基因页:LETM1
概括?
基因 | 3954 |
象征 | LETM1 |
同义词 | - |
描述 | 亮氨酸拉链和EF手含有跨膜蛋白1 |
参考 | MIM:604407|HGNC:HGNC:6556|ENSEMBL:ENSG00000168924|HPRD:05101|Vega:Otthumg00000121149 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4P16.3 |
Pascal P值 | 0.574 |
Sherlock P值 | 0.74 |
胎儿β | 0.212 |
DMG | 2(#研究) |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_MITOCHONDRIA Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG03008204 | 4 | 1828697 | LETM1 | 1.362E-4 | 0.662 | 0.031 | DMG:Wockner_2014 |
CG04794887 | 4 | 1858231 | LETM1 | -0.074 | 0.52 | DMG:Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schuetz乳腺癌导管侵入性DN | 84 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gal白血病干细胞DN | 244 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏2 DN | 51 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应240 HELA | 60 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MANALO缺氧DN | 289 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Okumura炎症反应LPS | 183 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sarrio上皮间质转变DN | 154 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iwanaga癌变由KRAS DN | 120 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee早期T淋巴细胞向上 | 107 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 | 204 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |