Summary
基因ID 3952
象征 LEP
同义词 LEPD|OB|OBS
描述 瘦素
参考 MIM:164160|HGNC:HGNC:6553|Ensembl:ENSG00000174697|HPRD:01249|Vega:Otthumg00000157564
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7q31.3
Pascal P值 0.382
胎儿β 0.075
DMG 1(#研究)

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01337813 7 127808512 LEP 1.14e-9 -0.025 1.25E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PTAR1 0.88 0.90
arhgap5 0.86 0.87
itgav 0.86 0.89
PIK3C2A 0.84 0.88
ITGB8 0.84 0.89
dpy19l4 0.82 0.84
Qki 0.81 0.84
ATL3 0.81 0.84
mkln1 0.79 0.82
AP3B1 0.79 0.75
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RP9P -0.33 -0.48
纳米3 -0.33 -0.38
AL022328.1 -0.33 -0.41
HES4 -0.33 -0.40
IL32 -0.32 -0.42
SNHG12 -0.32 -0.44
C9orf142 -0.32 -0.33
ST20 -0.32 -0.40
AC016757.1 -0.30 -0.34
C16orf79 -0.29 -0.33

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005179 激素活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0008083 生长因子活性 IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008206 胆汁酸代谢过程 IEA -
GO:0006112 能源储备代谢过程 塔斯 9537324
去:0006006 glucose metabolic process IEA -
去:0007165 信号转导 IEA -
去:0008203 胆固醇代谢过程 IEA -
去:0008343 成人喂养行为 ISS -
去:0006629 脂质代谢过程 IEA -
去:0042755 饮食行为 IEA -
GO:0019222 代谢过程的调节 IEA -
去:0032099 negative regulation of appetite ISS -
去:0030300 胆固醇吸收的调节 IEA -
GO:0045639 髓样细胞分化的阳性调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005615 细胞外空间 ISS -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 267 161 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kegg jak stat信号通路 155 105 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG脂肪细胞信号传导途径 67 57 All SZGR 2.0 genes in this pathway
生物卡塔尔瘦素途径 11 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID PTP1B途径 52 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID HIF1 TFPathway 66 52 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome发育生物学 396 292 All SZGR 2.0 genes in this pathway
能量代谢的反应组整合 120 84 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome糖尿病途径 133 91 All SZGR 2.0 genes in this pathway
胰岛素分泌的反应组调节 93 65 All SZGR 2.0 genes in this pathway
变形素的反应组合成和脱酰化 16 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome泌尿素合成分泌和失活 22 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome合成分泌和GLP1的失活 19 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
白色脂肪细胞分化的Reactome转录调节 72 53 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 All SZGR 2.0 genes in this pathway
纳德勒肥胖 61 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Affar YY1靶向DN 234 137 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马丁内斯RB1靶向 673 430 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez TP53目标DN 593 372 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMID BREAST CANCER LUMINAL A UP 84 52 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌基础DN 701 446 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Matzuk中央女性生育 29 25 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CADWELL ATG16L1目标了 93 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
冬季缺氧metagene 242 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VART KSHV感染血管生成标记DN 138 92 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP 1305 895 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner NPC ICP,具有H3未甲基化的 24 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Liu Vav3前列腺致癌作用 89 61 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen ES ICP与H3K27me3 42 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马顿人维甲酸的反应 857 456 All SZGR 2.0 genes in this pathway
林乳腺干细胞向上 489 314 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA分泌因素 344 197 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA女性相关 753 411 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA矩阵 1028 559 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-29 1652 1659年 1A,M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu