基因页面:LCN1
总结吗?
| GeneID | 3933年 |
| 象征 | LCN1 |
| 同义词 | PMFA | TLC | TP | VEGP |
| 描述 | lipocalin 1 |
| 参考 | MIM: 151675|HGNC: HGNC: 6525|运用:ENSG00000160349|HPRD: 01059|织女:OTTHUMG00000020908 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 9 q34 |
| 帕斯卡假定值 | 0.013 |
| eGene | 前扣带皮层BA24 皮质 额叶皮质BA9 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs56024916 | 9 | 138414956 | LCN1 | ENSG00000160349.5 | 4.79214 e-8 | 0.01 | 1672年 | gtex_brain_ba24 |
| rs56239374 | 9 | 138415201 | LCN1 | ENSG00000160349.5 | 4.63254 e-8 | 0.01 | 1917年 | gtex_brain_ba24 |
| rs56120410 | 9 | 138415238 | LCN1 | ENSG00000160349.5 | 9.46796 e - | 0.01 | 1954年 | gtex_brain_ba24 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SAT1 | 0.87 | 0.85 |
| MT1G | 0.85 | 0.78 |
| SLC25A33 | 0.83 | 0.72 |
| SCRG1 | 0.83 | 0.82 |
| MT3 | 0.82 | 0.82 |
| PSMB8 | 0.82 | 0.85 |
| CBR3 | 0.82 | 0.86 |
| RLBP1 | 0.81 | 0.83 |
| TLCD1 | 0.81 | 0.84 |
| MT1F | 0.81 | 0.77 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| USP7 | -0.66 | -0.73 |
| MYO18A | -0.66 | -0.71 |
| ANKRD17 | -0.66 | -0.74 |
| EIF4ENIF1 | -0.65 | -0.74 |
| MCM3AP | -0.65 | -0.74 |
| HNRNPUL2 | -0.65 | -0.68 |
| PDXDC1 | -0.65 | -0.74 |
| ARIH1 | -0.65 | -0.77 |
| NOLC1 | -0.65 | -0.73 |
| HERC1 | -0.65 | -0.75 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 纳德勒高血糖在肥胖 | 58 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿塞维多甲基化在肝癌DN | 940年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |