基因页:LEP
Summary?
基因ID | 3952 |
象征 | LEP |
同义词 | LEPD|OB|OBS |
描述 | 瘦素 |
参考 | MIM:164160|HGNC:HGNC:6553|Ensembl:ENSG00000174697|HPRD:01249|Vega:Otthumg00000157564 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q31.3 |
Pascal P值 | 0.382 |
胎儿β | 0.075 |
DMG | 1(#研究) |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01337813 | 7 | 127808512 | LEP | 1.14e-9 | -0.025 | 1.25E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/LEP_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PTAR1 | 0.88 | 0.90 |
arhgap5 | 0.86 | 0.87 |
itgav | 0.86 | 0.89 |
PIK3C2A | 0.84 | 0.88 |
ITGB8 | 0.84 | 0.89 |
dpy19l4 | 0.82 | 0.84 |
Qki | 0.81 | 0.84 |
ATL3 | 0.81 | 0.84 |
mkln1 | 0.79 | 0.82 |
AP3B1 | 0.79 | 0.75 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RP9P | -0.33 | -0.48 |
纳米3 | -0.33 | -0.38 |
AL022328.1 | -0.33 | -0.41 |
HES4 | -0.33 | -0.40 |
IL32 | -0.32 | -0.42 |
SNHG12 | -0.32 | -0.44 |
C9orf142 | -0.32 | -0.33 |
ST20 | -0.32 | -0.40 |
AC016757.1 | -0.30 | -0.34 |
C16orf79 | -0.29 | -0.33 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005179 | 激素活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0008083 | 生长因子活性 | IEA | - | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008206 | 胆汁酸代谢过程 | IEA | - | |
GO:0006112 | 能源储备代谢过程 | 塔斯 | 9537324 | |
去:0006006 | glucose metabolic process | IEA | - | |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
去:0008203 | 胆固醇代谢过程 | IEA | - | |
去:0008343 | 成人喂养行为 | ISS | - | |
去:0006629 | 脂质代谢过程 | IEA | - | |
去:0042755 | 饮食行为 | IEA | - | |
GO:0019222 | 代谢过程的调节 | IEA | - | |
去:0032099 | negative regulation of appetite | ISS | - | |
去:0030300 | 胆固醇吸收的调节 | IEA | - | |
GO:0045639 | 髓样细胞分化的阳性调节 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005615 | 细胞外空间 | ISS | - |
V.途径注释
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-29 | 1652 | 1659年 | 1A,M8 | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu |