112 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1靶向DN | 260 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向DN | 90 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过ELK3 UP总缺氧 | 209 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 仅通过ELK3 DN的缺氧总缺氧 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发12小时 | 116 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌20q12 Q13 Amplicon | 149 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Liver Cancer Myc E2F1 UP | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Liver Cancer Dena Up | 60 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕色髓样细胞发育DN | 129 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Petrova内皮淋巴与血液DN | 162 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nguyen Notch1靶向DN | 86 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML Fab标记 | 191 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤CD1 vs CD2 DN | 52 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血干细胞长期 | 302 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 布朗HCMV感染48小时 | 180 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染18小时 | 178 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU GH1自分泌目标DN | 142 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cheng由雌二醇印记 | 110 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞DN | 145 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VART KSHV感染血管生成标记 | 165 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VART KSHV感染血管生成标记DN | 138 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| woo肝癌复发 | 105 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Karlsson TGFB1靶向DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Tial1目标 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Katsanou Elavl1靶向 | 169 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lim乳腺腔内成熟 | 116 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang EGF间隔DN | 214 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA ECM糖蛋白 | 196 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA核心母质 | 275 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA地下室膜 | 40 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |