基因页：arhgap4
概括？
| 基因 | 393 |
| 象征 | arhgap4 |
| 同义词 | C1 | RGC1 | RHOGAP4 | SRGAP4 | P115 |
| 描述 | Rho GTPase激活蛋白4 |
| 参考 | MIM：300023|HGNC：HGNC：674|Ensembl：ENSG00000089820|HPRD：02063|Vega：Otthumg0000000024226 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | XQ28 |
| Sherlock P值 | 0.275 |
| 胎儿β | -0.371 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 2 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG09229960 | X | 153607856 | arhgap4 | 3.507E-4 | 5.322 | DMG：Vaneijk_2014 | |
| CG18742441 | X | 153657222 | arhgap4 | 6.524E-4 | 5.131 | DMG：Vaneijk_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | arhgap4 | 393 | 1.978E-4 | 反式 | ||
| RS7635430 | CHR3 | 180152035 | arhgap4 | 393 | 0.14 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | arhgap4 | 393 | 6.139E-8 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| DMWD | 0.85 | 0.82 |
| 标记2 | 0.84 | 0.81 |
| CES2 | 0.84 | 0.80 |
| PPP5C | 0.84 | 0.79 |
| ADRBK1 | 0.84 | 0.81 |
| EPN1 | 0.84 | 0.81 |
| RNF187 | 0.83 | 0.82 |
| 9月5日 | 0.83 | 0.79 |
| LDOC1 | 0.83 | 0.82 |
| AP2A2 | 0.83 | 0.80 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.70 | -0.57 |
| MT-CO2 | -0.67 | -0.55 |
| AF347015.31 | -0.66 | -0.55 |
| AF347015.33 | -0.65 | -0.54 |
| AF347015.8 | -0.65 | -0.53 |
| AF347015.2 | -0.64 | -0.51 |
| mt-cyb | -0.63 | -0.52 |
| 鼻孔 | -0.63 | -0.53 |
| AP002478.3 | -0.62 | -0.57 |
| AF347015.27 | -0.60 | -0.53 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Biocarta Rho途径 | 32 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SIG趋化性 | 45 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pid rhoa reg途径 | 46 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rho GTPases的Reactome信号传导 | 113 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Nrage通过JNK发出死亡的信号 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞死亡信号通过Nrage NRIF和NADE传导 | 60 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome P75 NTR受体介导的信号传导 | 81 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G alpha1213信号传导事件 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche皮肤肿瘤启动子 | 142 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险低DN | 165 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险高DN | 180 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| darwiche鳞状细胞癌DN | 181 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ross AML与PML RARA FUSION | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stanelle E2F1目标 | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伽玛辐射8G后的生存率不佳 | 95 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伽玛辐射2G后的生存率不佳 | 171 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Valk AML群集12 | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| woo肝癌复发 | 105 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 | 228 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta EBNA1反相关 | 173 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pedrioli mir31靶向 | 221 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |