基因页：lfng
概括？
| 基因 | 3955 |
| 象征 | lfng |
| 同义词 | SCDO3 |
| 描述 | LFNG O羟基肽3β-N-乙酰葡萄糖氨基转移酶 |
| 参考 | MIM：602576|HGNC：HGNC：6560|Ensembl：ENSG00000106003|Vega：Otthumg00000152043 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7p22.2 |
| Pascal P值 | 0.056 |
| 胎儿β | -0.016 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG15653194 | 7 | 2559473 | lfng | 2.8e-5 | -0.324 | 0.018 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GCN1L1 | 0.96 | 0.96 |
| PFA | 0.96 | 0.96 |
| WHSC1 | 0.95 | 0.96 |
| sart3 | 0.95 | 0.96 |
| SNRNP200 | 0.95 | 0.95 |
| CNOT1 | 0.95 | 0.96 |
| KDM3B | 0.95 | 0.95 |
| crkrs | 0.95 | 0.95 |
| DNMT1 | 0.95 | 0.95 |
| ZXDC | 0.94 | 0.95 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.78 | -0.92 |
| MT-CO2 | -0.76 | -0.91 |
| AF347015.27 | -0.75 | -0.89 |
| AF347015.33 | -0.74 | -0.87 |
| mt-cyb | -0.74 | -0.88 |
| ifi27 | -0.73 | -0.86 |
| AF347015.8 | -0.73 | -0.89 |
| FXYD1 | -0.73 | -0.86 |
| C5orf53 | -0.72 | -0.77 |
| higd1b | -0.72 | -0.87 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg Notch信号通路 | 47 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Pre Notch表达和处理 | 44 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Golgi中的Reactome Pre Notch处理 | 16 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Notch的Reactome信号传导 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 | 205 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 | 170 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shin B细胞淋巴瘤簇3 | 28 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张对IKK抑制剂和TNF DN的响应 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌7p22 Amplicon | 38 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Maclachlan BRCA1靶向 | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性5 | 482 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC MYC目标 | 217 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标需要MYC | 210 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| OSADA ASCL1靶向 | 46 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Matzuk排卵 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿隆索转移DN | 26 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标36hr | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn | 88 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verhaak胶质母细胞瘤经典 | 162 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BMI1和PCGF2的Wiederschain目标 | 57 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma ns | 162 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |