基因页：LEPR

概括?
基因ID 3953
Symbol LEPR
同义词 CD295|LEP-R|LEPRD|OB-R|OBR
描述 leptin receptor
参考 MIM:601007|HGNC:HGNC:6554|Ensembl:ENSG00000116678|HPRD:03001|Vega:OTTHUMG00000009115
基因type protein-coding
地图位置 1p31
Pascal P值 0.181
Fetal beta -0.508
eGene Cerebellum
额叶皮质BA9
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP Genome-wide Association Study GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） Psr: 0.02692
文学 高通量文献搜索 Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs10958892 chr9 10125117 LEPR 3953 0.12 trans
rs10958896 chr9 10126894 LEPR 3953 0.1 trans
rs10958899 chr9 10128700 LEPR 3953 0.15 trans
RS10958907 chr9 10131580 LEPR 3953 0.19 trans
rs6095741 chr20 48666589 LEPR 3953 0.19 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Not available

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
DVL2 0.95 0.90
FANCG 0.94 0.90
CNTROB 0.94 0.94
RCC1 0.93 0.89
UNK 0.93 0.92
plekhg4b 0.92 0.85
MCM7 0.92 0.76
C17orf53 0.92 0.89
芽13 0.92 0.89
XRCC1 0.92 0.94
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
AF347015.31 -0.71 -0.91
AF347015.27 -0.71 -0.90
MT-CO2 -0.70 -0.91
C5orf53 -0.70 -0.76
AF347015.33 -0.69 -0.90
HLA-F -0.69 -0.76
AIFM3 -0.69 -0.76
S100B -0.69 -0.84
MT-CYB -0.68 -0.89
aldoc -0.67 -0.71

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0004896 cytokine receptor activity IEA -
GO:0005515 protein binding IPI 11279102
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006112 energy reserve metabolic process 塔斯 9537324
去：0007166 细胞表面受体连接的信号转导 塔斯 9537324
去：0007275 多细胞生物发育 塔斯 9537324
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005576 extracellular region IEA -
GO:0016021 integral to membrane IEA -
GO:0005886 质膜 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
APOD - apolipoprotein D - HPRD 11344130
CLU AAG4 | APOJ | CLI | KUB1 | MGC24903 | SGP-2 | SGP2 | SP-40 | TRPM-2 | TRPM2 clusterin - HPRD 12824284
DGKZ DAGK5 | DAGK6 | DGK-ZETA | hDGKzeta diacylglycerol kinase, zeta 104kDa - HPRD 11078732
JAK2 JTK10 Janus kinase 2 (a protein tyrosine kinase) - HPRD 8608603
JAK3 jak-3 |jak3_human |jakl |l-jak |ljak Janus激酶3（蛋白质酪氨酸激酶，白细胞） Affinity Capture-Western BioGRID 11585385
LEP FLJ94114 |OB |obs leptin - HPRD 8608603
PIN1 DOD | UBL5 peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 两个杂交 BioGRID 16169070
PTPN11 BPTP3 | CFC | MGC14433 | NS1 | PTP-1D | PTP2C | SH-PTP2 | SH-PTP3 | SHP2 蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体11型 - HPRD 11018044
SNX1 HST17379 |MGC8664 |SNX1A |VPS5 sorting nexin 1 - HPRD，Biogrid 9819414
SNX2 MGC5204 | TRG-9 sorting nexin 2 - HPRD，Biogrid 9819414
SNX4 - sorting nexin 4 - HPRD，Biogrid 9819414
SNX6 MGC3157 | MSTP010 | TFAF2 sorting nexin 6 - HPRD，Biogrid 11279102
SOCS3 atod4 |顺式3 |cish3 |MGC71791 |SOCS-3 |SSI-3 |SSI3 抑制的阶段kine signaling 3 - HPRD，Biogrid 11018044
STAT3 APRF | FLJ20882 | HIES | MGC16063 signal transducer and activator of transcription 3 (acute-phase response factor) - HPRD 8608603


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG CYTOKINE CYTOKINE RECEPTOR INTERACTION 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG NEUROACTIVE LIGAND RECEPTOR INTERACTION 272 195 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG JAK STAT SIGNALING PATHWAY 155 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG脂肪细胞信号传导途径 67 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA LEPTIN PATHWAY 11 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PTP1B PATHWAY 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOURNIER ACINAR DEVELOPMENT EARLY UP 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红细胞侵蚀 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
igarashi atf4靶向dn 90 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARY CD5 TARGETS UP 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG CLIM2 TARGETS UP 269 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML静止与正常静止 87 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAHAM CML DIVIDING VS NORMAL QUIESCENT UP 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAHAM NORMAL QUIESCENT VS NORMAL DIVIDING DN 87 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOZGIT ESR1 TARGETS DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanharanta子宫肌瘤DN 67 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON RESPONSE TO ARSENITE 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM6 46 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 UP 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标1向上 140 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 3 UP 17 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CERVERA SDHB TARGETS 2 114 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER CIPROFIBRATE UP 60 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO HYPOXIA UP 207 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER DENA UP 60 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer E2F1 UP 62 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO HOXA10 TARGETS VIA PROGESTERONE UP 79 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHURINGA STAT5A TARGETS UP 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康（Kang）因tert而永生 89 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML SURVIVAL 129 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VARELA ZMPSTE24 TARGETS UP 40 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CLASPER LYMPHATIC VESSELS DURING METASTASIS UP 20 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lein脉络丛标记 103 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄Foxa2靶向DN 36 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌萧述三腔的DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌腔 84 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER NORMAL LIKE UP 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BONOME OVARIAN CANCER POOR SURVIVAL UP 31 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BONOME OVARIAN CANCER SURVIVAL SUBOPTIMAL DEBULKING 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk中央女性生育 29 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRISHNAN FURIN TARGETS DN 13 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAUCH HEDGEHOG SIGNALING PARACRINE UP 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未经注释 85 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤DN 267 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 1 68 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向DN 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OHGUCHI LIVER HNF4A TARGETS UP 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acosta增殖独立MYC靶向 84 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 2 DN 336 211 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS UP 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SERVITJA LIVER HNF1A TARGETS UP 135 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
MiR-200BC/429 1802 1808 m8 HSA-MIR-200B UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu